Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness February 2013 The development of representative candidate influenza vaccine viruses, coordinated by WHO, remains an essential component of the overall global strategy for pandemic preparedness. Comparisons of the candidate vaccine viruses with respect to antigenicity and their relationship to newly emerging viruses are ongoing and will be reported periodically by WHO.
Caractéristiques génétiques et antigéniques des virus grippaux zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats en vue de la préparation à une pandémie Février 2013 La mise au point de virus vaccinaux candidats représentatifs, coordonnée par l’OMS, reste une composante essentielle de la stratégie mondiale de préparation à une pandémie grippale. Les comparaisons entre virus vaccinaux candidats sous l’angle de l’antigénicité et de la parenté avec les nouveaux virus émergents se poursuivent et l’OMS en rendra compte périodiquement.
(1) Influenza A(H5N1) Since their re-emergence in 2003, highly pathogenic avian influenza A(H5N1) viruses have become enzootic in some countries and continue to cause outbreaks in poultry as well as sporadic human infections. The A(H5N1) viruses have diversified both genetically and antigenically leading to the need for multiple candidate vaccine viruses for pandemic preparedness purposes. This summary provides updates on the characterization of A(H5N1) viruses isolated from birds and humans, and the current status of the development of influenza A(H5N1) candidate vaccine viruses. Influenza A(H5N1) activity: 19 September 2012–18 February 2013 A(H5N1) viruses have been detected in birds in Africa and Asia. Human infections have been reported to the WHO by Cambodia, China, Egypt and Indonesia, countries in which infections have also been detected in birds (Table 1). Antigenic and genetic characteristics of A(H5N1) viruses The nomenclature for phylogenetic relationships among the haemagglutinin (HA) genes of A(H5N1) viruses is defined in consultation with representatives of the WHO, the Food and Agriculture Organiza-
1) Grippe A(H5N1) Depuis leur réémergence en 2003, les virus de la grippe aviaire A(H5N1) hautement pathogène sont devenus enzootiques dans certains pays et continuent de provoquer des flambées chez les volailles et des infections sporadiques chez l’homme. Ces virus se sont diversifiés sur les plans génétique et antigénique, d’où la nécessité de mettre au point plusieurs virus vaccinaux candidats dans le cadre de la préparation à une pandémie. Le présent résumé fait le point sur la caractérisation des virus A(H5N1) isolés chez des oiseaux et chez l’homme et sur l’état d’avancement actuel de la préparation des virus vaccinaux candidats A(H5N1). Activité de la grippe A(H5N1): 19 septembre 2012 - 18 février 2013 Des virus A(H5N1) ont été détectés chez des oiseaux en Afrique et en Asie. Des infections humaines ont été notifiées à l’OMS par le Cambodge, la Chine, l’Égypte et l’Indonésie, pays où l’on a également recensé des cas d’infection chez les oiseaux (Tableau 1). Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux A(H5N1) La nomenclature des liens de parenté phylogénétique existant entre les gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) est définie en consultation avec des représentants de l’OMS, de l’Organisation des Nations Unies 117
World Health Organization Geneva Organisation mondiale de la Santé Genève Annual subscription / Abonnement annuel Sw. fr. / Fr. s. 346.– 03.2013 ISSN 0049-8114 Printed in Switzerland
Table 1 Recent A(H5N1) activity reported to international agencies Tableau 1 Activité récente de la grippe A(H5N1) signalée aux agences internationales Country, area or territory – Pays, zone ou territoire Bangladesh Bhutan – Bhoutan Cambodia – Cambodge China – Chine China, Hong Kong SAR – Hong Kong, Région administrative spéciale de la Chine Egypt – Égypte India – Inde Indonesia – Indonésie Nepal – Népal Viet Nam a
Host/source – Hôte/Source Poultry – Volailles Poultry – Volailles Poultry – Volailles Human (7)a – Humain (7)a Human (2)a – Humain (2)a Environmental – Environnemental Wild birds – Oiseaux sauvages Poultry – Volailles Human (2)a – Humain (2)a Poultry – Volailles Poultry – Volailles Human (1)a – Humain (1)a Poultry – Volailles Poultry – Volailles
Genetic clade – Clade génétique 2.3.2.1 2.3.2.1 1.1 1.1 2.3.4.2 2.3.2.1/2.3.4.2 2.3.2.1 2.2.1 2.2.1 2.3.2.1 2.3.2.1 Unknown – Inconnue 2.3.2.1 1.1/2.3.2.1
Numbers in parentheses denote number of human cases reported during this period. – Les chiffres entre parenthèses indiquent le nombre de cas humains notifiés au cours de cette période.
tion of the United Nations (FAO), the World Organisation for Animal Health (OIE) and academic institutions. The updated nomenclature report can be found on WHO web site.1 Viruses circulating and characterized from 19 September 2012 to 18 February 2013 belonged to the following clades. Clade 1.1 viruses were detected in poultry and humans in Cambodia and in poultry in Viet Nam. Genetic characterization of the HA genes showed that these viruses were closely related to viruses detected previously in these countries (Figure 1) and which had reduced haemagglutination inhibition (HI) titres to postinfection ferret antisera raised against available candidate vaccine viruses. Antigenic analysis is ongoing and an additional candidate vaccine virus will be selected to provide improved coverage of recent clade 1.1 viruses. Clade 2.2.1 viruses were detected in poultry and humans in Egypt. While antigenic information on these viruses is unavailable at this time, those genetically analysed to date were shown to be similar to clade 2.2.1 viruses detected in previous years. Clade 2.3.2.1 viruses were detected in birds and/or environmental samples in Bangladesh, Bhutan, China, India, Indonesia, Nepal and Viet Nam. This clade continues to diversify genetically. A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010-like viruses were detected in Viet Nam and Hong Kong, Special Administrative Region of China (Hong Kong SAR) and the majority reacted well with postinfection ferret antiserum raised against the A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010 candidate vaccine virus. A/Hubei/1/2010-like viruses were detected in Bangladesh, Bhutan, China, India, Nepal and Viet Nam with the majority reacting well with postinfection ferret antisera raised against available candidate vaccine viruses. Some A/Hubei/1/2010-like viruses from Viet 1
pour l’Alimentation et l’Agriculture (FAO), de l’Organisation mondiale de la Santé animale (OIE) et d’établissements d’enseignement supérieur. Le rapport portant sur l’actualisation de cette nomenclature est consultable sur le site Web de l’OMS.1 Les virus circulants et caractérisés entre le 19 septembre 2012 et le 18 février 2013 appartenaient aux clades suivants. Clade 1.1 Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles et des êtres humains au Cambodge et chez des volailles au Viet Nam. La caractérisation des gènes de l’hémagglutinine (HA) a montré que ces virus étaient étroitement apparentés à des virus précédemment détectés dans ces pays (Figure 1) et donnaient des titres d’anticorps réduits en présence de d’immunsérum de furet postinfection, obtenu après inoculation des virus vaccinaux candidats disponibles. L’analyse antigénique est en cours et un virus vaccinal candidat supplémentaire sera sélectionné pour améliorer la couverture de ce clade récemment constitué. Clade 2.2.1 Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles et des êtres humains en Égypte. Si les caractéristiques antigéniques de ces virus ne sont pas disponibles actuellement, les caractéristiques sur la plan génétique établies à ce jour étaient similaires à celles des virus du clade 2.2.1 détectés au cours des années précédentes. Clade 2.3.2.1 Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux et/ou dans des échantillons environnementaux au Bangladesh, au Bhoutan, en Chine, en Inde, en Indonésie, au Népal et au Viet Nam. Ce clade continue à se diversifier sur le plan génétique. Des virus analogues à A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010 ont été détectés au Viet Nam et dans la Région administrative spéciale de Hong Kong en Chine (RAS de Hong Kong) et la majorité d’entre eux ont bien réagi en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenu après inoculation du virus vaccinal candidat mis au point à partir de la souche A/ barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010. Des virus analogues à A/Hubei/1/2010 ont été détectés au Bangladesh, au Bhoutan, en Chine, en Inde, au Népal et au Viet Nam et la majorité d’entre eux réagissaient bien en présence d’immunsérum de furet postin1
Updated unified nomenclature system for the highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses. Geneva, World Health Organization, 2011 (http://www.who.int/ influenza/gisrs_laboratory/h5n1_nomenclature/en/, accessed February 2013).
Updated unified nomenclature system for the highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses. Genève, Organisation mondiale de la Santé, 2011 (http://www.who.int/ influenza/gisrs_laboratory/h5n1_nomenclature/en/, consulté en février 2013). Weekly epidemiological record, No. 11, 15 MARCH 2013
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Figure 1 Phylogenetic relationships of A(H5N1) clade 1.1 virus HA genes Figure 1 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 1.1
0.007
A/Chicken/Vietnam/CVVI-KH08/2012 A/Chicken/Vietnam/CVVI-KH07/2012 A/Chicken/Vietnam/CVVI-KH03/2012 A/Cambodia/V0219301/2011# A/chicken/Vietnam/V0131304/2011 A/chicken/Cambodia/008LC1/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-878/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-1188/2012 A/Vietnam/VP12-3/2012# A/Cambodia/X0123311/2013# A/Cambodia/X0123312/2013# A/duck/Cambodia/46W2M4/2013 A/Cambodia/W0112303/2012# A/heron/Cambodia/TM068/2011 A/Cambodia/V0813302/2011# A/chicken/Cambodia/089LC1/2011 A/chicken/Cambodia/089LC3/2011 A/Cambodia/V0719348/2011# A/marabou stork/Cambodia/TM068/2011 A/Cambodia/V0203306/2011# A/Cambodia/V0417301/2011# A/Cambodia/U0417030/2010# A/chicken/Vietnam/NCVD-775/2011 A/chicken/Bac Lieu Vietnam/BL-S12-1415/2009 A/duck/Bac Lieu Vietnam/BL-S9-1505/2009 A/duck/Can Tho Vietnam/CT-S3-190/2009 A/duck/Bac Lieu Vietnam/BL-S6-1320/2009 A/chicken/Vietnam/NCVD-359/2009 A/duck/Can Tho Vietnam/CT-S3-73/2009 A/chicken/Can Tho Vietnam/CT-S11-401/2010 A/duck/Bac Lieu Vietnam/BL-S4-1417/2009 A/duck/Vietnam/NCVD-363/2009 A/chicken/Vietnam/NCVD-879/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-784/2010 A/Cambodia/V0606311/2011# A/chicken/Vietnam/NCVD-779/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-876/2011 A/Cambodia/V0401301/2011# A/duck/Vietnam/NCVD-827/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-776/2011 A/muscovy duck/Vietnam/OIE-559/2011 A/Muscovy duck/Vietnam/33/2007 A/Muscovy duck/Vietnam/NCVD-5/2007 A/Cambodia/R0405050/2007# A/Vietnam/1194/2004# A/Cambodia/JP52a/2005# A/Vietnam/1203/2004#
The available candidate vaccine viruses are indicated in bold. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site.– Les virus vaccinaux candidats disponibles sont indiqués en caractères gras. Les virus humains sont repérés par (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site.
releve epidemiologique hebdomadaire, No 11, 15 mars 2013
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Nam, however, showed significant antigenic divergence from vaccine candidates and further characterization of this group is being conducted. A/Hong Kong/6841/2010like viruses were detected in Viet Nam and for the first time in Indonesia (Figure 2); these viruses react with postinfection ferret antisera raised against the candidate vaccine virus A/common magpie/Hong Kong/5052/2007 albeit with reduced titres (Table 2).
fection, obtenu après inoculation des virus vaccinaux candidats disponibles. Néanmoins, certains des virus analogues à A/ Hubei/1/2010 provenant du Viet Nam présentaient une divergence antigénique notable par rapport aux virus vaccinaux candidats et une caractérisation plus poussée de ce groupe est en cours. Des virus analogues à A/Hong Kong/6841/2010 ont été détectés au Viet Nam et pour la première fois en Indonésie (Figure 2); ces virus réagissent en présence d’immunsérum de furet postinfection, obtenu après inoculation du virus vaccinal candidat A/common magpie/Hong Kong/5052/2007, mais en donnant des titres réduits (Tableau 2). Clade 2.3.4.2 Des virus de ce clade ont été isolés chez des êtres humains dans la province chinoise du Guizhou. Ils étaient similaires sur le plan génétique à A/Guizhou/1/2012 (Figure 3) et donnait des titres d’IH réduits en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenu après inoculation des virus vaccinaux candidats préparés à partir des souches A/Anhui/1/2005 et A/chicken/Hong Kong/AP156/2008 (Tableau 3). Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H5N1) Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques disponibles, un nouveau virus vaccinal candidat analogue au virus /Guizhou/1/2013 du clade 2.3.4.2 est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H5N1) disponibles et proposés sont recensés dans le Tableau 4. D’après la propagation géographique, l’épidémiologie et les propriétés antigéniques et génétiques des virus A(H5N1) en certains lieux, les autorités nationales peuvent envisager d’utiliser un ou plusieurs de ces virus vaccinaux candidats pour produire des lots pilotes de vaccin, réaliser des essais cliniques ou d’autres activités relevant de la préparation à une pandémie. Les virus continuant d’évoluer, de nouveaux virus vaccinaux candidats A(H5N1) seront mis au point et annoncés à mesure qu’ils deviennent disponibles. Les institutions souhaitant recevoir ces virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse gisrs-whohq@who.int ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS. 2
Clade 2.3.4.2 viruses were isolated from humans in Guizhou province China. These viruses were genetically similar to A/Guizhou/1/2012 (Figure 3) and showed reduced HI titres with postinfection ferret antisera raised against the candidate vaccine viruses A/Anhui/1/2005 and A/chicken/Hong Kong/AP156/2008 (Table 3). Influenza A(H5N1) candidate vaccine viruses Based on the available antigenic, genetic and epidemiologic data, a new A/Guizhou/1/2013-like clade 2.3.4.2 candidate vaccine virus is proposed. The available and proposed candidate A(H5N1) vaccine viruses are listed in Table 4. On the basis of geographical spread, epidemiology and antigenic and genetic properties of the A(H5N1) viruses in particular locations, national authorities may consider the use of one or more of these candidate vaccine viruses for pilot lot vaccine production, clinical trials and other pandemic preparedness purposes. As the viruses continue to evolve, new A(H5N1) candidate vaccine viruses will be developed and announced as they become available. Institutions that wish to receive these candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO web site.2
(2) Influenza A(H9N2) Influenza A(H9N2) viruses are enzootic in poultry populations in parts of Africa, Asia and the Middle East. The majority of viruses that have been sequenced belong either to the G1 clade or the chicken/Beijing (Y280/G9) clade. Since 1998, when the first human infection was detected, the isolation of A(H9N2) viruses from humans and swine has been reported infrequently. In all human cases the associated disease symptoms have been mild and there has been no evidence of humanto-human transmission. Influenza A(H9N2) activity: 19 September 2012–18 February 2013 No human cases of A(H9N2) infections have been reported in this period. A(H9N2) viruses continue to be isolated from birds in many regions of the world. Influenza A(H9N2) candidate vaccine viruses Based on the current antigenic, genetic and epidemiological data, no new A(H9N2) candidate vaccine viruses 2
2) Grippe A(H9N2) Les virus grippaux A(H9N2) sont enzootiques parmi les populations de volailles de certaines parties de l’Afrique, de l’Asie et du Moyen-Orient. La majorité des virus qui ont été séquencés appartiennent au clade G1 ou au clade chicken/Beijing (Y280/G9). Depuis 1998, année au cours de laquelle on a détecté le premier cas d’infection humaine, l’isolement des virus A(H9N2) chez l’homme ou chez le porc a été rarement notifié. Dans tous les cas connus chez l’homme, les symptômes associés ont été bénins et aucune transmission interhumaine n’a été mise en évidence. Activité de la grippe A(H9N2): 19 septembre 2012 -18 février 2013 On n’a enregistré aucun cas d’infection humaine par le virus A(H9N2) au cours de cette période. Des virus A(H9N2) continuent d’être isolés chez des oiseaux dans de nombreuses régions du monde. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H9N2) Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat 2
Candidate vaccine viruses and potency testing reagents for influenza A(H5N1). Available at http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/en/, accessed February 2013.
Candidate vaccine viruses and potency testing reagents for influenza A(H5N1). Disponible à l’adresse: http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/en/, consulté en février 2013. Weekly epidemiological record, No. 11, 15 MARCH 2013
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Figure 2 Phylogenetic relationships of A(H5N1) clade 2.3.2.1 A/Hong Kong/6841/2010-like virus HA genes Figure 2 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) analogues à A/Hong Kong/6841/201 et appartenant au clade 2.3.2.1
Hubei-like viruses A/duck/Laos/1020/2010 HK6841-like viruses 2009-11 A/bar-headed goose/Mongolia/X53/2009 A/chicken/Nepal/111/2010 A/duck/Nepal/DTS24/2010 A/grebe/Tyva/2/2010 A/tundra swan/Mongolia/1T/2010 A/duck/Laos/471/2010 A/chicken/Bangladesh/15083/2012 A/chicken/Bangladesh/15079/2012 A/chicken/Tibet/1/2011 A/Hong Kong/6841/2010# A/duck/Blitar/BBVW-1731-11/2012 A/duck/Sleman/BBVW-1463-10/2012 A/duck/Wonogiri/BBVW-1730-11/2012 A/duck/Sukoharjo/BBVW-1428-9/2012 A/muscovy duck/Tegal/BBVW-1732-11/2012 A/duck/Bantul/BBVW-1443-9/2012 A/duck/Tegal/BBVW-1727-11/2012 A/Crested Myna/Hong Kong/8381/2012 A/House Crow/Hong Kong/5343/2012 A/Scaly-breasted-Munia/Hong Kong/12795/2012 A/Peregrine Falcon/Hong Kong/4538/2012 A/Duck/Vietnam/KhanhHoa(NinhHoa)/CVVI-KH13(A2553)/2012 A/Duck/Vietnam/KhanhHoa(NinhHoa)/CVVI-KH12(A2552)/2012 A/Duck/Vietnam/LangSon(VanLang)/NCVD120984VAHIP(A2513)/2013 A/Duck/Vietnam/NgheAn(HungTrung)/R3-12-3630(A2688)/2013 A/Chicken/Vietnam/HaNam(LyNhan)/NCVD120763(A1961)/2012 A/quail/Vietnam/VinhPhuc(YaLac)/NCVD120800(A2046)/2012 A/Duck/Vietnam/ThanhHoa(TinhGia)/R3-1695(A2047)/2012 A/Duck/Vietnam/ThanhHoa(NongCong)/R3-2296(A2053)/2012 A/Duck/Vietnam/HaTinh(NghiXuan)/R3-2294(A2052)/2012 A/Duck/Vietnam/BacNinh(TPBachNinh)/NCVD120752(A1954)/2012 A/Duck/Vietnam/NinhBinh(CuaVan)/NCVD121001(A2350)/2013 A/Duck/Vietnam/DienBien(TP)/NCVD120911(A2204)/2012 A/Duck/Vietnam/HoaBinh(TsungMinh)/NCVD120791(A2028)/2012 A/Duck/Vietnam/HaTinh(LocHa)/R3-1703(A2049)/2012 A/Duck/Vietnam/NgheAn(ThanhChuong)/R3-13-01(A2690)/2013 A/Duck/Vietnam/NgheAn(NghiLoc)/R3-12-3551(A2687)/2013 A/duck/Vietnam/NCVD-1974/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1602/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1584/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1932/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1935/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1944/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1593/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-1927/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1936/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1872/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1902/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1901/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1869/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1904/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1878/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1905/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1884/2012 A/Swan/Shanghai/10/2009 A/chicken/Korea/Gimje/2008 A/whooper swan/Hokkaido/1/2008 0.004 A/common magpie/Hong Kong/5052/2007 The available candidate vaccine viruses are in bold and the HI reference viruses used in Table 2 are highlighted in grey. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus vaccinaux candidats disponibles sont indiqués en caractères gras et les virus de référence pour l’épreuve d’IH utilisés dans le Tableau 2 sont surlignés en gris. Les virus humains sont repérés par (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site. releve epidemiologique hebdomadaire, No 11, 15 mars 2013 121
Table 2 Haemagglutination inhibition reactions of influenza A(H5N1) clade 2.3.2.1 viruses Tableau 2 Réactions d’inhibition de l’hémagglutination obtenues avec les virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 2.3.2.1 Reference antigens (genetic cluster) – Antigènes de référence (groupe génétique) A/c magpie/Hong Kong/5052/2007 A/Hubei/1/2010 IDCDC RG-30 (HUB) A/b swallow/Hong Kong/1161/2010 SJ003 (BS) A/bh goose/Mongolia/X53/2009 (HK) A/Hong Kong/6841/2010 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1584/2012 (HK) Test Antigens – Antigènes d’épreuve A/duck/Viet Nam/NCVD-1602/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1902/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1905/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1593/2012 (HK) A/chicken/Viet Nam/NCVD-1927/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1872/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1869/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1901/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1884/2012 (HK) A/duck/Viet Nam/NCVD-1878/2012 (HK) 640 640 320 320 320 320 320 320 160 320 160 80 80 80 80 80 40 40 40 40 80 40 40 20 20 40 20 20 10 10 640 640 320 320 320 320 160 160 160 80 640 640 640 320 320 320 320 320 320 160 320 320 160 160 160 160 160 160 80 40 cm/HK 1280 320 320 640 640 640 RG-30 80 320 80 80 80 160 bs/HK 40 40 80 40 20 40 bhg/MG 640 320 80 320 320 320 HK/6841 640 640 320 640 320 640 dk/VN 320 160 80 320 160 320
HUB, A/Hubei/1/2010-like; BS, A/barn swallow/Hong Kong/1161/2010-like; HK, A/Hong Kong/6841/2010-like. – HUB, analogue à A/Hubei/1/2010; BS, analogue à A/barn swallow/Hong Kong/1161/2010; HK, analogue à A/Hong Kong/6841/2010. Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/ d’antisérum homologue.
Table 3 Haemagglutination inhibition reactions of influenza A(H5N1) clade 2.3.4.2 viruses Tableau 3 Réactions d’inhibition de l’hémagglutination obtenues avec les virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 2.3.4.2 Reference antigens – Antigènes de référence A/Anhui/1/2005 A/chicken/Hong Kong/AP156/2008 Test antigens – Antigènes d’épreuve A/Guizhou/1/2012 A/Guizhou/1/2013 A/Guizhou/2/2013 2.3.4.2 2.3.4.2 2.3.4.2 <40 <40 <40 80 40 40 Clade 2.3.4 2.3.4 Anhui/1/2005 80 NA ck/HK/AP156/2008 80 320
are proposed. The available A(H9N2) candidate vaccine viruses are listed in Table 5. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO web site.2
A(H9N2) n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H9N2) disponibles sont recensés dans le Tableau 5. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
(3) Influenza A(H7N3) Influenza A(H7) viruses cause sporadic outbreaks in poultry populations worldwide. Occasionally, during outbreaks in poultry, human cases are documented in those with direct poultry exposure. These infections often cause conjunctivitis with occasional respiratory disease.3, 4 3
3) Grippe A(H7N3) Les virus de la grippe A(H7) provoquent des flambées sporadiques dans les populations de volailles partout dans le monde. Au cours de ces flambées, des cas humains sont occasionnellement enregistrés chez les personnes exposés directement aux volailles. Ces infections sont souvent à l’origine de conjonctivites accompagnées parfois d’une maladie respiratoire.3, 4 3
Tweed, SA et al. Human illness from avian influenza H7N3, British Columbia. Emerging Infectious Diseases, 2004, 10(12): 2196–2199. de Jong MC et al. Intra- and interspecies transmission of H7N7 highly pathogenic avian influenza virus during the avian influenza epidemic in the Netherlands in 2003. Revue scientifique et technique de l’Office international des épizooties (OIE), 2009, 28(1):333–340.
Tweed, SA et al. Human illness from avian influenza H7N3, British Columbia. Emerging Infectious Diseases, 2004, 10(12): 2196–2199. de Jong MC et al. Intra- and interspecies transmission of H7N7 highly pathogenic avian influenza virus during the avian influenza epidemic in the Netherlands in 2003. Revue scientifique et technique de l’Office international des épizooties (OIE), 2009, 28 (1): 333-340. Weekly epidemiological record, No. 11, 15 MARCH 2013
4
4
122
Figure 3 Phylogenetic relationships of A(H5N1) clade 2.3.4.2 HA genes Figure 3 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 2.3.4.2
A/Chicken/Hong Kong/YU816/2008 A/Chicken/Hong Kong/SV1441/2008 A/Chicken/Hong Kong/AP170/2008 A/Chicken/Hong Kong/AP201/2008 A/Chicken/Hong Kong/SV1456/2008 A/Chicken/Hong Kong/SV1421/2008 A/Chicken/Hong Kong/SV1369.13/2008 A/Chicken/Hong Kong/SV1369.19/2008 A/Chicken/Hong Kong/AP156/2008 A/Chicken/Hong Kong/2008-11 2.3.4.3 A/Japanese white-eye/Hong Kong/1038/2006 A/Anhui/1/2005# A/duck/Laos/3295/2006 2.3.4.1 A/chicken/Vietnam/NCVD-392/2009 A/chicken/Vietnam/NCVD-394/2010 A/chicken/Vietnam/NCVD-281/2009 A/Guizhou/2/2013# A/Guizhou/1/2013# A/Guizhou/1/2012# A/chicken/Guiyang/821/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-035/2008 A/duck/Laos/9/2010 A/duck/Laos/975/2010 A/environment/Guizhou/2/2009 A/chicken/Mingalardone Myanmar/PM-10-254/2010 A/chicken/Yangon/254/2010 A/chicken/Mayangone Myanmar/PM-10-182/2010 A/chicken/Debayin Myanmar/PM-11-449/2011 A/chicken/Ye U Myanmar/PM-11-525/2011 A/chicken/Bangladesh/3012/2011 0.004
2.3.4.2
A/chicken/Bangladesh/11rs1984-37/2011 A/chicken/Bangladesh/11rs1984-30/2011
The available candidate vaccine viruses are indicated in bold. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus vaccinaux candidats disponibles sont indiqués en caractères gras. Les virus humains sont repérés par (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site.
Influenza A(H7N3) activity: 19 September 2012– 18 February 2013 Highly pathogenic A(H7N3) viruses were detected in poultry in 2 states in Mexico and in poultry and a wild bird in a third. No human cases have been reported during this period. Influenza A(H7) candidate vaccine viruses Based on the current epidemiological data, no new A(H7) candidate vaccine viruses are proposed. Available A(H7) candidate vaccine viruses are shown in Table 6. Institutions that wish to receive candidate vaccine releve epidemiologique hebdomadaire, No 11, 15 mars 2013
Activité de la grippe A(H7N3): 19 septembre 2012 - 18 février 2013 Des virus A(H7N3) hautement pathogènes ont été détectés chez les volailles dans 2 États du Mexique, ainsi que chez des volailles et chez un oiseau sauvage dans un troisième État. Aucun cas humain n’a été notifié au cours de cette période. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H7) Au vu des données épidémiologiques actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H7) n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H7) disponibles sont présentés dans le Tableau 6. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candi123
Table 4 Status of development of influenza A(H5N1) candidate vaccine viruses, February 2013 Tableau 4 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H5N1), février 2013 Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Viet Nam/1203/2004 (CDC-RG; SJRG-161052) A/Viet Nam/1194/2004 (NIBRG-14) A/Cambodia/R0405050/2007 (NIBRG-88) A/duck/Hunan/795/2002 (SJRG-166614) A/Indonesia/5/2005 (CDC-RG2) A/bar-headed goose/Qinghai/1A/2005 (SJRG-163222) A/chicken/India/NIV33487/2006 (IBCDC-RG7) A/whooper swan/Mongolia/244/2005 (SJRG-163243) A/Egypt/2321-NAMRU3/2007 (IDCDC-RG11) A/turkey/Turkey/1/2005 (NIBRG-23) A/Egypt/N03072/2010 (IDCDC-RG29) A/Egypt/3300-NAMRU3/2008 (IDCDC-RG13) A/common magpie/Hong Kong/5052/2007 (SJRG-166615) A/Hubei/1/2010 (IDCDC-RG30) A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010 (SJ-003) A/chicken/Hong Kong/AP156/2008 (SJ-002) A/Anhui/1/2005 (IBCDC-RG6) A/duck/Laos/3295/2006 (CBER-RG1) A/Japanese white eye/Hong Kong/1038/2006 (SJRG-164281) A/goose/Guiyang/337/2006 (SJRG-165396) A/chicken/Viet Nam/NCVD-016/2008 (IDCDC-RG12) A/chicken/Viet Nam/NCVD-03/2008 (IDCDC-RG25A) Candidate vaccine viruses in preparation A/chicken/Bangladesh/11RS1984-30/2011-like A/Indonesia/NIHRD11771/2011-like A/Guizhou/1/2013-like a
Clade 1 1 1.1 2.1 2.1.3.2 2.2 2.2 2.2 2.2.1 2.2.1 2.2.1 2.2.1.1 2.3.2.1 2.3.2.1 2.3.2.1 2.3.4 2.3.4 2.3.4 2.3.4 4 7.1 7.1 Clade 2.3.4.2 2.1.3.2 2.3.4.2
Institutiona CDC and SJCRH – CDC et SJCRH NIBSC NIBSC SJCRH CDC SJCRH CDC/NIV SJCRH CDC NIBSC CDC CDC SJCRH CDC SJCRH SJCRH CDC FDA SJCRH SJCRH CDC CDC Institution CDC NIID CDC/CCDC
Available – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Availability – Disponibilité Pending – En attente Pending – En attente Pending – En attente
Institutions distributing the candidate vaccine viruses – Institutions distribuant les virus vaccins candidats:
CDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States; CDC/CCDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States/ Chinese Centers for Disease Control and Prevention; CDC/ NIV, Centers for Disease Control and Prevention, United States/National Institute of Virology, India; FDA, Food and Drug Administration, United States; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, England; NIID- National Institute of Infectious Diseases, Japan; SJCRH,St Jude Children’s Research Hospital, United States.– CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; CDC/CCDC, CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis/;Centres chinois de contrôle et de prévention des maladies, Chine; CDC/NIC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis, en collaboration avec le National Institute of Virology, Inde; FDA, Food and Drug Administration, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, Angleterre; SJCRH, St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis; NIID, Institut national des maladies infectieuses, Japon.
Table 5 Status of development of influenza A(H9N2) candidate vaccine viruses, February 2013 Tableau 5 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H9N2), février 2013 Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Hong Kong/1073/1999 A/chicken/Hong Kong/G9/1997 (NIBRG-91) A/chicken/Hong Kong/G9/1997 (IBCDC-2) A/Hong Kong/33982/2009 (IDCDC-RG26) A/Bangladesh/0994/2011 (IDCDC-RG31) a
Type Wild type – Type sauvage Reverse genetics – Génétique inverse Conventional reassortant – Réassorti classique Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse
Clade G1 Y280/G9 Y280/G9 G1 G1
Institutiona NIBSC NIBSC CDC CDC CDC
Available – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui
Institutions distributing the candidate vaccine viruses – Institutions distribuant les virus vaccins candidats:
CDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, England.– CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, Angleterre. 124 Weekly epidemiological record, No. 11, 15 MARCH 2013
viruses should contact WHO at gisrs-whohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO web site.2
dats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@ who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
(4) Influenza A(H3N2) variant (v)5 Influenza A(H3N2) viruses are enzootic in swine populations in most regions of the world. Depending on geographical location, the genetic and antigenic characteristics of these viruses differ. Human infections with swine A(H3N2) viruses have been documented in Asia, Europe and North America.6 Influenza A(H3N2)v activity: 19 September 2012–18 February 2013 One human case of A(H3N2)v infection was reported in the United States.7 This virus was genetically and antigenically similar to previously characterized A(H3N2)v viruses. Similar viruses continue to be isolated from pigs in the United States. Influenza A(H3N2)v candidate vaccine viruses Based on the current antigenic, genetic and epidemiological data, no new A(H3N2)v candidate vaccine viruses are proposed. Available candidate vaccine viruses are shown in Table 7. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrswhohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO web site.2
4) Virus variant A(H3N2) (v)5 Les virus grippaux A(H3N2) sont enzootiques parmi les populations porcines de nombreuses régions du monde. Les caractéristiques génétiques et antigéniques de ces virus diffèrent selon le lieu géographique. Des infections humaines par des virus porcins A(H3N2) ont été attestées en Asie, en Europe et en Amérique du Nord.6 Activité de la grippe A(H3N2)v: 19 septembre 2012 18 février 2013 Un cas humain d’infection par le virus A(H3N2)v a été notifié aux Etats-Unis.7 Le virus mis en cause était similaire sur les plans génétique et antigénique aux virus A(H3N2)v caractérisés auparavant. Des virus analogues continuent d’être isolés chez des porcs aux Etats-Unis. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H3N2)v Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H3N2)v n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats disponibles sont présentés dans le Tableau 7. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
Table 6 Status of development of influenza A(H7) candidate vaccine viruses, February 2013 Tableau 6 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H7), février 2013 Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/turkey/Virginia/4529/2002 (H7N2) IBCDC-5 A/mallard/Netherlands/12/2000 (H7N7) IBCDC-1 A/mallard/Netherlands/12/2000 (H7N3) NIBRG-60 A/mallard/Netherlands/12/2000 (H7N1) NIBRG-63 A/Canada/RV444/2004 (H7N3) A/New York/107/2003 (H7N2) NIBRG-109 a
Type Conventional reassortant – Réassorti classique Conventional reassortant– Réassorti classique Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse
Institutiona CDC CDC NIBSC NIBSC SJCRH NIBSC
Institutions distributing the candidate vaccine viruses – Institutions distribuant les virus vaccins candidats:
CDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, England; SJCRH, St Jude Children’s Research Hospital, United States.– CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, Angleterre; SJCRH, St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis.
Table 7 Status of development of influenza A(H3N2)v candidate vaccine viruses, February 2013 Tableau 7 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H3N2)v, février 2013 Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Minnesota/11/2010 (NYMC X-203) Type Conventional reassortant – Réassorti classique Institutiona CDC CDC
a
A/Indiana/10/2011 (NYMC X-213) Conventional reassortant – Réassorti classique Institutions distributing the candidate vaccine viruses – Institutions distribuant les virus vaccins candidats: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States. – CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis. Standardization of terminology for the variant A(H3N2) virus recently infecting humans. Available at http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ ah3n2v/en/index.html/, accessed February 2013. Myers KP et al. Cases of swine influenza in humans: a review of the literature. Clinical Infectious Diseases, 2007, 44:1084–1088. Situation summary on influenza A (H3N2) variant viruses (H3N2v). Available at http://www.cdc.gov/flu/swineflu/h3n2v-situation.htm, accessed February 2013.
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Standardization of terminology for the variant A(H3N2) virus recently infecting humans. Disponible à l’adresse: http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ah3n2v/en/index.html/, consulté en février 2013. Myers KP et al. Cases of Swine Influenza in Humans: A Review of the Literature. Clinical Infectious Diseases, 2007, 44:1084.
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Situation Summary on Influenza A (H3N2) Variant Viruses (H3N2v). Disponible à l’adresse: http://www.cdc.gov/flu/swineflu/h3n2v-situation.htm, consulté en février 2013. 125
releve epidemiologique hebdomadaire, No 11, 15 mars 2013