2012, 87, 153–160
No. 16
Weekly epidemiological record Relevé épidémiologique hebdomadaire 20 april 2012, 87th year / 20 avril 2012, 87e année No. 16, 2012, 87, 153–160 http://www.who.int/wer
Contents 153 Tracking progress towards global polio eradication, 2010–2011
Tracking progress towards global polio eradication, 2010–2011 In January 2012, polio eradication was declared a “programmatic emergency for global public health” by the Executive Board of WHO.1 Since the Global Polio Eradication Initiative (GPEI) began in 1988,2 progress has been tracked by surveillance of acute flaccid paralysis (AFP) cases and testing of linked faecal specimens for polioviruses in WHO-accredited Global Polio Laboratory Network (GPLN) laboratories, complemented by sewage testing (environmental surveillance) in selected areas. Monitoring the quality of AFP surveillance at national and subnational administrative levels using standard performance indicators identifies potential gaps where circulation may go undetected; monitoring the timeliness of specimen transport and laboratory reporting identifies areas where reporting delays could potentially lead to late response and ongoing transmission. This report provides an updated assessment3 for 2010–2011 of performance indicators for AFP surveillance at national/subnational levels in polio-affected countries and laboratory reporting at the regional level. Overall, 16 of 26 (62%) countries with circulating wild poliovirus (WPV) met national AFP surveillance indicator targets during both 2010 and 2011. In the 3 countries with re-established WPV transmission and in 16 of 19 countries with WPV outbreaks, significant proportions (>20%) of the population live in areas with underperforming surveillance during 2010 or 2011. Targets for timely reporting of poliovirus isolation and type characterization results were met in 3 of 6 WHO Regions in 2010 and 5 Regions in 1
Suivi des progrès accomplis en vue de l’éradication mondiale de la poliomyélite, 2010-2011 En janvier 2012, le Conseil exécutif de l’OMS a déclaré que l’éradication de la poliomyélite constituait une «urgence programmatique pour la santé publique mondiale».1 Depuis le lancement de l’Initiative mondiale pour l’éradication de la poliomyélite (IMEP) en 1988,2 les progrès sont suivis au moyen d’un dispositif de surveillance des cas de paralysie flasque aiguë (PFA) et d’analyses d’échantillons de selles provenant de tels cas qui sont pratiquées, à la recherche de poliovirus, dans des établissements du Réseau mondial de laboratoires pour la poliomyélite (RMLP) accrédités par l’OMS, à quoi s’ajoutent des analyses des eaux usées (surveillance de l’environnement) dans certaines zones. Le contrôle de la qualité de la surveillance de la PFA aux niveaux administratifs national et infranational à l’aide d’indicateurs de résultats normalisés permet de repérer d’éventuelles lacunes susceptibles d’empêcher la détection de la circulation du poliovirus; par ailleurs, le contrôle des délais de transport des échantillons et de communication des résultats des analyses de laboratoire permet d’identifier les zones où des retards dans la notification de cas pourraient retarder la riposte et laisser la transmission se poursuivre. Le présent rapport fournit une évaluation actualisée,3 pour 20102011, des indicateurs de résultats concernant la surveillance de la PFA aux niveaux national/ infrational dans les pays touchés par la poliomyélite et la communication des résultats des analyses de laboratoire au niveau régional. Au total, 16 des 26 pays (62%) où le poliovirus sauvage (PVS) circule ont atteint les cibles des indicateurs de surveillance de la PFA en 2010 comme en 2011. Dans les 3 pays où la transmission du PVS est rétablie et dans 16 des 19 pays confrontés à des flambées dues au PVS, 1
Sommaire 153 Suivi des progrès accomplis en vue de l’éradication mondiale de la poliomyélite, 2010-2011
World Health Organization Geneva Organisation mondiale de la Santé Genève Annual subscription / Abonnement annuel Sw. fr. / Fr. s. 346.– 04.2012 ISSN 0049-8114 Printed in Switzerland
World Health Organization Executive Board. Poliomyelitis: intensification of the global eradication initiative. Available from http://apps.who.int/gb/ebwha/pdf_files/eb130/b130_ r10-en.pdf, accessed 10 April 2012. See No. 20, 2011, pp. 199–204. See No. 16, 2011, pp. 153–160.
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Conseil exécutif de l’Organisation mondiale de la Santé. Poliomyélite: intensification de l’Initiative mondiale pour l’éradication de la poliomyélite. 2012 (accessible à l’adresse http://apps.who.int/gb/ ebwha/pdf_files/eb130/b130_r10-en.pdf, consultée le 27 mars 2012). Voir No 20, 2011, p. 199 à 204 Voir No 16, 2011, p. 153 à 160. 153
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2011. To achieve polio eradication, efforts are needed to improve AFP surveillance quality and laboratory performance.
une proportion importante de la population (>20%) vit dans des zones où la surveillance n’a pas été suffisamment efficace en 2010 ou en 2011. Les cibles fixées pour les délais de communication des résultats de l’isolement des poliovirus et de la caractérisation des types ont été atteintes dans 3 des 6 Régions de l’OMS en 2010 et dans 5 Régions en 2011. L’éradication complète de la poliomyélite exige que l’on s’attache à améliorer la qualité de la surveillance de la PFA et le bon niveau des résultats de laboratoire.
AFP surveillance AFP surveillance detects paralytic illness due to many causes, including paralytic poliomyelitis caused by WPV. The objectives of AFP surveillance are to identify areas with poliovirus transmission, as well as areas with low AFP reporting where poliomyelitis cases might go undetected. AFP surveillance sensitivity is measured by the annual proportion of AFP cases negative for WPV among children <15 years (the non-polio AFP [NPAFP] rate). Adequacy of stool sample collection is measured by the proportion of AFP cases from which 2 adequate stool specimens were collected (≥24 hours apart and within 14 days following onset of paralysis) and arrived in good condition at a GPLN laboratory. The WHO Region of the Americas, the Western Pacific Region and European Region have been certified as polio-free. However, 4 countries in the European Region (Kazakhstan, Tajikistan, Turkmenistan and the Russian Federation) experienced WPV outbreaks in 2010, and China in the Western Pacific Region experienced an outbreak in 2011. Collectively, the polio-free Regions maintained overall AFP surveillance sensitivity at the WHO-specified target NPAFP rate of ≥1 case per 100 000 children, and all but the Region of the Americas met the WHO-specified target of ≥80% AFP cases with adequate stool specimens at the regional level during 2010 and 2011 (Table 1). During 2010–2011, 21 countries in the African, Eastern Mediterranean and South-East Asian Regions experienced WPV transmission. Endemic WPV transmission continued in Afghanistan, Nigeria and Pakistan. As of February 2012, endemic WPV transmission has ceased in India, with 42 WPV cases reported in 2010, 1 case reported in January 2011 and no cases reported since then.4, 5 Re-established transmission continued in the previously polio-free countries of Angola, Chad and the Democratic Republic of the Congo (DRC),6 and WPV outbreaks occurred in 13 African countries and Nepal during 2010–2011 (Table 1). A target NPAFP rate of ≥2 cases per 100 000 children has been established in the polio-endemic regions, in all countries reporting WPV cases, as well as in neighbouring countries at risk of WPV outbreaks.7 The 3 Regions which included
Surveillance de la PFA La surveillance de la PFA permet de détecter les pathologies paralytiques de causes multiples, dont la poliomyélite paralytique provoquée par le PVS. La surveillance de la PFA a pour objectif de repérer les zones où il y a transmission du poliovirus, ainsi que celles où le signalement des cas de PFA laisse à désirer et où des cas de poliomyélite pourraient ainsi passer inaperçus. On mesure la sensibilité de la surveillance de la PFA à la proportion annuelle de cas de PFA négatifs pour le PVS chez les enfants de <15 ans (taux de PFA non poliomyélitique). Pour apprécier si le recueil d’échantillons de selles est effectué correctement, on note la proportion de cas de PFA pour lesquels 2 échantillons adéquats ont été prélevés (à ≥24 heures d’intervalle et dans les 14 jours suivant le début de la paralysie) et sont parvenus à un laboratoire du RMLP en bon état. Les Régions OMS des Amériques, du Pacifique occidental et de l’Europe ont été certifiées exemptes de poliomyélite. Toutefois, 4 pays de la Région européenne (Fédération de Russie, Kazakhstan, Tadjikistan et Turkménistan) ont connu en 2010 des flambées dues au PVS et, dans la Région du Pacifique occidental, la Chine a subi une flambée en 2011. Collectivement, les régions exemptes de poliomyélite ont maintenu la sensibilité globale de la surveillance de la PFA à ≥1 cas de PFA non paralytique pour 100 000 enfants, cible fixée par l’OMS, et toutes, à l’exception de la Région des Amériques, ont atteint en 2010 et en 2011 l’autre cible fixée par l’OMS au niveau régional, à savoir le recueil d’échantillons de selles adéquats dans ≥80% des cas de PFA (Tableau 1). En 2010-2011, il y a eu transmission du PVS dans 21 pays des Régions OMS de l’Afrique, de la Méditerranée orientale et de l’Asie du Sud-Est. La transmission endémique du PVS a persisté en Afghanistan, au Nigéria et au Pakistan. À la date de février 2012, la transmission du PVS a cessé d’être endémique en Inde, où 42 cas ont été signalés en 2010 et 1 en janvier 2011, mais où aucun cas n’a été notifié depuis.4, 5 La transmission rétablie a persisté en Angola, en République démocratique du Congo (RDC) et au Tchad, pays précédemment exempts de poliomyélite,6 et des flambées dues au PVS sont survenues dans 13 pays d’Afrique et au Népal en 2010-2011 (Tableau 1). Une cible de ≥2 cas de PFA non poliomyélitique pour 100 000 enfants a été fixée pour les régions d’endémie, pour tous les pays déclarant des cas de PVS, ainsi que pour les pays voisins exposés au risque de flambées dues au PVS.7 Les 3 Régions comprenant des pays d’endémie ont atteint en 2010 et 2011 les taux requis
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See No. 45, 2011, pp. 501–507. Global Polio Eradication Initiative: three to go…. World Health Organization, Geneva, Switzerland. Available at http://www.polioeradication.org/tabid/461/iid/201/default.aspx, accessed 16 March 2012. See No. 12, 2012, pp. 109–115. See No. 47, 2005, pp. 410–416.
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Voir No 45, 2011, p. 501 à 507. Global Polio Eradication Initiative: three to go … ,Organisation mondiale de la Santé, Genève, Suisse (accessible à l’adresse http://apps.who.int/gb/ebwha/pdf_files/eb130/b130_r10-en.pdf, consultée le 10 avril 2012). Voir No 12, 2012, p. 109 à 115. Voir No 47, 2005, p. 410 à 416. Weekly epidemiological record, No. 16, 20 april 2012
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Table 1 National and subnational AFP surveillance indicators and number of confirmed WPV cases, by WHO Region and polio-affected country, 2010 and 2011a Tableau 1 Indicateurs nationaux et infranationaux de la surveillance de la PFA et nombre de cas confirmés dus au PVS, par Région de l’OMS et par pays touché par la poliomyélite, 2010 et 2011a releve epidemiologique hebdomadaire, No 16, 20 avril 2012 155 2010 % subnational areas with NPAFP National rate ≥2d – % No. of AFP NPAFP c de zones rate cases – Nb – Taux natio- infra-natiode cas de nal de cas de nales avec PFA PFA NPc un taux de PFA non poliomyélitique ≥2d National % of AFP cases with adequate specimense – % national de cas de PFA avec échantillons adéquatse % subnational areas with ≥80% adequate specimens – % de zones infranationales avec ≥80% d’échantillons adéquats % population in areas meeting both indica- No. of WPV tors – % de cases – Nb la popula- de cas dus tion dans les au PVS zones répondant aux 2 indicateurs 2011 National % of AFP cases with adequate specimense – % national de cas de PFA avec échantillons adéquatse % subnational areas with ≥80% adequate specimens – % de zones infranationales avec ≥80% d’échantillons de selles adéquats % population in areas meeting both indica- No. of WPV tors – % de cases – Nb la popula- de cas dus tion dans les au PVS zones répondant aux 2 indicateurs
WHO Regionb/country – Région OMSb/pays
% of subnational areas National with NPAFP No. of AFP NPAFP ratec rate 2d – % cases – Nb – Taux natio- de ≥ zones de cas de nal de cas de infranatioPFA PFA NP nales avec un taux de PFA NP≥2d
Americas – Amériques African – Afrique Angolaf Central African Republicg – République centrafricaineg Chad f – Tchadf Congog Côte d’Ivoireg DRCf – RDCf Gabong Guineag – Guinéeg Kenyag Liberiag – Libériag Malig Mauritaniag – Mauritanieg Nigerg Nigeriah – Nigériah Senegalg – Sénégalg Sierra Leoneg Ugandag – Ougandag Eastern Mediterranean – Méditerranée orientale Afghanistanh Pakistanh European – Europe Kazakhstang – Kazakhstang Russian Federationg – Fédération de Russieg Tajikistang – Tadjikistang Turkmenistang – Turkménistang South-East Asian – Asie du Sud-Est Indiah – Indeh Nepalg Western Pacific – Pacifique occidental Chinag – Chineg Total
2006 16 500 387 137 302 582 309 2 194 24 215 403 50 171 65 358 5 996 312 168 424 11 338 1 572 5 392 2 087 112 387 583 50 60 456 55 785 604 6 401 5 285 98 788
1.2 4.3 3.1 7.2 4.5 5.1 3.3 5.5 2.7 4.0 2.2 2.8 2.2 4.4 4.4 7.9 5.3 6.3 2.9 5.6 8.8 6.7 1.2 3.5 1.7 5.3 3.2 11.2 12.4 5.4 1.8 2.0 5.6
– – 94 100 94 100 95 100 50 100 88 60 50 86 100 100 100 100 61 – 100 88 – 73 28 80 83 – 94 100 – – –
79 87 87 91 67 23 79 73 50 67 89 92 93 97 73 93 59 86 87 91 93 88 86 99 95 87 100 83 83 89 89 92 85
– – 89 86 17 27 53 18 30 13 100 79 100 100 25 100 9 75 75 – 97 100 – 100 93 80 100 – 76 80 – – –
– – 79 87 12 7 47 24 19 9 74 36 53 90 32 100 6 77 45 – 95 99 – 80 26 53 91 – 87 90 – – –
– 657 33 – 26 441 – 100 – – – 2 4 5 2 21 18 1 4 169 25 144 478 1 14 460 3 48 42 6 – – 1352
1 728 16 635 257 142 468 93 511 2 216 30 203 563 55 210 53 319 6 096 115 173 466 11 669 1 827 5 696 1 542 100 354 52 33 65 604 59 683 566 7 247 6 136 104 425
1.0 4.4 2.3 6.0 5.7 3.1 5.1 4.9 2.9 3.7 3.1 3.3 2.7 3.8 3.9 8.1 2.1 6.6 3.2 5.7 10.0 7.0 1.3 3.2 1.6 2.1 2.3 12.2 13.6 5.1 2.0 2.3 5.9
– – 56 100 100 60 95 100 0 100 88 40 100 100 88 100 55 100 53 – 100 100 – 93 28 60 50 – 91 100 – – –
78 88 91 81 75 75 64 79 60 68 83 85 84 92 73 93 79 83 87 90 92 88 86 97 93 96 100 85 84 89 90 94 86
– – 89 71 39 55 0 27 33 0 75 80 67 92 25 100 55 50 71 – 91 88 – 94 88 100 100 – 79 100 – 100 –
– – 43 68 33 20 0 34 10 0 49 34 64 90 20 100 38 57 41 – 91 95 – 88 18 69 32 – 87 100 – – –
– 350 5 4 132 1 36 93 1 3 1 – 7 – 5 62 – – – 278 80 198 – – – – – 1 1 – 21 21 650
DRC: Democratic Republic of the Congo. – RDC: République démocratique du Congo. a Data as of 21 February 2012. – Données au 21 février 2012. b Regional NPAFP rates use UNDP populations as denominators, so they tend to be higher than country rates, which use their own subnational populations as denominators. – – Pour les taux régionaux de PFA non poliomyélitique (NP), on a utilisé comme dénominateur les chiffres de population du PNUD, si bien que ces taux ont tendance à être plus élevés que les taux par pays, lesquels sont calculés avec comme dénominateur les chiffres des populations infranationales du pays considéré. c Per 100 000 persons aged <15 years. – Pour 100 000 personnes âgées de <15 ans. d For subnational areas (states/provinces) with populations >100 000. – Pour les zones infranationales (États/provinces) de >100 000 habitants. e Standard WHO target is adequate stool specimen collection from ≥80% of AFP cases, in which 2 specimens are collected within 14 days of paralysis onset collected ≥24 hours apart, shipped on ice or frozen ice packs and arriving in good condition at a WHO-accredited laboratory. Stool adequacy proportions from region, countries in the European Region and China, do not include the criteria of good stool condition. For the Americas, adequate specimen is one specimen collected within 14 days of paralysis onset. – – Cible fixée par l’OMS: recueil d’échantillons de selles adéquats dans ≥80% des cas de PFA, pour lesquels 2 échantillons sont prélevés dans les 14 jours suivant l’apparition de la paralysie et expédiés sur glace ou sur pack réfrigérant à un laboratoire accrédité par l’OMS, auquel ils parviennent en bon état. Pour les proportions régionales d’échantillons adéquats, les pays de la Région européenne et la Chine ne tiennent pas compte du critère de bon état des échantillons. Pour les Amériques, les termes « échantillon adéquat» se réfèrent à 1 échantillon prélevé dans les 14 jours suivant le début de la paralysie. f Countries with re-established WPV transmission. – Pays où la transmission du PVS est rétablie. g Countries with wild poliovirus outbreaks. – Pays confrontés à des flambées dues au poliovirus sauvage. h Countries with endemic wild poliovirus transmission. – Pays où la transmission du poliovirus sauvage est endémique.
polio-endemic countries met the ≥2 NPAFP rate and the ≥80% specimen adequacy regional targets during 2010 and 2011 (Table 1). Of 26 polio-affected countries, 24 (92%) met the ≥2 NPAFP rate target in both 2010 and 2011 (Table 1); 18 of the 26 (69%) polio-affected countries met the ≥80% target for the proportion of AFP cases with adequate stool samples in both 2010 and 2011 (Table 1). Among polio-affected countries, surveillance quality varied substantially at the subnational level (states/ provinces). A NPAFP rate of ≥2 in ≥80% of subnational areas was achieved in 19 (73%) countries in 2010, 16 (62%) countries in 2011, and 14 (54%) countries in both years (Table 1, Map 1). Meeting the standard of ≥80% specimen adequacy in ≥80% of subnational areas was achieved in 14 (54%) countries in 2010, 12 (46%) countries in 2011, and only 11 (42%) countries in both years (Table 1). The countries where ≥80% of the population lived in areas with AFP surveillance meeting targets during 2010 and 2011 included: all 4 countries with endemic WPV transmission; none of the 3 countries with re-established WPV transmission; and 3 of 19 countries with WPV outbreaks.
de ≥2 cas de PFA non poliomyélitique et de prélèvement d’échantillons de selles adéquats dans ≥80% des cas au niveau régional (Tableau 1). Sur les 26 pays touchés par la poliomyélite, 24 (92%) ont atteint la cible de ≥2 cas de PFA non poliomyélitique en 2010 comme en 2011 (Tableau 1); 18 pays sur 26 (69%) ont atteint pour les 2 années la cible fixant à ≥80% la proportion des cas de PFA avec prélèvement d’échantillons de selles adéquats (Tableau 1). Dans les pays touchés, on a observé des variations sensibles de la qualité de la surveillance au niveau infranational (États/ provinces). Le taux requis de ≥2 cas de PFA non poliomyélitique dans ≥80% des zones infranationales a été atteint dans 20 pays (80%) en 2010, 19 (73%) en 2011 et 16 (62%) pour les 2 années (Tableau 1, Carte 1). La norme prévoyant ≥80% d’échantillons adéquats dans ≥80% des zones infranationales a été atteinte dans 14 pays (54%) en 2010, 12 (46%) en 2011 et seulement 11 (42%) pour les 2 années (Tableau 1). En ce qui concerne la cible fixant à ≥80% la proportion de la population vivant dans des zones qui satisfont aux normes en matière de surveillance des cas de PFA, on notera qu’en 2010 et en 2011, elle a été atteinte par les 4 pays où la transmission du PVS est endémique et par 3 des 19 pays touchés par des flambées dues au PVS, mais qu’elle n’a été atteinte par aucun des 3 pays où la transmission du PVS est rétablie.
Global Polio Laboratory Network (GPLN) The GPLN, established in 1990 by WHO, comprises 146 laboratories in 97 countries. Accredited members in the network follow standardized protocols and procedures appropriate for each laboratory tier: (i) isolation and identification of polioviruses; (ii) intratypic differentiation of the 3 (1, 2, and 3) WPV serotypes, Sabin vaccine-related polioviruses, and vaccine-derived polioviruses (VDPVs);8 and (iii) genomic sequencing of the VP1 region of WPVs and VDPVs to investigate transmission links among isolates. The laboratory performance standard for 5 of the 6 WHO Regions is to report poliovirus isolation results for ≥80% of specimens within 14 days of receipt; in 2011, the European Region and China (Western Pacific Region) maintained a standard of poliovirus isolation and serotyping within 28 days. Although the introduction of real-time polymerase chain reaction assays into laboratories allows intratypic differentiation testing within 7 days,9 the official standard in 5 WHO Regions for timely reporting of such results is within 60 days of paralysis onset, allowing time for case detection, investigation and transport of specimens. The Eastern Mediterranean Region introduced an intratypic differentiation reporting standard of 45 days.
Réseau mondial de laboratoires pour la poliomyélite Le RMLP, mis en place par l’OMS en 1990, comprend 146 établissements dans 97 pays. Les membres accrédités du réseau appliquent des protocoles et des procédures normalisés adaptés à chaque niveau de laboratoire: 1) isolement et caractérisation des poliovirus; 2) différenciation intratypique des 3 sérotypes de PVS (1, 2 et 3), des poliovirus apparentés à la souche Sabin et des poliovirus dérivés d’une souche vaccinale (PVDV);8 et 3) séquençage de la région VP1 du génome des PVS et des PVDV pour étudier les liens de transmission entre les isolements. La norme pour 5 des 6 Régions de l’OMS est que les laboratoires doivent communiquer les résultats de l’isolement des poliovirus dans ≥80% des échantillons dans les 14 jours suivant leur réception. En 2011, dans la Région européenne et en Chine (Région du Pacifique occidental), la norme de délai pour la communication des résultats de l’isolement et du sérotypage des poliovirus a été maintenue à 28 jours. Bien que l’introduction dans les laboratoires des techniques d’amplification génique en temps réel permette d’effectuer la différenciation intratypique dans un délai de 7 jours,9 le délai officiel de notification des résultats de ces analyses dans 5 des Régions de l’OMS est fixé à 60 jours à compter du début de la paralysie, cette norme tenant compte du temps nécessaire pour la détection des cas, leur investigation et le transport des échantillons. La Région de la Méditerranée orientale a quant à elle fixé à 45 jours le délai de communication des résultats de la différenciation intratypique. Les délais de communication des résultats de la détection des poliovirus ont été respectés dans 5 Régions de l’OMS en 2011, contre 4 en 2010, année où des retards sont intervenus lors de la flambée survenue en Europe en raison du traitement des échantillons par lots (Tableau 2). Cinq Régions de l’OMS ont respecté la norme prévoyant la communication des résultats de 8 9
Targets for timely reporting of poliovirus detection were met in 5 WHO Regions in 2011, compared with 4 WHO Regions in 2010 when delays occurred during the European outbreak due to batching of samples (Table 2). Five WHO Regions met the standard of reporting intratypic differentiation results within 60 days of 8 9
See No. 27, 2011, pp. 277-286. See No. 36, 2009, pp. 366-371.
Voir No 27, 2011, p. 277 à 286. Voir No 36, 2009, p. 366 à 371. Weekly epidemiological record, No. 16, 20 april 2012
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releve epidemiologique hebdomadaire, No 16, 20 avril 2012 157
Map 1 Combined performance indicators for the quality of AFP surveillance in subnational areas of 26 current or recently polio-affected countries and neighbouring countries 2011 Carte 1 Indicateurs combinés de la qualité de la surveillance de la PFA dans les régions des 26 pays qui sont ou ont été récemment touchés par la poliomyélite et dans les pays voisins, 2011
NPAFP rate ≥2 and specimen adequacy ≥80% – ≥2 cas de PFA non poliomyélitique et ≥80% d’échantillons adé quats NPAFP rate ≥2 and specimen adequacy <80% – ≥2 cas de PFA non poliomyélitique et <80% d’échantillons adéquats NPAFP rate <2 and specimen adequacy ≥80% – <2 cas de PFA non poliomyélitique et≥80% d’échantillons adéquats NPAFP rate <2and specimen adequacy <80% – <2 cas de PFA non poliomyélitique et <80% d’échantillons adéquats Provinces/states with population < 100 000 – Provinces/États de <100 000 habitants Provinces/states with no data or countries not considered – Provinces/États pour lesquels on ne dispose pas de données ou pays non comptabilisés
Table 2 Number of poliovirus isolates from stool specimens of AFP cases, and timing of results, by WHO Region, 2010 and 2011a Tableau 2 Nombre d’isolements de poliovirus à partir d’échantillons de selles provenant de cas de PFA et délais de communication des résultats, par Région de l’OMS, 2010 et 2011a 2010 % poliovirus isolation results No. of on timed speci– % de No. of poliovirus isolates – Nb mens – Nb résultats d’isolements de poliovirus d’échand’isoletillons ments de poliovirus dans les délaisd Wild – Sauvage Sabinb VDPVc – PVDVc 2011 % poliovirus isolation results on timed – % de résultats d’isolements de poliovirus dans les délaisd
WHO Region – Région OMS
% ITD results No. of within speci60 dayse – % de mens – Nb résultats d’échande la DIT tillons dans les 60 jourse
No. poliovirus isolates – Nb d’isolements de poliovirus
% ITD results within 60 dayse – % de résultats de la DIT dans les 60 jourse
Wild – Sauvage
Sabinb
VDPVc – PVDVc
African – Afrique Americas – Amériques Eastern Mediterranean – Méditerranée orientale European – Europe South-East Asia – Asie du Sud-Est Western Pacific – Pacifique occidental Total
34 689 1459 26 325 3 091 116 041 12 769 194 374
798 0 326 508 47 0 1679
2 535 30 981 93 3 329 255 7 223
166 0 9 0 12 1 188
95 79 92 75 94 95 94
72 100 92 100 99 80 92
36 942 1 762 23 011 3 188 127 543 14 453 206 899
1 035 0 512 0 2 21 1 570
2 476 36 807 87 4907 266 8 579
46 1 17 0 15 7 86
91 61 98 96 97 97 95
86 –f 97 99 98 86 94
ITD = intratypic differentiation. – DIT = Différenciation intratypique. a b
Data as of 26 March 2012. – Données au 26 mars 2012. Either concordant Sabin-like results in ITD tests and VDPV screening, or <1% sequence difference compared with Sabin vaccine virus. – Concordance avec le type Sabin dans les tests de DIT et de recherche de PVDV, ou divergence de séquence <1% par rapport à la souche Sabin.
c
For poliovirus types 1 and 3, ≥10 VP1 nucleotides difference from the respective Sabin poliovirus; for poliovirus type 2, ≥6 VP1 nucleotides difference from Sabin type 2 poliovirus. – Pour les poliovirus de types 1 et 3, différence de ≥10 nucléotides dans la région VP1 par rapport aux poliovirus Sabin correspondants; pour le poliovirus de type 2, différence de ≥6 nucléotides dans la région VP1 par rapport au poliovirus Sabin de type 2. Results reported within 14 days for laboratories in the following WHO regions: African, Americas, Eastern Mediterranean, South-East Asian and Western Pacific (excepted China) regions; reported within 28 days for the European Region and China (Western Pacific Region). – Résultats communiqués dans les 14 jours pour les laboratoires des Régions de l’OMS suivantes: Afrique, Amériques, Méditerranée orientale, Asie du Sud-Est et Pacifique occidental (à l’exception de la Chine); résultats communiqués dans les 28 jours pour la Région européenne et la Chine (Région du Pacifique occidental).
d
e
Results reported within 60 days of paralysis onset for all WHO regions except Eastern Mediterranean Region, which is within 45 days of paralysis onset. – Résultats communiqués dans les 60 jours suivant l’apparition de la paralysie pour toutes les Régions de l’OMS à l’exception de la Région de la Méditerranée orientale, pour laquelle le délai est de 45 jours suivant le début de la paralysie.
f
ITD reporting results from the Region of the Americas were unavailable as of March 26, 2012. – Les résultats des tests de DIT concernant la Région des Amériques n’étaient pas disponibles au 26 mars 2012.
paralysis onset for ≥80% of specimens for both 2010 and 2011 (Table 2). The Region of the Americas was the only Region that did not meet either of the timeliness standards in 2011. GPLN tested 206 899 stool specimens from AFP case investigations in 2011, an increase of 6% over the 194 374 stool specimens tested in 2010. A total of 10 235 poliovirus isolates (including 1570 WPVs and 86 VDPVs) were detected in 2011 from AFP case specimens, an increase of 13% over the 9090 poliovirus isolates (including 1679 WPVs and 188 VDPVs) in 2010. During 2010– 2011, 274 (1.7%) of the 16 076 vaccine-related viruses screened were determined by genomic sequencing to be VDPVs (Table 2). Genomic sequencing identified 3 genotypes in the African Region during 2011: WPV1 West Africa-B (WEAF-B) in Chad, Central African Republic, Kenya, Niger and Nigeria; WPV3 WEAF-B in Chad, Côte d’Ivoire, Guinea, Mali and Nigeria; and WPV1 South 158
la différenciation intratypique dans les 60 jours suivant l’apparition de la paralysie dans ≥80% des échantillons en 2010 comme en 2011 (Tableau 2). La Région des Amériques est la seule à n’avoir respecté aucune des 2 normes en matière de délai en 2011. Le RMLP a analysé 206 899 échantillons de selles provenant de l’investigation de cas de PFA en 2011, soit une augmentation de 6% par rapport aux 194 374 échantillons analysés en 2010. Au total, 10 235 isolements de poliovirus (dont 1 570 PVS et 86 PVDV) ont été détectés en 2011dans des échantillons provenant de cas de PFA, soit une augmentation de 13% par rapport aux 9090 isolements de 2010 (dont 1679 PVS et 188 PVDV). En 2010-2011, le séquençage génomique a permis de déterminer que 274 (1,7%) des 16 076 virus apparentés à une souche vaccinale détectés étaient des PVDV (Tableau 2). Le séquençage génomique a permis d’identifier 3 génotypes dans la Région africaine en 2011: West Africa-B (WEAF-B) pour le PVS de type 1 au Tchad, au Kenya, au Niger, au Nigéria et en République centrafricaine; WEAF-B pour le PVS de type 3 au Tchad, en Côte Weekly epidemiological record, No. 16, 20 april 2012
Asia (SOAS) in Angola, Congo, DRC and Gabon. In the Eastern Mediterranean Region, WPV3 SOAS isolates were detected in Pakistan, and WPV1 SOAS isolates were detected in Pakistan and Afghanistan. Sequence analysis provided evidence that AFP surveillance of varying quality had missed chains of WPV transmission during 2011 in Afghanistan, Angola, Chad, Côte d’Ivoire, Kenya, Mali, Nigeria and Pakistan.
d’Ivoire, en Guinée, au Mali et au Nigéria; et South Asia (SOAS) pour le PVS de type 1 en Angola, au Congo, au Gabon et en RDC. Dans la Région de la Méditerranée orientale, des isolements de SOAS ont été détectés pour le PVS de type 3 au Pakistan, ainsi que pour le PVS de type 1 au Pakistan et en Afghanistan. L’analyse des séquences a montré qu’en 2011, certaines chaînes de transmission du PVS avaient échappé à la surveillance de la PFA, dont la qualité est variable, en Afghanistan, en Angola, en Côte d’Ivoire, au Kenya, au Mali, au Nigéria, au Pakistan et au Tchad.
Environmental surveillance During 2010–2011, environmental surveillance of WPV transmission was accomplished through testing of sewage samples10 in 21 countries without active poliovirus transmission (20 counties in the European Region, and Egypt in the Eastern Mediterranean Region) and 3 countries with WPV transmission (India, Nigeria and Pakistan). In India, sewage sampling was expanded from 10 sites in 2 states in 2010 to 15 sites in 4 states in 2011. The last detected WPV from sewage testing in India was in November 20104. In Pakistan (18 sites in 4 states), widespread WPV1 circulation was detected in sewage during 2010–2011; WPV3 has not been detected in sewage since October 2010. Sewage testing in Nigeria began in 2011 (3 sites in Kano state) and detected only cVDPVs (and no WPVs) during 2011, despite the continued occurrence of WPV cases.3
Surveillance de l’environnement En 2010-2011, une surveillance environnementale de la transmission du PVS a été pratiquée au moyen de l’analyse d’échantillons d’eaux usées10 dans 21 pays où il n’y a pas transmission active du poliovirus (20 pays de la Région européenne et Égypte, dans la Région de la Méditerranée orientale) et 3 pays où il y a transmission du PVS (Inde, Nigéria et Pakistan). En Inde, le prélèvement d’échantillons d’eaux usées, effectué sur 10 sites dans 2 États en 2010, a été étendu à 15 sites dans 4 États en 2011. En Inde, le dernier cas de PVS détecté à partir de l’analyse d’eaux usées remonte à novembre 2010.4 Au Pakistan (18 sites dans 4 États), une circulation de PVS de type 1 à grande échelle a été détectée dans les eaux usées en 2010-2011; la présence de PVS de type 3 n’a pas été détectée dans les eaux usées depuis octobre 2010. Au Nigéria, où l’analyse des eaux usées a commencé en 2011 (3 sites dans l’État de Kano), on n’a pu détecter par ce moyen que des PVDV circulants (pas des PVS) alors même que des cas dus au PVS continuent de survenir.3
Editorial note The GPEI relies on sensitive AFP surveillance, complemented by environmental surveillance and virological testing and sequencing, to track the transmission of polioviruses globally. Standardized case definitions, protocols for case investigation and laboratory testing, as well as surveillance performance indicators, allow comparability across countries and WHO Regions. Assessing subnational surveillance indicators is important because national indicators can mask substantial gaps in surveillance quality. Performance of AFP surveillance across polio-affected countries during 2010–2011 was varied, with some key countries not meeting indicator targets. Genomic sequence analysis of WPV isolates provided evidence that several chains of transmission were missed due to deficiencies in AFP surveillance during 2010–2011, including in some countries where subnational performance standards were met. Among countries with re-established transmission, Angola had subnational gaps in NPAFP detection which worsened from 2010 to 2011; although Chad and DRC struggled to attain subnational stool adequacy standards in both years, both showed slight improvement from 2010 to 2011. Countries with WPV outbreaks also had surveillance gaps: in 12 of 19 (63%) countries the majority of their popu-
Note de la rédaction L’IMEP s’appuie sur une surveillance sensible de la PFA, complétée par une surveillance de l’environnement, des analyses virologiques et des séquençages, pour suivre la transmission des poliovirus dans le monde. La normalisation des définitions de cas, des protocoles d’investigation des cas et des analyses de laboratoire, et les indicateurs d’efficacité de la surveillance mis en place, permettent d’établir des comparaisons entre les pays et les Régions de l’OMS. Il est important d’évaluer les indicateurs de la surveillance au niveau local car les indicateurs nationaux peuvent masquer d’importantes lacunes dans la qualité de la surveillance. L’efficacité de la surveillance de la PFA dans les pays touchés par la poliomyélite en 2010 2011 a été variable, certains des principaux pays concernés n’atteignant pas les indicateurs cibles. L’analyse des séquences génomiques des isolements de PVS a apporté la preuve que plusieurs chaînes de transmission n’avaient pas été repérées en 2010-2011 du fait de carences dans la surveillance de la PFA, y compris dans certains pays où les normes d’efficacité à l’échelle locale avaient été atteintes. Pour ce qui est des pays où la transmission est rétablie, on notera qu’en Angola, le dispositif de détection de la PFA non poliomyélitique présentait des lacunes au niveau local, qui se sont encore aggravées en 2011 par rapport à 2010; bien que le Tchad et la RDC aient déployé des efforts considérables au cours des 2 années considérées pour satisfaire aux normes relatives aux échantillons de selles adéquats au niveau local, les progrès enre-
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Deshpande, JM, Shetty, SJ and Siddiqui, ZA. Environmental surveillance system to track wild poliovirus transmission. Applied and Environmental Microbiology, 2003. 69(5): 2919–2927.
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Deshpande, JM, Shetty, SJ and Siddiqui, ZA. Environmental surveillance system to track wild poliovirus transmission. Applied and Environmental Microbiology, 2003, 69(5): 2919–2927. 159
releve epidemiologique hebdomadaire, No 16, 20 avril 2012
lations resided in subnational areas with poor AFP surveillance in either 2010 or 2011. The clustering of states/ provinces with substandard surveillance indicators within countries and across borders (as seen in Central and West Africa) is also of concern. Detailed AFP field surveillance reviews are being conducted or planned in countries with suboptimal surveillance indicators, or with evidence of missed WPV transmission from genomic sequence analysis, to assess reasons for poor performance in AFP case detection, specimen collection and reporting, and to make recommendations for improving surveillance quality.
gistrés par ces 2 pays de 2010 à 2011 ont été faibles. Des déficits de surveillance ont également été observés dans des pays confrontés à des flambées dues au PVS: dans 12 des 19 pays concernés (63%), la majorité de la population vivait dans des zones où la surveillance de la PFA laissait à désirer en 2010 ou en 2011. L’existence de groupes d’États/de provinces au sein d’un même pays ou de zones transnationales (comme on peut l’observer en Afrique centrale et en Afrique de l’Ouest) présentant des indicateurs de surveillance inférieurs aux normes constitue également un sujet de préoccupation. Des examens approfondis du dispositif de surveillance de la PFA sur le terrain sont actuellement effectués ou prévus dans les pays où les indicateurs de la surveillance sont relativement médiocres ou ceux où l’analyse des séquences génomiques a montré que la transmission du PVS n’avait pas été détectée, le but étant de cerner les raisons pour lesquelles la détection des cas de PFA, le recueil d’échantillons et la notification des résultats laissent à désirer et de formuler des recommandations en vue d’améliorer la qualité de la surveillance. Associée à une surveillance sensible de la PFA, la surveillance de l’environnement a fourni des éléments complémentaires pour vérifier qu’il n’y avait pas transmission du PVS en Inde et contrôler l’ampleur de la transmission au Pakistan. Toutefois, l’absence de PVS dans les eaux usées n’exclut pas qu’il y ait transmission si la surveillance environnementale ne couvre pas les zones et les populations pour lesquelles le risque de transmission est le plus grand. Cette surveillance pourrait être élargie dans les pays où la transmission silencieuse du poliovirus est préoccupante et dans ceux où le risque d’importation est élevé. Des études de faisabilité sont prévues à Luanda (Angola) et à Nairobi (Kenya). Le bilan d’ensemble de l’action du RMLP pendant la période 2010-2011 demeure très positif et il s’est même amélioré en 2011, bien que la charge de travail du réseau ne cesse de s’alourdir (9% en 20103 et 6% en 2011). Plus de 90% des résultats de l’isolement des poliovirus et de la différentiation intratypique ont été communiqués dans les délais prévus. La prompte notification des résultats des analyses de laboratoire permet d’intervenir plus rapidement et de manière ciblée. Dans la Région africaine, les difficultés liées au transport international des échantillons,3 lequel représente une gageure permanente, font qu’il est plus malaisé de pratiquer la différentiation intratypique des poliovirus dans les délais fixés. Pour achever l’éradication de la poliomyélite, les programmes nationaux de vaccination et les partenaires devraient redoubler d’efforts pour renforcer la surveillance de la poliomyélite et améliorer le suivi à tous les échelons administratifs, en particulier dans les pays touchés par la maladie et dans les pays voisins exposés au risque de flambées. Les données disponibles semblent aussi indiquer qu’il est indispensable de maintenir un dispositif de surveillance de la PFA performant dans les régions exemptes de poliomyélite. Les efforts à fournir requièrent des engagements accrus à tous les niveaux et la mobilisation de ressources humaines et financières suffisantes pour atteindre les indicateurs cibles tant à l’échelle nationale qu’à l’échelle locale. Accès WWW • http://www.who.int/wer Courrier électronique • envoyer message subscribe wer-reh à listserv@who.int Fax: +41-(0)22 791 48 21/791 42 85 Contact: wantzc@who.int ou wer@who.int Weekly epidemiological record, No. 16, 20 april 2012
Combined with sensitive AFP surveillance, environmental surveillance has provided additional evidence to monitor the absence of WPV transmission in India and the extent of WPV transmission in Pakistan. However, a lack of WPV detection in sewage does not exclude the possibility of ongoing transmission if areas and populations at highest risk for WPV transmission are not sampled. Environmental surveillance could be expanded in countries where silent transmission is a concern or where importation risk is high. Feasibility assessments in Luanda, Angola and Nairobi, Kenya are planned. GPLN overall performance remained high during 2010– 2011, and actually improved in 2011, despite continued yearly increases in workload (9% in 20103 and 6% in 2011). Over 90% of poliovirus isolation and intratypic differentiation results were reported within the target periods. The prompt provision of laboratory test results allows a more rapid and well-targeted response. Timely intratypic differentiation of polioviruses in the African Region has been complicated by difficulties in international specimen transport,3 which is a challenge that needs to be continually addressed. To achieve polio eradication, national immunization programmes and partners should make greater efforts to strengthen polio surveillance and to improve monitoring at all administrative levels, especially in polioaffected countries and neighbouring countries at risk of outbreaks. Evidence also suggests that maintenance of high quality AFP surveillance in polio-free regions is critical. These efforts require strengthened commitments on all levels and the provision of sufficient human and financial resources to meet target indicators at both national and subnational levels.
WWW access • http://www.who.int/wer E-mail • send message subscribe wer-reh to listserv@who.int Fax: (+4122) 791 48 21/791 42 85 Contact: wantzc@who.int or wer@who.int 160