Guide pour l'analyse des données du REMO à I' aide d'un SIG

TDR/TDF/COMDT/98.3 Original: anglais ra Guide pour ltanalyse des données du REMO à Itaide dtun SIG Programme spécial PNUDÆanque mondiale/OMS de recherche et de formation concernant les maladies tropicales (TDR) Programme conjoint OMSruNICEF sur la gestion des données et la cartographie en santé publique (HealthMap) Programme africain de lutte contre l'onchocercose (APOC) lil i:' tl ,i)l T. t. x ,l {_, l; 0 TDR/TDF/COMDT/98.3 Original: Anglais Guide porrr ltanalyse des données du REMO à ltaide dtun SIG Table des matières 2. TRAVAIL NAIRE 4 2.1 2.1.1 2.1.2 Travail préIiminaire mr papier Utilisation de cartes papier et liwe de bord Pre,parer les formulaires d'enquêtes sur papier et noter les données disponibles Travail préliminaire à l'ordinateur Entrer les donnees initiales issues des formulaires Numériser les zones, d'apres le kavail sur papier Utilisaüon de fonds de carte Digitaliser le zsnage Examen de l'adequation de la couverture en échantillons 4 4 4 5 5 5 6 6 6 2.2 2.2.1 2.2.2 2.2.2.1 2.2.2.2 2.2.3 4. ANALYSE DU REMO ÂVEC I 4.1 4.1.1 4.1.2 4.3 4.3 | 4.2 4.2.t 4.2 | .l 4.2.r.2 4.2.2 4.2.3 Données d'enquête épidémiologique Données de l'évaluation epidémiologique rapide (REA) Conversion et addition d'autres donnees epidémiologiques Identification des zones où un traitement à grande échelle est recommandé Subdivision des bassins selon la stratégie de lraitement Tlpes de zones par stratégie de traitement Creation de couches pour les trois ÿpes de zones par stmtégre de traitement Exemples de l'identificaüon des zones p.lr stratégie de traitement Creation de cartes épidémiologiques montrart les zones oû te TIDC est indrqué Estimation du nombre de üllages et de la population totale nécessitant le TIDC L'utilisation des bases de donnees sur la populaüon ou les villages en provenance d'autres sources L'utrlisatron des donnees de populatron selon les divisions admirustratives du pays 5. DERNIÈRES R RQUES 9 9 9 10 ll ll t2 12 t7 18 4.3.2 l8 l9 21 6. ANNEXES 22 6.1 Structure de la base de données du REMO 22 6.2 Guide pas-à-pas pour la tréation d'un nouveau fichier ge+"{ile pour Ie zonage et la création de nouvelles couches 21 6.3 Création et affichage des diagrammes en secteurs de la prér'alcncr dans Atlas*GIS. 30 Estimation du nombre dc villages et dc la population totale necessitant le TIDC J2 Utihsat-ron des bascs de données sur la populatiou ou lcs vtllages en pro\,Çnancc d';urlres so*rccs f2 Ulrltsatton des dounées de populatrou sclorr les drvlsrons uclrrurrrstntivcs dil pays j.l 6.4 6+l 612 1 lntroduction Une consultation informelle sur l'analyse et l'interprétation de la cartographie épidémiologique rapide de l'onchocercose (REMO) à l'aide d'un système d'information géographique (SIG), s'est déroulée à Ouagadougou (Burkina Faso) du 3 au 6 septembre 1996. La réunion a été accueillie par le Programme de lutte contre l'Onchocercose en Afrique de l'Ouest (OCP) en coordination avec le Programme africain de lutte contre l'onchocercose (APOC), et parrainée par le groupe spécial Recherche opérationnelle sur l'onchocercose du Programme spécial PNUD/Banque mondiale/OMS de recherche et de formation concernant les maladies tropicales (TDR). L'assistance technique a été apportée par le progralnme conjoint OMS/UNICEF sur la cartographie en santé publique (HealthMap). L'atelier s'est réuni pour élaborer une méthodologie standard pour l'analyse des données du REMO et I'identification des zones prioritaires pour le traitement par l'ivermectine sous directives communautaires (TIDC) pour les pays de I'APOC. Pour atteindre cet objectif, les participants ont évalué la situation du REMO au Cameroun, en Ethiopie, au Nigeria, en Ouganda et au Soudan, analysé et interprété les données disponibles du REMO, et identifié (a) des zones où le TIDC était indiqué, (b) des zones où le TIDC n'était pas nécessaire et (c) des zones où des données supplémentaires étaient requises. La méthodologie développée au cours de cette démarche a été par la suite testée et affinée durant l'analyse et l'interprétation des données du REMO d'autres pays. La méthodologie finale décrite dans Ie présent document est destinée à servir de guide pour aider le personnel de lutte contre l'onchocercose, en particulier les membres des groupes nationaux de lutte contre l'onchocercose, dans l'interprétation des résultats du REMO et leur utilisation pour la planification efficace et la détermination des priorités en matière de TIDC dans les pays de I'APOC. Lors de la préparation de ce guide, 1l a été fait référence au manuel d'origine du REMO1 et au manuel d'instructions supplémentaires (Supplemental guidelines for REMO'7). Ces documents (en anglais), auxquels le lecteur pourra se reporter, contiennent une description des différentes étapes impliquées dans la planification du REMO et l'exécution des encluêtes dans les villages sélectionnés (villages-test). [.e logiciel SIC utilisé est z\tlas*GIS, décrit dans le rnanuel de fbrn-ratiorr préparé par HealthN,lap'. I1 est supposé quc le lecteur a suivi une séance de tbnnation à l'utilisaliort d'Atlas*GlS. et I'ir-rformatior-r apportée ici devrait être vue comme un complémeut au t'nanuel. Bien cluc le préscnt guide mette l'acccr-rt sur l'anal1'se, l'expérience ntontre clu'un bor-r travail prélinrinaire est important. Beaucoup d'efforls et de travail eti dotrhle peuvellt être évités par unc borlre planilication des différentes étapes nécessaires pour lc REMO. Ce point rl'a probablement p.rs été sufTsamnrent srir.rligné clans les uranuels précédents et une descriptiort de l'irnportant trar,'ail préliurinairc. cr)rlcemant en particulier 1es SIG. a été inciuse claus le préseut ciocnntcnt. Les points qui ont été sr,rfllsamment détaillés dans lcs uriurucls précédents strrrl suLrleirrcnl eites iei -1 n 2. Travail préliminaire 2.1 Travail préliminaire sur papier 2.1.1 UrttsaloN DE cARTEs pAplER ET LtvRE DE BoRD Les cartes les plus appropriées pour le travail préliminaire du REMO sont les cartes topographiques sur papier à l'échelle l:200 000 dans les pays francophones et I :250 000 dans les pays anglophones. Même si l'équipe du REMO dispose déjà de cartes numérisées, elles ne devront pas être utilisées dès le début puisque leur échelle n'est pas appropriée pour la sélection des villages-test. L'acquisition des cartes papier fait partie du travail préliminaire, mais les cartes requises ne sont pas couramment disponibles. Le géographe de l'équipe du REMO devra être chargé de se procurer les cartes auprès des services cartographiques nationaux ou régionaux, des universités ou d'autres établissements de recherche. Il est recommandé d'avoir 2 séries de cartes d'origine. Le coordonnateur national gardera une série en réservejusqu'à tu tout" f* a" t'exercicé. Il devra toujours être possible de s'y référer si l'autre série de cartes a été perdue ou est devenue difficile à lire à la suite des enquêtes de terrain. La deuxième série servira pour les enquêtes de terrain après la sélection des villages- test. La marche à suivre pour la définition des zones à partir des cartes papier et pour la sélection des villages-test est décrite aux pages 4-9 du manuel du REMO. Les étapes et le raisonnement choisis pour [e zonage et la sélection des villages devront être consignés dans un livre de bord (voir « Supplemental guidelines for REMO »). L'expérience a montré qu'un livre de bord de ce genre facilite beaucoup l'analyse et f interprétation des résultats. 2.1.2 PnepeReR LES FoRMULATRES D'ENQuETES suR pAprER ET NorER LES DoNNEES DISPONIBLES Des améliorations ont été apporlées au formulaire récapitulatif des résultats de l'évaluation épidémiologique rapide (REA) par zone, décrit à la page 20 du rnanuel du REMO. Elles concernent I'ajout de colonnes distinctes pour les coordonnées iues sur les cartes pendant la sélection initiale des villages et pour les coordonnées collectées à I'aide d'un GPS pendar-rt les enquêtes de RIrz\ dans les villages-test. L'expériellce a rnontré que garder un enregistrerrent de 1'eusenrhle pcrn-iet d'ér,itel beaucoul-r de problèrnes lors du traitement et de 1'anal1'se des résultats. Des colonnes distinctes ont aussi été introduites pour les résultats des palpations de nodules chez les personnes des deux sexes. La présentation ntaintetrant recommandée pour le lormulairc est la suivante : "1 Col I lol 2 :ol 3 lol 4 Col 5 lol 6 lot 7 :ol E Col 9 lol l0 Col ll lol 12 Col 13 Col 14 3ol 15 Nom Vilhge Crrt! Nom Villegc Tmin Codc Vilhgc fypc dc Villegc tlÿs/A) lærdonnés sur qnc Cærdonnés GPS lstimrtion Dpulrtion llhgc Nb homm6 èx.minê \b lomm§ lvæ roduls % homms lvæ nodulc §b fcmmq *lmrné6 Nb fcmmc I lvcc nodules % fcmmo tvcc nodule L.trtude Longirude -.tltudc ingitudc ) u D M s D M t D M S A ce stade du travail, il est recommandé de remplir les colonnes 1, 4, 5,7 et 8. Toute l'information requise est directement disponible sur la carte et devra être reportée par le géographe qui, à ce moment-là, travaille dans l'équipe. L'expérience montre que si les coordonnées de la carte ne sont pas introduites à cette étape, il est probable qu'il y aura beaucoup de problèmes sérieux et insolubles pendant la phase de traitement et d'analyse des dorurées. 2.2 Travail préliminaire à l'ordinateur 2.2.1 EHrnrR LES DoNNEES tNlrtALES lssuES DES FoRMULAIRES Une fois que les premières données ci-dessus ont été notées sur les formulaires, il est recommandé de cornmellcer à les informatiser. Cela pennettra de préparer des cartes numériques avec les villages-test et d'exatniner la pertinence de la couverture des villages sur la zone. La saisie des domées peut être faite avec un programme spécial élaboré dans EPI-INFO (disponible auprès du TDR ou de t-lealthMap). Ce progralnme pennet d'entrer les coordonnées en degrés, l-ninutes. secolldes et calcule automatiquement les coordonnées correspondantes sous forme décimale. l-e fichier résultant devra eltsuite être exporté sotts forme d'un ficl'rier DBASE (*.DBF) avant d'être importé cians Atlas*CilS. On peut aussi utiliser ult progralnnle cle gestion de base de données oLl LIn tableur hien cotrtru de 1'équipe (DBASE, FoxPro. Excel, e-tc.). Cependant. i\ la frn. lc llchicr devra être exporté sous 1a lonne d'un flcl-rier *.DBF avant lamême structllre clue le tablaait de I'Attnexe ô.1. 5 2.2.2 NumenlseR LES zoNES, D,ApRES LE TRAvAIL suR pAptER Une fois que le z-or,arge a été achevé sur les cartes papier, l'information devra être transferée sous forme d'une carte numérique. Cela peut être facilité par I'utilisation de fonds de carte numériques. 2.2.2.1 Utilisation de fonds de carte Une série de fonds de carte numériques a été préparée en format Atlas*GIS pour tous les pays de I'APOC par HealthMap. Les fonds de carte sont fournis aux participants pendant les séances de formation sur Atlas*GIS. Les fonds de cartes requis pour l'analyse comprennent : - frontières politiques - fleuves, rivières et lacs - données sur le relief(courbes de niveau ou zones de relief; Les fonds de cartes proviennent tous de la même source : la Digital Chart of the World, qui a été rassemblée par le World Resources Institute (Washington) en une série homogène de fonds de carte pour l'Afrique, appelée Africa Data Sampler. Pour faciliter l'analyse par-delà les frontières, il est recommandé que chaque pays utilise ces cartes-là. 2.2.2.2 Diqitaliser le zonage Cette tâche requiert les étapes suivantes dans Atlas*GIS (selon la terminologie d'Atlas*GIS) - Création d'un nouveau fichier (new Geo-file) pour le zonage - Création d'une couche pour les zones d'éléments biogéographiques - Création d'une couche pour les subdivisions à I'intérieur des zones - Création d'une couche pour les zones vides ou non appropriées - Création de couches définissant les sous-zones et les bassins versants La procédure est décrite en détail dans l'Annexe 6.2. 2.2.3 Exnrueru DE L'ADEeuATtoN DE LA coUvERTURE EN ECHANTTLLoNS L'expérience a montré que pour une zone donnée, une faible couverture en villages-test mène de façon sûre à une description insuffisante de la distribution de la rnaladie. Et cela alrra ulle grande portée sur f interprétation des résultats du REMO et fir-ralernent sur la planification de la lutte dans la zone. Il est par conséquent important d'examiner la pertinence de l'échantillonnage avant de commencer le travail de terrain. Cela peut être fait en réalisant une carte des villages-test. Une fois que les coordonnées des r.'illages sélectionnés sont entrées et [e zonage digitalisé, lcs villages-test peuvent être cartographiés avcc AtlasxGIS sur le fbnd de carte. La pertinence cle l'échantillonnage devra ensuite être vérifrée en tenant compte des zones. Par exemple, alors ri j 7j ? 6 que I'on n'a pas besoin de villages-test dans les zones vides, il ne dewait pas y avoir de grands vides dans des zones endémiques potentielles avec des rivières. L'examen de l'adéquation de la couverture est particulièrement important si I'on décide de ne pas aller dans certaines parties du pays pour le REMO parce que des données de REA complètes et fiables sont déjà disponibles auprès d'autres sources. Une telle décision ne devrait jamais être prise avant d'avoir affiché sur la carte la localisation des données de REA disponibles. Même si des enquêtes approfondies ont été conduites pour une certaine région et que les données sont disponibles pour un grand nombre de villages, l'expérience a montré que ces villages pouvaient tous être localisés dans un rayon très restreint, tandis qu'une grande partie de la région demeure non couverte. La carte ci-dessous en donne une illustration. Les données de REA étaient disponibles pour 70 villages dans cette région. Avant de cartographier ces villages, on pensait que l'information fournie par le REA était largement suffisante pour cette région. Mais lorsque les données ont été portées sur la carte, il est apparu que tous les villages étaient localisés dans un rayon de l0 km. Il n'y avait pas d'information épidémiologique pour la majeure partie de la région, en dépit de la présence de plusieurs rivières. Il a été dès lors nécessaire de sélectionner des villages supplémentaires pour le REMO afin d'assurer une cartographie suffisante de la distribution de l'onchocercose dans cette zone. § \ ^ \\ \ ^ ^ a ^ L \ ^ l ! §r Legende !1"' ffi z"*s,,a- a EcMn0llon REA rn(ral ^ \tlligcs REMO sùpplcnrcnrarrcs KM "r-F 1 3. Enquêtes de terrain La sélection des communautés à surveiller et l'exécution des enquêtes pour l'évaluation épidémiologique rapide (REA) dans les cornmunautés-test sont correctement décrites dans les sections 2.1 et2.2 dtmanuel du REMO. Cependant, sur la base de l'expérience actuelle avec le REMO, nous voudrions ajouter les points suivants. Des villages de substitution (villages alternatifs A ) devront être sélectionnés sur la carte pour tous les villages à haut risque (H) et les villages secondaires (S). Dans le cas où un village- test sélectionné ne peut être trouvé ou n'est pas accessible au moment de l'enquête de terrain, un autre village doit être localisé et examiné. La sélection de ces autres villages devrait être faite par l'équipe principale du REMO en même temps que la sélection des villages H et S. Il ne faudrait pas laisser choisir d'autres villages par l'équipe de terrain, car il est très probable que cela aboutisse à un biais. De plus, des villages de substitution devront être enquêtés à la place de tous les villages non accessibles pour éviter d'avoir des vides sur la carte. L'utilisation d'un GPS (Geographical Positioning System) pendant les enquêtes sur le terrain est hautement recommandée. Les coordonnées devront être relevées pour chaque village où le REA est réalisé. Les coordorurées GPS devront être reportées sur le formulaire d'enquête sur papier. I{ i 4. Analyse du REMO avec Atlas*GlS 4.1 Données d'enquête épidémiologique 4.1.1 DoNrees oe u'evltuATloN EPIDEMIoLoGIQUE RAPIDE (REA) Une fois les enquêtes de REA achevées, les données d'enquête devront être entrées dans l'ordinateur. Pour cela, un programme de saisie de données EPI-INFO a été développé; il peut être obtenu auprès du TDR. (Voir aussi la section 2.2.1). La validité des données de REA devra être évaluée au moyen d'enquêtes indépendantes de validation sur un petit échantillon de villages, après l'exécution des enquêtes principales de la REA. Les données de validation devront être entrées en utilisant le même programme de saisie de données, et de plus la prévalence des nodules observée dans les enquêtes d'origine et dans les enquêtes de validation devra être comparée. Dans le cas de sérieuses divergences, les données de REA devront être vérifiées attentivement pour identifier les causes possibles des problèmes (par ex. performance insuff,rsante d'une des équipes de terrain, surévaluation par un des enquêteur, etc.). Une fois la cause identifiée, il sera possible de déterminer quelle enquête de REA devra être refaite pour assurer que la série de données finale soit fiable. 4.1.2 CONVenStON ET ADDITION D'AUTRES DONNEES EPIDEMIOLOGIQUES Dans beaucoup de pays de I'APOC, il y a des endroits où des enquêtes de prévalence de l'onchocercose ont été entreprises avant que les méthodes de REMO et de REA soient développées. Ces enquêtes ont été faites par diverses organisations, par ex. des institutions de recherche, des services de santé locaux, des ONG travaillant dans le domaine de la lutte contre l'onchocercose, etc. De plus, les méthodes d'enquête utilisées sont généralement différentes de celles appliquées dans le REMO. C'est pourquoi, les résultats rapportés par ces précédentes enquêtes ne sont pas directement comparables avec les observations du REMO, Cependant, pour beaucoup d'endroits, ces enquêtes passées for.trnissent une infbrrnation détaillée sur la distribution et le niveau d'endémicité de l'onchocercose, et il est irnportant d'essayer d'intégrer cette inlbrn-ration dans le SIG pour l'onchocercose. [-a pluparl des cnquêtes précerdentes utilisaient la métirode des biopsies cutanées potlr déterntiner l'inlèction onchocerquienne, et l'indice d'endémicité le plus couralnnlellt rapporté était la prér,alence de biopsies cutanées positives pour les n-iicrofilaires datis la popr-rlation totale (incluant les deux sexes et tous les croupes d'âge). Un autre indice courant était ia charge r-nicrofilarierute dans lzr courmunauté (CI\IFL), qui est liéc de tnanière litréaire avcc l'importance dc la malaclie oculaire et qui est calculée en r-rtilisant uniquenreut les résultats cles biopsies cutanées ponr les adultes de sexc masculiir. i t, () Un grand nombre d'enquêtes ont été réalisées dans la savane d'Afrique de I'Ouest dans les pays de I'OCP et ailleurs, en utilisant à la fois la méthode des biopsies cutanées et de palpation des nodules. Une importante série de données de telles enquêtes ont été analysées lurant un atelier organisé en 1991a. Quelques-uns des résultats sont montrés dans la figure ci- dessous qui peut être utilisée pour convertir la prévalence des microfilaires dans la population totale des villages en une estimation de la prévalence correspondante des nodules pàlpables chez les adultes de sexe masculin. 4.2 ldentification des zones où un traitement à grande échelle est recommandé Lorsque les données de REA ont été entrées dans la base de données, les résultats des enquêtes devront être affichés sous forme de diagrammes en secteurs pour la prévalence (la procédure est décrite dans l'annexe 6.3). Ensuite peut commencer la partie la plus importante : I'interprétation de l'épidémiologie. Cette phase devra être exécutée par la même équipe du REMO qui a fait l'échantillonnage d'origine des villages de l'enquête. Dans ce processus d'interprétation, il est important de se rappeler que les données d'enquête ne représentent pas un échantillon aléatoire dans I'espace, mais que les villages ont été sélectionnés d'une manière orientée selon un objectif, en utilisant f inforrnation disponible sur les bassins des rivières. C'est pourquoi. il est crucial de revenir au raisonnement utilisé pendant le processus d'échantillollnage, et d'appliquer le même raisonnement dans l'interprétation des résultats de l'épidémiologie. Ainsi, Ia même division du pa1,s en secteurs et zones biogéographiques det,ra être utilisée; cle plus, les arguments avancés pour la sélection spécifique des villages nécessitent d'être pris en courpte. Un carnet cle bord ciétaillé s'est r0 avéré extrêmement utile à ce niveau. Les zones sont souvent trop grandes pour permettre une classification simple de la zone entière, et il peut être nécessaire de démarrer au niveau des bassins des rivières, en suivant les mêmes séquences que dans le processus de sélection d'origine. Il est également important de séparer en premier lieu les villages à haut risque et les villages secondaires lors de I'interprétation des résultats. Le but final de cette étape de l'analyse est de classifier les subdivisions des bassins versants en trois groupes selon la stratégie indiquée de traitement par l'ivermectine. 4.2.1 SueorvrstoN DES BASSINS sELoN LA STRATEGIE DE TRAITEMENT 4.2.1.1 Types de zones par stratéqie de traitement Les trois zones suivantes par stratégie de traitement sont différenciées dans l'analyse (i) Zone de TIDC clairement indiqué. Ce sont les zones pour lesquelles les résultats du REMO montrent clairement que l'onchocercose est hautement endémique (prévalence des nodules supérieure à 20%o dans la plupart des villages de REA) et constitue un important problème de santé publique partout dans la zone. Le TIDC est indiqué dans toute la zone et des enquêtes REA supplémentaires ne sont pas nécessaires pour préciser la distribution de la rnaladie. Des REA peuvent être requises pour définir la limite exacte de la zone de TIDC, mais de telles enquêtes peuvent être faites dans le cadre de la première vague de traitement et ne devraient pas retarder la mise en æuvre du TIDC dans la zone. (ii) Zone sans TIDC Ce sont les zones où il n'y a pas de transmission de O. volvulus ou dans lesquelles le niveau d'endérnicité de l'onchocercose est trop bas pour considérer la maladie comme un problème de santé publique suffisant pour justifier le TIDC. Un traitement par I'ivermectine peut être décidé sur des bases cliniques dans les zones où il y a transmission mais où I'endémicité est basse. (iii) Zone de TIDC éventuel Pour ces zones, le tableau épidérniologique n'est pas suffisamment clair et il est nécessaire de peaufiner la carte de la distribution de I'onchocercose au moyen d'enquêtes REA supplémentaires. Le TiDC peut être indiqué alors pour une partie de la zone mais la décision finale de'u,ra attendre Ia clarification des variables de l'endérnicité. f.es " zones de 'flDC e(r,entuel " peu'r'ent être divisées en deux sous-qroupes - TIDC probable (zones plioritaires pour des enquêtes RE,A supplétnentaires) Dans ces zones, la distribution n'est pas cohérente. Certains villages nc sont pas endémiques ou seulement li1'po-endérniques. tandis que d'atttres sont assez endémiqLres pour rér,éler clue le TIDC serait indiqué au moins dans une partic de la zone. I : ll - TIDC improbable (zones où des enquêtes REA supplémentaires ne sont pas urgentes) Les données sont un mélange de villages non-endémiques, hypo-endémiques et méso-endémiques. Cependant, dans aucun des villages-test la prévalence des nodules n'est supérieure à 40%. 4.2.1.2 Création de couches pour les trois types de zones par stratégie de traitement Une fois que les différentes zones de traitement ont été identifiées, les couches correspondantes doivent être créées dans Atlas*GIS, et les résultats enregistrés sous forme d'un fichier géographique (geo-file). Le nom du geo-file doit commencer par les 2 lettres du code du pays et se terminer par TIDC (par ex. CMTIDC.AGF). 4.2.2 Exeuples DE L'tDENTtFtcATroN DES zoNES pAR sTRATEGIE DE TRATTEMENT Quelques exemples de l'identification des zones par stratégie de traitement sont illustrés ci- dessous par l'utilisation de cartes épidémiologiques pour les bassins des rivières au Cameroun et au Nigéria. Etude de cas Nol : Cameroun, zone IIIb l. Zoomons sur la zone, affichons les zones vides d'onchocercose, les rivières, et les données du REMO sous forme de diagrammes en secteurs. En premier lieu, affichons uniquement les résultats pour les villages à haut risque. 'fous les villages " à haut risque " sélectionnés le long de la rivière Ia plus importante ont une très forte prévalence de nodules. La première conclusion qui peut être tirée est que Ia zone est endérnique pour I'onchocercose, et que le TIDC est indiqué ie long de la rivière la plus irnportante et de ses principaux affluents du Sud. l + , . : Cartographie épidémiologique rapide de l'onchocercose Lêgcnde ! r,.u- -* errro ræ/,r, o o o o o Crs n.l : Crmcrouo - Zooc lIIb t2 2. A présent affichons aussi les diagrammes de prévalence pour les villages secondaires. La plupart des villages secondaires montrent une prévalence de nodules très basse, indiquant que la distribution le long de cette rivière suit les caractéristiques classiques de " savane ", avec une endémicité d'oncho- cercose élevée le long de la rivière principale et baissant rapidement à mesure que l'on s'en éloigne. 3. Identification des " zones de TIDC clairement indiqué ". La forte prévalence des nodules dans les villages de la première sélection montre clairement que le TIDC est indiqué dans tous les villages le long de Ia rivière la plus importante. Une ceinture de 20 à 40 km de Iarge est par conséquent tracée le long de la rivière Ia plus importante pour indiquer que c'est une " zone de TIDC clairement indiqué ". Cartographie épidémiologique rapide de l'onchocercose Cu tr.! : Crmüoutr - Zotrc IIlb Cartographie épidémiologique rapide de l'onchocercose Cas n.l : Camroun - Zonc lllb J l i É --_,1 LGgcnde I'*** r*'*.-" tr*-^*" ,) .. -" o o o o o f u-,*t'.* fl u.u--*uuo o o o o l3 ,: ,È ,) :l ,i ta des " zones de Cartographie épidémiotogique rapide de I'onchocercose Cæn.l:C.mroun-Zon ![b ,, .! .» t -I-l L.güd.I--ffi** ü D ,) Daûs.la partie Ouest du bassin de la rivière la plus importarile, tous les villages seoondaires le long des affilfens ùr §ud sont eux a#si hautement endémiques,'oes afluents sont donc imfos;da$ la ceinture de " TIDÇ pirliirseærrt indiqué ". Qependsütrdms le cenlre de la zone, [a dltnpart des villages le long des @Urotr du, Sud (zoneB) ont uic endémicité très basse et le TIDC ne semble généralement pas indiqué. Dans cette zone, quelques enquêtes supplémentaires peuvent être nécessaires pour déterminer la limite exacte de la zone de TIDC. Cependant ces enquêtes ne sont pas urgentes et peuvent être faites dans le cadre de I'application d'un prograûrme de traitement le long de la rivière la plus importante. Le long du principal affluent, dans la zone A, les critères sont moins clairs : en amont, l'endémicité sembie baisser, mais les deux derniers villages au Nord, à la limite de la zone vide, ont un très fort taux de nodules. Le TIDC est de toute évidence nécessaire dans certaines parties. de la zorLe, mais sans enquêtes supplémentaires il n'est pas facile de déterminer exactement où. Sur la base de certains villages hautement endémiques, des enquêtes supplémentaires sont urgentes dans cette zone. t4 F Ft Etude de cas No2 - Sud-Est du Nigéria Cet exemple conceme une vaste zone autour du bassin de la Cross-river dans le Sud-Est du Nigéria. 1. Affichons les zones et les zones vides définies lors de la sélection initiale des villages-test. 2. Affichons les données du REMO sous forme de diagrammes en secteurs, et interprétons la distribution épidémiologique, premièrement bassin par bassin, comme dans l'exemple précédent, puis en regardant la distribution dans les bassins avoisinants. Dans cet exempie, il y a une haute endémicité dans caÉogràphie dDËéiniologlqgê raplde de t'onchocercose Cas n.2 -Nig&ia LGgcnd. El*'' 7f ttrl**t Ktt r-----lo 2040 Cartographie épidémlologique raplde de l'onchocercose Cas n.2 - Nigeria Legênde 7f.nn*r@*n" Pæv. nodulê. (7.) O oto 0 O lto I0 o l0ro 20 o 20ro 40 O 40 to I00 KM I---l02040 o o o o @ o o o o o pratiquement tous les villages-test du bassin de la rivière dans ie centre-nord, et pratiquement aucun nodule palpable dans le sud-ouest du delta de la rivière. l5 §t:l .: 3. Définir les différents tlpes de zones de TIDC. Après avoir interprété les résultats bassin par bassin, püs combiné les résultats des bassins avoisinants, les participants à I'atelier ont identifié les zoàes de TIDC;.eomme il est monté ici. Il y a une vaste z;lrne à haute endémicité couwantplusieurs zones adjacentes, et où le TIDC est indiqué dans tous les villages. Gertognphle. épidérnlelogiqre apidc de l.onchocetcose Legende :;.9 roacroc ! n»ci"os* ff IIDCnroUrtto S rrocimnrct*t 'f n'mieç*vc PcY. nodrd€ (ta O oto 0 O lto l0 O toto 20 O 20to /t0 o /toto 100 KMI---'l0 æ40 l Ij ] : l t Plusieurs affinements sont nécessaires dans deux zones dans le Nord et une zone dans le Sud- Ouest. Nous utiliserons la dernière zone pour illustrer quelques-unes des difficuttés qui peuvent se présenter dans l'interprétation des données du REMO. 4. Cette carte montre un agrandissement de la zone dans le Sud-Ouest, pour laquelle un affinement supplémentaire est requis. Dans cette zone, la plupart des villages ont un taux de nodules très bas, mais il y a quelques villages avec un taux plus é[evé, et même un village avec une prévalence de nodules de plus de 40Yo. Seule la zone en amont des affluents de l'Ouest présente une prévalence de nodules régulièrement élevée. Pour le reste du bassin de la rivière, la distribution est irrégulière; cette partie du bassin est toutefois correctement qualifiée en tant que éventuel " avec comme mention " TIDC probable ,,. ..TIDC LcgGndê P6 dc TIDC J nDc inûcué S flDc Pob.blc 7f tnttb,té ltDC o o o o o 0lo 0 I ro l0 l0 lo 20 20 ro 10 40 lo 100 Cartographle épldémlologlque r.pldo de I'onchocercose Câs n.2 - Nigcria KM 100 20 t6 i'.i (l o o H 5. L'expérience a monté que les personnes interprétant les données du REMO oublient souvent que ce sont des données d' échantillons représentant des segments de bassins de rivière. A la suite de cela, il y a une tendance à interpréter à I'excès les taux de nodules pour les villages individuels et à classifier la zorte environnante sur la seule base de ces résultats. Des exemples de telles interprétations erronées sont donnés sur cette carte. Trois zones de " TIDC clairement indiqué " et deux de " TIDC éventuel " ont été définies autour de quelques villages-test, sans tenir compte du modèle d'échantillonnage utilisé pour sélectionner les villages. C'est une erreur courante, que I'on peut le mieux éviter en utilisant l'information sur le modèle d'échantillonnage original notée dans le liwe de bord. 4.2.3 CReaIoN DE cARTES EPTDEMToLOGIQUES MONTRANT LES ZONES OU LE TIDG EST INDIQUE L'objectif final de l'exercice est de dessiner une carte épidémiologique pour tout le pays. D'après I'expérience avec le Nigéria et le Cameroun, (voir carte ci-dessous) nous savons que la connaissance de la situation dans les pays avoisinants est utile pour définir les zones de stratégie de traitement à la frontière. TIDC rnôquc TIDC pobrblc TIDC 'mprcbablcP6 cncorc dc ruÀlo I -_-l togrndr '.:;:.1 tr dê rDc ffi rocr**tc '//7 rt*rtc TIDC tuülqoé ffi rocrctorc lü, noduh. (*l O oto 0 O lro l0 O lob 20 O 20 io ilo O 40 to l0o xil ----]0 ro20 Gertogrephlo lpldaplologlqu. npldo do l'onchocorcosl Cas n.2 - Nigcria CARTOGRAPHE EPIDEMIOLOGIQT'E RAPI'E OE L'ONCTIOCERCOSE NlgraL at Crmroun ZzaÉc ÿdcs t7 \ffictlfrnhs.ff s./ J t '-a , , Iti s i 4:S Estimation du nombre de villages et de la population totale nécessitant le TIDC 4.3.1 L'UNUSANON DES BA§E§ ÜË:üOilIlËES SUR 1 POPULAfiON OU LES VTLLAGES EN P RovE NAN c e o,*utffi+.SËnif,ttË Si une base de données natioqalE spl,les vitlagst ost diopqisie pour un pays, elle peut ête superposée à la eqrte des zone's,de taitement it est ensutib'ftite de faire-une requêtg sur le nombre de villageq à f intégçry _dq lg.'âçffin*lË_ffilfetnm-t, "&ier donn__sæs.dc ps_put-ation pou, les villagps doa-t également disfunitild,lÏoaombr+ de pemtbnes à traiter pèut alors-être calculé. Cependant, ce n'est pas hès souvènt que de telles bæeC de données sont disponibles. Nous utiliserons I'exemple du Catrreroün pou expliquer la mdiche à suivre pour l'estimation de la population cible pour le traitement (voir Annexe 6.4 pour plus de détails). Pour le Cameroun, il existe une base de données nationale sur les villages, mais elle ne contient pas d'information sur la population par village. A la place de cela, nous avons utilisé une estimation de la population moyenne par village. l. Superposons les données de villages, représentés en points, et les zones de traitement. Sélectionnons tous les villages qui sont à I'intérieur de la zone de traitement " TIDC clairement indiqué ". La population cible pour le TIDC peut maintenant être estimée en multipliant le nombre de villages dans la zone de TIDC par [a population moyenne par village. Les premières estimations pour le Cameroun ont indiqué qu'il y a 5025 villages dans les zones de " TIDC clairement indiqué ", et 403 villages dans les zones de " TIDC probable ". En prenant une moyenne de 700 personnes par village (total de la population rurale divisé par le nombre total de villages) et en supposant que le TIDC est requis dans 50%o des villages des zones classées comme " TIDC probable ", la population cible totale pour le TIDC a été estimée à 5025 x700+403 x700x0,5:3 658 550personnes. -:r.: l: t_ .r,f; 1Ê _.s .: Halj' I_ t8 -r. I I i ::imII*3 4.3.2 L'UnulSAnON DES DONNEES DE POPUIârION SELON LES DIVISIONS AD]TIINISTRATIVES DU PAYS Pour beaucoup de pays, il n'existe pas de base de données nationale sur les villages. Cependant les limites administratives et les données de recensement de population qü y sont relatives peuvent souvent être obtenues. Cette information peut être utilisée pour estimer la population cible pour le traitement en utilisant la marche à suivre décrite plus bas, pour le Nigéria. Cette carte montre, pour le Nigéria, les zones de traitement avec " TIDC clairement indiqué " et les limites administratives(LGA). Premièrement nous superposons les limites administratives reliées aux données de population d'une part, et d'autre part les zones de taitement. Ensuite nous découpons les zones de traitement suivant les zones administratives. Lorsque nous faisons cela avec Atlas*GIS, le programme crée une nouvelle couche et une nouvelle table. Dans la nouvelle couche, les polygones du traitement ont été découpés en polygones plus petits, selon les limites administratives. La nouvelle table contient la population de chacun des nouveaux polygones calculée sur la base de la surface relative des zones administratives qui tombent à l'intérieur d'une zone de traitement. La carte montre le résultat du découpage pour le Nigéria. Les zones de traitement ont été découpées à l'intérieur de polygones plus petits qui se rapportent aux zones LGA pour lesquelles les estimations de recensement sont disponibles. Avec cette façon de procéder, Ia population cible pour le TiDC peut être estimée Lry.r [ rcæmxzros ! rcuworrio Atlas GIS Thc Informetion Mrpping System for \ilindows KM I.------] 0 100 200 Layers ! Ncrovruzrces ! xct-lsrzoa"nn,u ! Nct lsrzo."nu'el Atlas The Information Mapping System for Windows KM I---0 100 200 19 _t .Ë -lt r Èit:. iü: ut I=]rli r !r pour tout le pays ou pour une zone limitée (par ex. un seul LGA ou une seule région) Cette approche suppose que la po,pulation est distribuée de façon homogène à l'intérieur de la zone administrative,.ainli, taiter la moitié d'une zone administative est équivatent à traiter la moitié de la poçulation de cette zone. Pour l'onchocercose, cette hypothèse peut ête raisonnable aussiilongtemps que nous utilisons uniquement des données de population rurale. 20 i 5. Dern ières rerfl arq ues Lorsque I'analyse a été achevée et la première carte de TIDC créée, il reste encore un certain nombre d'étapes. La première est d'écrire uu rapport de l'analyse et de l'interprétation des données du REMO, rapport qü décrit clairement le raisonnement uülisé dans la classification des zones par stratégie de traitement. Bien que le présent document donne le mode d'emploi pour une approche objective de l'analyse, I'interprétation des résultats reste pour une large part subjective. Ceci est inévitable avec une méthode d'évaluation rapide comme le REMO, qui fournit seulement une quantité minimum de données sur la distribution géographique de l'onchocercose. Mais cet élément subjectif ajoute encore à I'importance de préciser le raisonnement utilisé dans la classification des zones, information qui doit rester disponible lorsqu'une classification donnée fait I'objet d'une requête dans les étapes ultérieures. La carte de TIDC dewa être soumise au Groupe National de Travail sur I'Onchocercose (GTNO) dans chaque pays de I'APOC pour exarnen et approbation. Le GTNO sera encouragé à examiner la carte avec attention et de manière critique, afin que des problèmes majeurs puissent être identifiés lors de cette étape précoce, avant que la carte soit utilisée pour la planification de la lutte. Cependant, il sera aussi rappelé au GTNO qu'il s'agit seulement d'une première carte ayant comme objectif d'identifier dans les grandes lignes les zones prioritaires pour le TIDC. Des affinements supplémentaires de la carte sont presque toujours nécessaires, mais la plupart peuvent habituellement être faits dans le cadre de [a mise en æuvre du TIDC. La première carte aidera également à identifier les zones où des affinements supplémentaires sont requis d'urgence et où des nouvelles enquêtes REA doivent être menées selon les priorités. Une fois que le NOTF a approuvé la première carte TIDC, elle devient la base du plan national de lutte contre l'onchocercose. La carte permet d'identifier les zones prioritaires pour le TIDC et de définir les projets de TIDC qui seront soumis à I'APOC pour financement. 21 6. Ar.-mgx@s 6.1 Structure de la base de données du REMO iltcNanorl TYPE TAILLE x MAPVIL 1§ôilIFittagc sur ta carte Tcxte 40 No{n, lu la cqrtç VILLAGE Nom du village du A remptir après I'enquêæ de x CODE_VIL Tod;ôtrrcicl du village Texte l5 au du x REM VIL TyPe pour Texte 1 [ = [haut risque; S Secondaire x LATMAP_D Latitude Numérique 4 lue sur carte en degrés Indiquer si négative ( = Sud de x LATMAP M Latitude Numérique 4 Iue sur carte en minutes x LATMAP S Latitudc Numérique 6 sur la carte en secondes LATMAP Latitude Décimal ll,6 lue sur carte, convertic en degrés décimaux par calcul Indiquer si négative (: Sud de x LONMAP D Numérique 4 Longitudè lue sur la carte endegrés Indiquer si négative ( = Ouest du méridien de Greenwich) x LONMAP M Numérique 4 lue sur la carte en minutes x LONMAP S ngitude Numérique 6 Longitude lue sur [a carte en secondes LONMAP Longitude Numérique Il,6 Longitude lue sur la carte, convertie en degrés décimaux par calcul Indiquer si négative ( : Ouest du méridien de Greenwich LATGPS D L Numérique 4 lue par GPS en : Sud de degrés Indiquer si négative ( LATGPS M Latitude Numérique 4 Latitude lue par le minutes GPS en I,ATCPS S tude Numérique 6 I-utituae lue par le GPS en secondes LA'TGPS L.atitude Numérique I r.6 Latitude lue par le GPS' convertie en degrés décimaux par calcul Indiquer si négattve ( : Sud de l'équateu r) ) 22 Longitude I F LONGPS_D Longitude Numérique 4 Longitude lue par le GPS cndegrés Indiquer si négative (: Ouest du méridien de Greenwich) LONGPS M Longitude Numérique 4 Longitude lue par le GPS en minutes LONGPS S Longitude Numérique 6 Longitude lue par le GPS en seco4des LONGPS Longitude Numérique 11, 6 Longitude lue par le GPS, convertie en degrés décimaux par calcul Indiquer si négative ( : Ouest du méridien de Greenwich) x REM ECOD Division écologique pour la REMO Texte l5 Indiquée dans le titre du formulaire d'enquête du REMO x REM ECOZ Zone écologique pour la REMO Texte l5 Indiquée dans Ie titre du formulaire d'enquête du REMO x RtV BAS Nom du bassin de rivière Texte 25 x RIV NAME N.om de la rivièrç To.xtg 25 POP Population du village Numérique l0 Si possible d'après les données du recensement, sinon estimée DATE_POP Date des données sur la population Texte 6 Année du demier recensement, sinon date estimée du REMO (par ex. ESl995) MAL-EXAM Nombre de sujets de sexe masculin examinés Numérique J MAL_NOD Nombre de sujets de sexe masculin avec nodules Numérique 3 P_M-NOD Pourcentage de sujets de sexe masculin avec nodules Décimal 6,2 Calculé automatiquement: MAL NODMAL EXAM*IOO FEM EXAM Nombre de sujets de sexe féminin examinés Numérique J FEM-NOD Nombre de sujets de sexe féminin avec nodules Numérique J P_F_NOD Pourcentage de sujets de sexe féminin avec nodules Décimal 6,2 Calculé automatiquement: FEM NOD/FEM EXAM* IOO Les données pour tous les champs marqués d'une croix (X) peuvent être entrées pendant Ie travail préliminaire et avant la réalisation des enquêtes de terrain. i l : I l rl I 1) a 6.2 Guide pas'à=pas pour la création d'un nouveau fichier geo-fl'lë pour le zonage et la création de nouvelleà.couehos A. Vérifiez le répertoire de données par défaut : ce doit être celui où vous avez les fonds de carte (cours d'eaq,relief, ete...). o Choisissez FILE / PREFERENCES (frchier / préférences) o Dan§ la boîte de dtalogue Preference (préférences), cliquez sur l'option System (système) o Qqns lp qa§.9 D-e{ault Data Directory $ép.grtoire dç dqryLées par défaut), définissez le chemin d'accès de votre. répertoire de données. Si vous ne connâissez pas le chemin dtaccès exact, vous pouvez le retrouver en cliquant sur le bouton [...] B. Aflichez toutes les informations qui sont requises pour vous aider à dessiner les secteurs biogéographiques d'après les cartes papier (couches des cours d'eau, du relief...). C. Créez un nouveau fichier Geo file pour stocker les différentes couches . choisissez FILE / NEw / GEo (fichier / nouveau / géographique) La boîte de dialogue New Geo File s'ouvre ! l e:\adt\cameroont .00 tsA E:\;F:\AGISW\;C:\;D:\ 00 F:\agitw\ O llorktpace O unlt Ol"Eÿ-_-$_üi Erc cmcm tr/idlh: Systetn Uscr fD: llonitor Heisht: Scrotch fath: Qeocode Data Path: Çustom Symbols Directory: Default Data Dilectory: Pref e rence s -lr Cll BEI{O Zonins Bio geog divi: ol( Bio geographical Divitron{ ct{zoNtNG LL Begion E:\AD S\CAllEB0oN Laycl Optionr laycr Namc- Laycr fype; Dgrcrption Dircclotÿ: filc Namc: qcacription: Proicction- I'leu. Geo Frle 24 aa a a Dans la boîte de dialogue New Geo File (nouveau fichier de ÿpe géographique), définissez le File Name (nom du fichier). Il est recommandé de commencer le nom par les 2lethes utilisées pour le code du pays. Remplissez la description. Ce fichier geo file sert à stocker toutes les couches relatives au zonage (secteurs biogéographiques, subdivisions, zones non appnopriées et bassins des rivières). Le nom pourrait donc être " REMO zoning ". Gardez le système de projection LL. A ce stade, vous avez créé le nouveau fichier Geo file pour le zonage. Dans la même étape, vous allez créer la première couche pour stocker I'information sur les secteurs biogéographiques. Dans la boîte Layer Options (options de la couche), remplissez le Layer Name (nom de la couche) et la Description (description) correspondant à la couche pour les secteurs biogéographiques. a Cliquer sur OK. Rien n'a encore changé sur votre carte. a Si vous choisissez MAP / LAYERS & THEMES (carte / couches et thèmes), et cliquez sur lnfo de la couche Vous voyez que c'est un nouveau fichier geo file et une nouvelle couche. mais le Feqture Count (nombre d'éléments de la couche) indique " 0 ". Vous avez maintenant à dessiner les lirnites des secteurs. WM O u.iuitity O Layer ln[o O styl. O L.h"lt O lheme ChlZ0HlHË:Bio seo Yes File Name: layer Name: Detcription: Feature Count Table Hame: E: \AD S \CAl.lE RO O N\CllZO N lN G -AGF Eio geog divis Type: Hegion Bio geographical Divisionr 0 <None> *v I 2 3 Layer rder On Sample - wru Labelt On Sample No LabetHo Label Ho Label f Labet Thcme On No Ho No Layer Name CIIDHL:Eivers C['IDHA:Lakes CIIPOA:Limit-nat tffi tffi tffi YetYesYe* Laye rs & Themes 25 No Layers ill lr a D. Dessinez les limites de.s sectcürs Vérifiez dans [e :Default Layer Set Window (liste des couches pil défauQ que votre nouvelle couche est la seule sélectionnée. Sélectionnez l'outil approprié pour dessiner un polygone, et dessinez un secteur sur la carte. Pour fermer le polygone, double-cliquez avec la souris. Si vous faites une erreur pendant le dessin, vous avez juste à utiliser le Backspace (touche d'effacement) pour effacer les segments. Après avoir dessiné le secteur, vous pouvez le sélectionner et changer l'information avec l'outil Info (outil qui donne des informations sur les éléments de la carte). t I l 1itcrr ti'TlUniiiG laycrr: E -r:- lr -i-'tir L :.:.,, )6 \) [" - tl o è .v ,i- Logcnd !*.* E,-*fl*'*,* KM -----r 050lm Maifing of Onchocerciasis rtrar Sc* æ.1 I (krÿÿ6) I Wdr GCz1lFl llo) | S.L.r.d t oflMç a a Si vous voulez changer la forme du secteur, pour l'ajuster par exemple sur le tracé de la frontière : D'abord sélectionnez le polygone, puis utilisez l'outil " Reshape polygon " (modifier le polygone) et cliquez sur le polygone. Vous allez voir les différents segments du polygone. Vous pouvez déplacer chaque segment en cliquant dessus et en le faisant glisser. En double-cliquant sur la ligne, vous allez créer un nouveau segment qui peut aider à modifier le polygone. 21 i,' t,', 1' rtF lrtlllTl t !, I'll # i:i ffi ilt ti lll I r ! I I n*- E- KM 050 J ! a o o o Cliquez sur I'outil en forme de flèche lorsque vous avez fini de modifier le polygone. Sélectionnez à.nouveau l'outil "polygone" et continuez de dessiner les autres secteurs pour compléter la couche des secteurs biogéographiques. 5. Créisz une autre couche pour stocker l'information sur les subdivisions à l'intérieur des zones. Llobjectif est de créer une couche differente dans le même fichier geo file (CMZONTNG.AGF) Choisissez LAYERS & THEMES (affiche les couches de la carte) et cliquez sur New (nouvelle) EegionLayer fype: Eilè Hame: layer Name: [ercription: Subdivir zonet _û.F_: Subdivisiont into zoner C14ce! CI'IZOHIHG.AEF ]O ,S ;; E; 1. ii: fll +.§ L{j*.L§ # .:iru*rji&. i,tllfrlllrrrlll F I t +i * g € ;) New Layer W "lâ Rien n'a encore changé sur votre carte. o Vérifiez que le X'ile Name (nom du fichier) indique le fichier pour le z-oîage (CMZONING dans note exemple). o Définissez [e Layer Name (nom de la couche) o Définissez la Description o Cliquez sur OK Si vous choisissez MAP / LAYERS & THEMES, et cliquez sur Layer Info, vous voyez qu'il y a un nouveau fichier geo file et une nouvelle couche, mais le Feature Count indique " 0 ". Vous allez avoir maintenant à dessiner les limites des subdivisions à I'intérieur des zones. Utilisez la méthodologie décrite dans la section 4 ci-dessus pour dessiner les limites des subdivisions. La même méthodologie peut être appliquée pour créer une nouvelle couche pour les zones non appropriées. Note importante : Les fichiers geo file et les couches sont sauvés par défaut. En d'autres termes, si vous eflacez par erreur une zone après avoir passé 2 heures à la dessiner, vous avez perdu 2 heures de travail... Pour éviter cela, il est fortement recommandé de faire des backup (copies de sauvegarde). o Choisissez FILE / SAVE AS (fichier / enregistrer sous) o Sélectionnez Ie File to save (fichier à sauver) qui sera le fichier du zonage (ici CMZONTNG.AGF). o Défrnissez un File Name qui indique clairement que le f,rchier est un backup (par ex. cmzonbac. agf). . N'oubliez pas de changer la Description du fichier, donnez alors le plus d'informations que vous pouvez. . Ne cochez pas la case Use New File (utiliser le nouveau fichier). Ainsi, le fichier va rester sur le disque dur et cela va vous perrnettre de continuer Ie travail sur le fichier principal (CMZONING.AGF). (Si vous cochez la case, vous allez continuer de travailler sur le fichier de sauvegarde, ce qui n'est pas recommandé). r § noter qu'il n'y a rien de spécial à faire pour sauver les couches, parce que les couches font partie des fichiers geo file. a : a a lc) §l l; 6.3 Création et affiehage des diagrammes en secteurs de la prévalence dans Atlas*GlS. l. Ouvrez le fichier du REMO (par ex. CMREMO.DBF). 2. Ouwez la boîte de dialogue Themes & Layers. Sélectionner la couche du REMO 3. Cliquer sur le bouton Theme dans la colonne de boutons en bas à gauche de la boîte de dialogue. Le (4bleau à sa droite va offrir un certain nombre d'options. Assurer vous que la case theittc CIn (option thème enclenchée) est cochée. 4. Dans la boîte Map type (type de la carte) choisissez " Ranged Symbol " (symboles selon des données classées). 5. Cliquez sur la boîte Expression pour activer le Expression Builder (outils qui permet d'entrer des expressions pour spécifier les données utilisées). Choisir " P_M_NOD ", c'est-à- dire la colonne des pourcentages de sujets de sexe masculin avec nodules, puis cliquez OK. Yérifiez (avec Verify) l'expression et cliquez OK pour revenir au menu précédent. 6. Cliquez sur le bouton Ranges (qui classe les données) et une boîte de dialogue Ranged Symbol apparaît. 7. Dans Ranging (classer), sous l'option Method (méthode), faites défiler en cliquant sur la flèche et choisissez " Discontinuous " (distribution discontinue). Cela va vous pernettre de composer vos interyalles selon vos préferences. Il n'est pas nécessaire qu'ils soient de taille égale. 8. Dans le Number of Ranges (nombre d'intervalles), entrez le nombre d'intervalles que vous voulez utiliser (par ex. 5). 9. Appuyez sur calculate (calculer) et les intervalles seront recomposés. A noter le résumé des statistiques dans la fenêtre de droite. 10. Dans Minimum et Maximum entrez les intervalles dont vous voulez afficher les données en cliquant simplement sur les nombres et en les modifiant. Par exemple : Min Max , 0 1 10 20 40 0 10 20 40 100 i0 11. Dans la colonne Symbols, changez le syrnbole. êJlez en bas de la table de symboles et vous ver:rez2l ditr&ents diagrammes. Cela va vous permette de choisir un diagramme selon les 0-0 1-10 t0 -20 20 -40 40 - 100 o 0 o o fl intervalles que vous avez déflrnis. Par exemple : 12. Dans la colonne Size (taille), donnez-leur à tous la même taille, par ex. 11 13. Cliquez sw OK pour revenir au menu précédent et de nouveau OK pour revenir à Ia carte. Vous pouvezvoir les données du REMO affichées en 5 intervalles sous forme de diagrammes en secteurs. Note: Etant donné [e nombre de diagrammes prédéfinis, les intervalles peuvent facilement être affinés pour permettre le meilleur affichage possible des données. 3l 6.4 Es.timatlon du nombre de villages et de la population tot$e néêcssitant le TIDC 6.4.1 UnusanoN DEs BAsES DE DoNNEES SUR I. PoPULANON OU LES VILLAGES EN PROVENANCE; D,AUTREE SOURGËS l. Superposons les données des vil{ages sous forrne de points et les zones de traitement i: 2. Sélectionnez tous les villages qui sont à l'intérieur des zones de traitement. On fait cela avec Query/Select by location/lnside (requête/sélectionner selon la position/à l'intérieur de...) 3). lI I h-If ':.t l'i.Ë --:t':-j-{.!ffi ','-'ËË tË '',J T -i* É b.. i f,'. -,rit lr.i- '1 r i" * ü * Q o .* kxl * . 'l-, a .t.: I '} EX I.- 020r0 S:Definite_EE! ES I 'v!Ll--r1üE1:vill 5* CI{ZO N E 5:D etinitc_CB ! T EE layers: O Feature Çentroid l,lurt Be lndde O Feature l.lu*t Be felcent ln*ide Selection Herults I Dcrelect Y/hen Done Located ln$de Featurer From Loger: O Eeplace Selected O Sebct Ssbset O Àdd to Selected O Subtlact flom Selected Sclccl Ey La.;,iii*:i il-,siil .. a o Dans la fenêtre " Select Features From" (sélectionner les éléments de la couche...), choisissez la couche " Villages ". Dans la fenêtre " Locates Inside Features From Layer " (éléments localisés à l'intérieur de la couche...), choisissezla couche qui contient les zones de traitement. Selon que vous avez sélectionné ou non des éléments dans cette couche, cochez ou pas la case " Selected features only " (ne prend que les villages qui se trouvent dans des zones sélectionnées). Cliquez sur OK.a Sur la carte, Atlas*GIS va sélectionner tous les villages qui sont à l'intérieur des zones de traitement. Au bas de la fenêtre, vous pouvez voir combien de villages ont été sélectionnés. Yice I Nombre de ellages dans la zone de TIOC » , F t r-----]02010 Bdâ+r l,lâo 1 Scàle æ 73 tkm/cml lw,arn s:: sær tr.r) Selected 3957 Lm l0'{1'11 85"E Lal 7 l'4{ 0{"N t trisr-iËjË-c-_r-è_iiüi. I; t.l . Ë-{ .,'-.1, - -t",= i ,,î-.r ,., " !'l ' :'. IX Vous pouvez ensuite faire le calcul de la poputation à traiter, str la base de I'estimation de la population moyenne dans un village (par exemple 700 pour le Cameroun). 6.4.2 UÏusenoN DEs DoNNEES DE POPUI-ATION SELON LES DIVISIONSADMINISTRANVES DU PAYS L'obje4if est de superposer les limites administratives liées aux données de population sur les zoçs de üaitement, et de découper les zones de traitement selon les divisions admiqitiifatives. Atlas*GIS va créer une nouvelle couçhs et unq nouyçlle table. Dans la nouvet$ co$ehe, Ies polygones des zones de traitement vont êffe dfupupÊÉ .eA Bolygqrles plus petits ên fonction des limites administratives. La nouvelle table va contênir pour chaque nouveari polygone la population calculée sur la base de la surfaôe proportionnelle des zones adminiStratives. 1. Allez dans Map / Split (carte / découper) 2. Allez dans la fenêtre Split Features From (découper les éléments de...) Vous voulez découper les éléments de la couche contenant les zones de traitement (par ex. NGLASTZO : defin ttt zones). 3. Allez dans la fenêtre Split by Regions in (découper selon les zones d... ) La couche doit être découpée selon les zones de la couche des divisions administratives (par ex. NGADMIN2 : LGA) 4. Les résultats vont être copiés dans une nouvelle couche §erv Layer) et une nouvelle table (I.{ew Table). 5. Cliquez en premier sur New Layer et remplir à l'écran comme suit j i: a a r! I IiIEADIIINZLGAS[Gl-ASTZO:dc[in ttt zones NGI.ASïZO:zontttpop 0 ln E Uæ Selected Featurer On!ÿ Sq- km ffiilIreI ffi flspm Sehcted Fcatures onty toycr Features From CoPgr Retultt To Layel: Split By Laler: Smallert Eegion to Create: J4 rl.: .,. : l': C. lir Layer !ypc: Eilc Hame: Laÿer Hame: [e*cliptiorr zontttpop CDIT areas with pop lrom LEA BGllion ]tEtâsrzo_aGF EE ht--. . ! -r"-l!r- i, r-.r, u' Utilisez le nom (File Name) du fichier contenant la couche des zonps de traitement, mais définissez un nouveau nom et une nouvelle description pour la nouvelle couche. Cliquez sur OK 6. Vous êtes de retour à l'écran précédent, mais le nom de la couche a été mis à iour 7. Cliquez maintenant sur New Table et remplir à l'écran comme suit Entrez le nom d'une nouvelle table DBF qui va contenir les données de population. l,-' a HÊADt{lN2:LEASNGI-ASTZO:delin ltt zoncr NGIASTZO:zonlttpop 0 n Uæ Selected Features Ontÿ Sq- km lffiffillr,,àffiI fJ §;r[t Selected Featuret Only Copy Hetultr To Layel: Split Features From layel: Split By Hegion* ln Lalpr: Iffiil tffiil Smallcrt Eegion to Create: Split t zoHrrPoP Pop fol CDIT areas C Dufi.,* ilew Table O Copy Columnt from Table: Link to Eeo Layer: NGAD2POP-DBF HGLÂSTZO:zonlttpop F:\AD S \T.I I G E EIA\CT HYDATA lffil tffil Directory: File Name: Èescliption: New Tatrle 'j' 35 ttY +l .:..t Cochez l'option ,Copy CqU;mn from Tpble (copier les colo-nnes de la table...) et faites dérouler le menu pour séleetiortrrer lâ ttÙle qui contient les données sur [a poprrlaüon par zone administative. Dans le menu Link to Geo Layer (associer à une couche), sélectionnez le nom de lanouvelle couche que vous yeîezdc créer. Cliquez sur OK L'écran « Split »'Téapparaît, cliquer sur OK. L'ordinateur travaille et donne le message « Splitting Features... » (les éléments sont en train d'être découpés). Vous obtenez une'carte qui pourrait ressembler à ce qui suit : Les zones de traitement ont été découpées en polygones plus petits contanant les chiffres de population corresppndants. Si vous voulez avoir la population totale qui doit être traitée dans le pays, allez à Select by Layer (sélectionner dans la couche) et sélectionnezla nouvelle couche. Allez ensuite à Statistics (statistiques) u*alstatisti c= - C MZON E 2: cm cdli p oi,--tr, 1 Column Hame cFiE j -L.EN P90 u90 F90 !0 11rl 7l 1 4?75 5 5681 ))1) 71 Count 5um 1 5261 7 q 1 , La fenêtre Statistics va vous donner la somme de toutes les variables stockées dans la base de données. Dans le champ de la population rurale, vous verrez la population totale à traiter. Vous pouvez alors sélectionner uniquetnent les polygones pour une zone limitée et votts aurez la population pour la zot]^e. a L.yêrt I xcror,mrr-crs ! xor-,rstzou.rrm l-l Ncr"r-srz-o -tqop Atlas GIS The Informetiôt Mrpping Systcm for \ilindows KM r---'l0 100 200 36 I , : Liste des participants Dr U. Amazigo, APOC, Ouagadougou, Burkina Faso, Tel: 226 30 23 12 or 30 23 13,Fax:226 30 21 47 Ms V. Olufumilayo Bamgboye, National Onchocerciasis Control Programme, Federal Minis§ of Health and Social Services, Ikoyi, Lagos, Nigeri4 Tel:234 | 684 l2l or 234 I 268 44 05, Fax: 234 1 269 3t 04 Dr II. Edeghere, Zonal Coordinator for Onchocerciasis Control, P.O. Box 503, I Golf Course Road, Kaduna, Nigeria, Tel:234237 925,Fax:234 62237 924 Mr A. Estephanos, Ministry of Health of the Federal Democratic Republic of Ethiopia, P.O. Box 1234, Addis Ababa, Ethiopia, Tel: 251 I 15 95 51, Fax: 251 I 512691, Email: MOH.NCIC@padis. gn.apc.org Dr E.I. Gemade, UNICEF, 30A Oyinkan Abayomi Drive, Ikoyi, P.O Box lZBZLagos, Nigeria, tel 234 | 269 0276-80,Fax.234 | 269 07 26 Dr A.O. Jaiyeoba, c/q Professor Ogunba, Zonal Coordinator for Onchocerciasis Conhol, University of lbadan, lbadan, Nigeria, Fax234 2 810 35 63 Prof B.E.B. Nwoke, Zonal Coordinator for Onchocerciasis Control, School of Biological Sciences Imo State Universiÿ,PMB 2000 Owerri,Nigeria, Fax 234 83 234960 or 234 83 23 l0 90 or c/o WR Lagos 26 94 903 Dr M. Muktar, Institute of Endemic Diseases, Universiÿ of Khartoum, P.O. Box 11463, Khartoum, Sudan, Fax249 ll 775 474 or c/o WR: 873 161 0441, Email: 105150,270@compuserve.com Mr D. Mutabazi Global 2000 River Blindness Program, PO Box 12027, Kampala, Uganda, Fax256 4125 03 76, Email: rvbprg@starcom.co.ug Dr R. Ndyomugyenyi, Global 2000 River Blindness Program, PO Box 12027, Kampala, Uganda, Fax256 4125 03 76 Mr B. Ntsama, Ministry of Public Health, P.O. Box 12892, Yaounde, Cameroun, Tel237 23 43 20, Fax237 22 4419 Dr [. Nuttall, CTD/HealthMap, OMS, l2l I Genève, Suisse, Tel 41 22'l9l 3861, Fax 41 72 791 47 7 7, Email Nuttal I i@who.ch Dr J. E. Oye, Sight Savers Intemational, P.O. Box 4194, Yaounde, Cameroon, Tel:231 20 50 0'7, Fax237 21 55 67 Mrs P. E. Ogbu Pearce, NOCP, zonal Of{ice , Zone D, Jahun Road P.M.B 0291, Bauchi, Nigeria, Tel & Fax234 77 43769 Dr J. H. F. Remme, Directeur du Groupe de Travail Recherche opérationnelle sur l'Onchocercose, Programme spécial de Recherche et de formation concemant les maladies tropicales, OMS, 121 I Genève 27, Suisse, Tel4l 227913815, Fax: 4122791 48 54. Emailremmej@who.ch , ! 1 a 37 -t .1 '{ Bibliographie 1. Ngoumou P. and Walsh J.F. (1993). A manual for Rapid Epidemiological Mapping of Onchocerciasis. Document TDR/TDE/ONCHOCERCIASISI93.4. Organisation mondiale de la Sante, Genève. 2. Supplemental Guidelines for Epidemiological Mapping of Onchocerciasis. Report of an informal consultation. Document TDR/TDF/ONCHOCERCIASIS/95.1. Organisation mondiale de la Santé, Genève. 3. Démarrer avec AtlasGIS Version 2.0 pour V/indows. Manuel de formation pas à pas. Programme conjoint OMSruNICEF sur la Gestion des Données et la Cartographie en Santé publique (HealthMap). Organisation mondiale de la Santé, Genève. 4. WHO (1992). Methods for comunity diagnosis of onchocerciasis to guide ivermectin based control in Africa. Document TDR/TDE/ONCHOCERCIASIS 192.2. Organisation mondiale de la Santé, Genève. 1t a< ; ! ; 38 a