Rapport d’activité

I N o4*À ENGAGEMENT DE CONSEILLER TEMPORAIRE N" I/PER/APOC/ 0066 /I2 oMS/APOC DU 04 OCTOBRE AU 28 NOVEMBP.E 2012 A oUAGADOUGOU - BURKINA FASO RAPPORT D'ACTIVITE DU DR AIME, GILLES ADJAMI Le présent document râppoïte les activités mises en æuvre dans le cadre de l'engagement de .ons.iller temporaire N"I/PER/LPOC/0248/12 dont j'ai bénéfrcié du 04 octobre tu 28 novembre 2012 de |OMS/APOC, conformément zux telmes de téférences. 1. Rappel des termes de référence : Lcs terrnes de réfélence de l'engagement de conseillet tempotaire dont 1'ai bénéhclé sont hbellés cot].Ilrrc sult : Sur Ia pérlode du 04 octobre a:u28 novembre 2072,donner un appul aux actrvrtés de cdblage dc stmulies en laboratoire et assurer la gestron des activrtés de recherche sur les marqueuts d'une ér'entuelle résistance à I'i't'errrecüne à travers : - Le suivi de Ia gestion des échantllons de srmuhes recus du terrain ; - La conrtibuüon au criblage des simulies et lâ m,rsc à la dispositton des résultats à APOC ; - lteler.,er les anomali.es poul feedback aux pays par le Management AI']OC ; - Assurer l'archivage approplié des échanti-llons de parasites dans le cadte de la recherche des marqueurs ; - Assuret le suivi des échanges âvec TDR et les autres pattenaires du projet 2. Le suivi de la gestion des échantillons J'ar pour:suivis les enregrsÛ:elnents des données telatives aux analyses des échan illons de sunuLies sur: Ies fiches de sarsres élaborées à cet cffet, arnsi que dans un dossier Excel sur l'ordinateur. 3. La contribution au criblâge des simulies et la mise à la disposition des résultats à APOC Pendant la période sous re\.ue, ;'ai assuté Ies analyses des échantillons de simuhes ct de larwes infectantes 3.1. Echantillons de simulies J'ai effectué les analyses des échantillons de Sierra Leone (18,159 simulies) et du Mali (1,2,063 srmulies) pour toutes les étapes d'identrfications (extraction et purificatton de I'ADN, PCR, Dr Adjarni - Rapport d'Engagement de Conseiller Temporaire 0411012012 - 28llll20l2 _ OMS/APOC Page ll9 \ vl 1Lo W télectrophorèse et southern blot, synthèses des sondes oligonuciéotidiques, hybridation moléculaire et détections immunoenzymauques) à partir des lots de simulies qui ont été constitués pat Mr Sanon I(arim. Les données relatives à ces résultats ont été remises au Dl Toé pour le calcul des taux d'infectrvité dans le logiciel Poolscreenin92. Les résultats sont consignés dans les tableaux 1 & 2 ci-dessous. Tableau 1 Résultat des analyses des échantillons de simulies de Sierra Leonc capturées de Juillet à Décembrc2011 lJassin Irluvial \\/aanJc l-arn [0,r)34 - 1,018] Iiaba 0 À'[oa I(ambama 0 Serva Njaima 1 0 Gbangbara Mokassr 10 Rockcl r\r[anya J (*) Mrse en érridence toutes les espèces d'onchocerques sans distrncuon TableauZ 0 0 lJassin I"luvial Résultat des analyses des échantillons dc simulies du Mali capturées d'Octobre à Décembre 20ll Sitcs dc collcctc l'aux d'infectivité x10-3 Valcur Intcrvallc Fa1'2 0 Nrger ptlll.rp.ol_ -frer,fala 6047 21 0,1(, [0,005 - 0,837] (*) Mrse cn ér,rdence toutes les espèces d'onchocerques sans drstinction 3.2. Echantillons de larvcs infectantes J'ai effectué les analyses poul I'rdenuficatron des larves infectantes de Gurnée Bissau (échanullons dc 2009 et 2010), Bentn (échanullons de 2011), Sierra Leone (échantrllons de 2011), Mah (échantillons de 2012) et Ouganda (échantillons de 2012). J'ai effectué les analyses pour roures les étapes d'rdentrFrcauons (récolte des larves montées entle lame et lamelle, extractlofl et purihcation Dr Adjami - Rapport d'Engagement de Conseiller Temporaire 0411012012 -28llll20l2 OMS/APOC Page 219 Nombre de lot de 300 têtes Nombre de lot positif à la PCR (*) Nombre de lot positif à O. volvulus 'faux d'infectivité x10-3 TJ.,-l Intcrvallc Nombre de simulies analysécs I(aba-Fer1' 1362 7198 21,04 Randajuma Mano Sites dc collectc 5 2 0 0 24 7 2 0,28 J 0 3012 10 1 0 0 0 0 5 1007 ))/ 3124 0 0 0 Nombre dc simulics analysécs Nombre dc lot de 300 têtes Nornbre dc lot positif à la I'Clt (*) Nombre de lot positif à O. volnrlus Faya Pont 6016 20 12 0 13 1 de l'ÀDN, PCR, électrophorèse et southern blot, synthèses des sondes oligonucléoridiques, hybridauon moléculaue et détections immunoenzytnatiques. Lcs résultats sont consignés dans les tableaux 3, 4, 5, 6 et 1 en annexe, respectivement pour Ia Guinée Bissau, le Bemn, la Sierra Leone, le Mali et l'Ouganda. 4. La notifrcation des anomalies pour fecdback aux pays par le Management APOC Je voudrars obser-ver à ce niveau que les techniciens de l'Ouganda n'utilisent pâs les hches dc collectes des lawes, les références des femelles infectreuses ne sont pas précisées et que les lames nous sont pallrenues cassécs car elles étaient emballées daus une sunple feurlle de papier. 5. L'archivage approprié des échantillons de patasites dans le cadre de la rechetche des marqueurs ct le suivi des échanges avec TDR et les autres partenaires du ptojet. Ccs deux points des termes de référence de mon conttat ont été exécutés dans le cadre de la lrrrse erl ccuvre du pro;et sur le dér,eloppement des marqueuts de résistance, notalnment par : I-,a poutsuite de l'archivage des nouveaux échantrllons de mrcroflrlail'cs tssues des ér,aluatrons ÂPOC, confère tableau B en annexe : Ltste des échantrllons dc mcrolilailes r-éccptionnés pendant la durée du présent conttât. L'allocaLion dc fonds d'un autre projet pout l'installatron d'une ligne électr:rque dilecte et d'un stabilisateur de courant pour la tnise en matchc du surgélateu-r téceptionné en début d'amée 201.2. La saisre des données relaüves aux échantrllons en Excel, en attendant un Pïogratnmc de gestion plus approprié. La tenue de briefing régulier avec les technicrens épidémrologistes APOC, avant et après les évaluatrons, pour faile Ie point des protocoles de collectes et des drfficultés de terrain. 6. Autres activités J'ar superwisé l'rnventaire des magasms MDSC pour faire le point de l'existant. Des caissons n'arraient pas été rnventoliés depuis |OCP. Au cours de l'rnventai-r-e, du matéliel d'évaluation éprdémrologiquc a été remrs aux technicrens épi pout satisfaile leur besoin. La liste de ce rnatétiel rcrrrs est consrgnée dans Ie tableau 9. 7. Remerciements Au terme de cc contrat de travarJ., je voudrais adtesser mes srncères remerclements au Dr Lusalnba, Directeur du programme, au Dr L. Yarrréogo, Cootdinateur du buteau du Dtrecteur ainsr qu'à tout le management d'APOC, pour Ia conFrance placée en nous. Dr Adjami - Rapport d'Engagement de Conseiller Temporaire 0411012012 -28llll20l2 _ OMS/APOC Page 319 ANNEXES Tableau 3 : Résultat des analyses des échantillons de larvcs infectantes de Guinéc Bissau I,AI}O 32661 32662 32663 32652 32653 32654 32655 32656 32657 32658 32659 32660 32664 32665 32666 32667 1t12t2009 32668 1t12t2009 No ?32669 1112t2009 CADE 1 Dr Adjami - Rapport d'Engagernent de Conseiller Temporaire 04110/2012 -2811112012 - OMS/APOC Page 419 Point de Capture N" FML Seq/Page Nb L3T Nom BassinFluvial Rio Corubal 20 1CABUCA 1 Résultat Identification Onchocerques animales Onchocerques animalesCABUCA Rio Corubal 34 Datc dc Capture 1910812010 19t08t2010 Rio Corubal 168 1 Onchocerques animales1t12t2009 CABUCA 2 Onchocerques animalesCADE Rio Corubal11t1012010 147 149 1 Onchocerca volvulus "savane"11t1012010 CADE Rro Corubal 29 1Rio Corubal1t812010 Onchocerques anrmales Onchocerques animalesRio Corubal 25 1 28 1 CADE CADE CADE Rio Corubal 1 Onchocerques animales Onchocerques animalesRio Corubal b8t11t2010 811112010 8t11t2010 CADE Rro Corubal 40 I Onchocerques antmalesCADE I Onchocerques animalesCADE Rio Corubal 2 Rio Corubal 1 1 1 CADE CADE CADE Rio Corubal Rio Corubal 125 ? ? 1 Onchocerques animales Onchocerques animales Onchocerques animales Onchocerques animalesRio Corubal ? 8t11t2010 15t1 1 t2010 15t11t2010 1t1212009 1t12t2009 1t12t2009 CADE ? 3 Onchocerques animalesCADE Rio Corubal Onchocerques antmalesRro Corubal ? 1CADE Onchocerques animalesRro Corubal al Tableau 4 : Résultat des analyses des échantillons de larves infectantes du Benin NO LABO 33762 33763 33764 33765 3376 1 33766 Tableau 5 : Résultat des analyscs des échantillons de larves infectantes de Sietra Leonc Point de Capture No I,AI}O f)ate de Capturc NO FML Scq/Pagc Résultat Identification Onchocerques animales Onchocerques anrmales 33711 33712 3371 3 33714 33725 33754 33708 16t0512011 33722 Moa6t6t2011 KAMBAMA 04t1 Dr Adjami - Rapport d'Engagement de Conseiller Temporaire 0411012012 -28llll2012 OMS/APOC Page 519 Point de Capture N" FML Seq/Page Nb L3T Résultat IdentifÏcation Nom BassinFluvial Date de Capture 1 Onchocerques animalesOkpara 141214t0312011 KABOUA Onchocerques animalesOkpara 1111 128t03t2011 KABOUA 4 Onchocerques animalesOkpara 16117 t6t2011 KABOUA Onchocerques animalesOkpara 2111 114t0212011 KABOUA 32t1 2 Onchocerques animalesAGBOGBOME Ouémé7 t312011 1 Onchocerques animalesOuémé 5t231t01t2011 VOSSA Nb L3TBassin Fluvial 7Gbangbaia 13t0118t0512011 Nom MOKASSI Onchocerques animales Onchocerques antmalesGbangbaia 21t01 2NNOKASSI 23t01 1MOKASSI Gbangbaia Gbangbaia 05t04 1 18t05t2011 18t05t2011 18t0512011 MOKASSI 36/3 2 Onchocerques animales Onchocerques animales Onchocerques animalesMOKASSI Gbangbaia Onchocerques animalesGbangbata 33/01 2 8t612011 3t8t2011 MOKASSI 03t02 1 Onchocerques animales 3t8t2011 MOKASSI Gbangbaia Gbangbaia 16/03 2 Onchocerques animales 8t9t2011 IVOKASSI 421t0912011 MOKASSI Gbangbara Kaba 07t01 08/01 21 Onchocerques animales Onchocerques anrmalesKABA FERRY 12 Onchocerques animales 7t6t2011 19t07 t2011 KABA FERRY Kaba 11t01 Moa 26t2 5 Onchocerques animales4t4t2011 KAMBAMA 22t3 4 Onchocerques animales4t412011 KAMBAMA Moa KATVIBAMA Moa 20t02 o Onchocerques anrmales 33755 33759 33760 33724 33749 33702 33704 33706 16t0512011 02t03 JKAMBAMA Moa aNo [,AI]O 33732 33733 33734 Date dc Capture 20t6t2011 Point de Capturc NO FML Seq/Page Nb L3T Résultat Id entification Nom BassinFluvial KAMBAMA Moa 06/01 1 Onchocerques animales 2016t2011 KAMBAMA Moa 14101 19 Onchocerques animales 2016t2011 KAMBAMA Moa 19/01 10 Onchocerques animales 33735 JJ/JO 33739 33741 33742 33743 33744 33745 33746 33747 3375 1 33752 33757 337 17 33719 33720 33721 33726 33727 33728 33729 33730 33731 33738 20t5t2011 2015t2011 2016t2011 417 t2011 4t7 t2011 KAMBAMA Moa 03/01 11 Onchocerques animales KAMBAMA [Vloa 05/03 J Onchocerques animales KAMBAMA KAMBAMA Moa 21t1 15 Onchocerques animales Moa lVloa 02103 25t03 30/03 4 18 Onchocerques anrmales Onchocerques animalesKAMBAMA 4t712011 5t712011 KAMBAMA Moa 1 Onchocerques animales KAIVIBAMA lMoa lVloa 06102 10 Onchocerques animales 18t07 t2011 18107 t2011 1810712011 1t8t2011 1t8t2011 KAMBAMA 03i01 1 Onchocerques animales Onchocerques animales Onchocerques animales Onchocerques animales Onchocerques animales KAMBATVIA KAMBAMA lvloa Moa 23t03 23104 2 1 KAMBAMA Moa 38l02 2 KAMBAMA Moa 16/03 1 5t9t2011 KAIVIBAMA Moa 04t03 15 Onchocerques animales 19105t2011 MANO Taia 11t02 2 Onchocerques animales 19t05t2011 19105t2011 19t05t2011 9/6t2011 MANO MANO MANO MANO Taia 39/03 16/05 21t05 08t11 5 Onchocerques animales Taia Taia 7 Onchocerca volvulus "savane" Onchocerques animales11 Taia 3 Onchocerques animales 91612011 MANO Taia 40t1 7 Onchocerques animales 9t6t2011 MANO Taia 01102 12 Onchocerques animales 91612011 9t6t2011 MANO MANO Taia 18t2 2 Onchocerques animales Onchocerca volvulus "savane"Tara 12t3 13t5 1 916t2011 23t06t2011 IVANO MANO Taia 1 Onchocerques animales Taia 40104 12 Onchocerques anrmales 33740 23106t2011 IVANO Taia 11t01 20 Onchocerques animales 21t07 t2011 MANO Taia 16t01 2 Onchocerques animales 41812011 MANO f ata 08/03 2 33750 33756 Onchocerques animales Dr Adjarni - Ilapport d'lJngagernent de Conseiller Ternporaire 0411012012 - 28111/2012 OMS/APOC Page 619 N" I,ABO 33758 33709 3371 0 33723 33737 33748 BANDAJUMA Onchocerques animales1910712011 33753 BANDAJUIVIA Waanje 01/01 Onchocerques animales 21812011 Tablcau 6 : Résultat des analyscs des échantillons dc larvcs infcctantes du Mali Point de Capture No I,ABO Datc dc Capturc NO FML Seq/Pagc Résultat Id cntification Nom 33767 2t8t2012 KANKELA PONT 29t01 Onchocerques animales Tablcau 7 : Résultat des analyses des échantillons de larves infectantes de l'Ouganda Point de Capturc No I,AI}O Date dc Capturc Nom 33770 22t03t2012 ATVIUA BRIDGE/ 33768 12t1t2012 33769 14t0112012 Dr Adiarni - Rapport d'Engagement de Conseiller Temporaire 0411012012 -2811112012 _ OMS/APOC Page 719 Point de Capture NO FML Seq/Page Nb L3TBassin Fluvial 06/03 2 Nom MANO Taia 3Waanje 07 t01 Date dc Capturc 8t912011 17 t0512011 BANDAJUMA 229101BANDAJUMA Waanje17 t0512011 08t02 5 Résultat Idcntification Onchocerques antmales Onchocerques animales Onchocerques animales Onchocerques animalesWaanjeBANDAJUMA 1 Onchocerques animales '10/01BANDAJUMA Waanje 7 t6t2011 21t0612011 30/01 IWaanje Nb [,37 2Kankela-ba Bassin tr-luvial NO FMI, Scq/Pagc Nb L3TBassin F-luvial 7 Résultat Identification Onchocerques animales 2 Onchocerques anrmalesKATEMBO/ KASESE TAKO Onchocerques animalesTAKO 2KATEMBO/ KASESE COUNTRY RI\rER YILI.A,GE NUM SLTDES I'ANZANIE \TUNG\YE, ZIGI K§TE ZITU 1 NL\PE LER,\ ÀL\THOTHO 9 N,LÀCHINOWÀ NOÀLÂ 14 RUO NDONGO NKULÀMBE 3 5MILE 16/ BUEÀ N{UNGO ETÀN,I 1 J BOK\VÀ KENDEÀ{ 4 ?? E,TOKO 1 NIIONHO À\,IJI'\BÂ 1 )) DJÂOÀ{OFrO (ZAUZÀN{r) 1 B.\DI TÀLÀNGÀ\E 4 N,IBÀÀI ÀIBÀNDJI 10 1 12 )) NIUNGO RIYE]T I-ONG STRI]ET BÀNGO YOKE ISO\\'8, RIYE,R KOI]E, RI\IE,R B.\FIA -) 4IKILI\X4NDI EKOXIBE BONII -) 16 Tableau 8 : Listc des échantillons de microfilaires MAI-AWI CAMEROUN \,,\OUND]] BI],LI-E IIIYE,R KOÀIBONI \III,LAGE Tableau 9: Liste de matériels remis à l"'Equipc Epi"(APOC;* Désignation Nombre Ttansfolmateul TGIJM 'l-ransformateur Wild f'tansformateur TII3 Transfotmateur TI{2 7 4 6 1 Lampc Olyrnpus 3 Porte Âmpoule Câble électrique pour loupe Pipette Ependorf 25UL I)rpctte Ependorf 100 LJL l) lateaux émarllés 11101161 Plateaux Chromés rno),en Plateaux érnaillés gros blanc 6 12 1 -) 10 1 -) Platcaux érrraillés gros noir' Prpette Pasteur 500 l)ortc I-ame Porte tube 1 02 Bortes 2 4 Embout Ependorf 10 Bottes Mrcro Tit ration Oculaue Borte à instrurrents Peut 21, 6 JBoite à instmments Grand Dr Adjarni - Rapport d'Engagement de Conseiller Temporaire 0411012012 -28llll20l2 OMS/APOC Page 819 Désignation Nombre Porte Pipette Gibson 2 Lames Cerclées de 12 13 boites Pinces Forceps Peuts Pinces Forceps Grands 32 10 clseaux Pinces à Sutute Âmpoules Phtlrp 1B 27 13 Borte Ilarriot Sachets mini gtip Pmce à biopsres 1 01 boite 106 Loupes §7ild M7 .) -) 2 2 4 6 7 2 Loupes Olympus SZ40 Loupes Olympus SZ Loupcs M2 Base sans rallongc Wild Carsses IIDAK A5 Carsscs IIDAK A4 Cocottes- rr-rinute (*) Matériels consignés par le Magasinier APOC et remis à Mr Coulibaly Siaka / Technicien Épidémiologiste APOC Dr Adjami - Rapport d'Engagement de Conseiller Temporaire 0411012012 -28llll20l2 _ OMS/APOC Page 9/9