2013, 88, 449–464
No. 42
Weekly epidemiological record Relevé épidémiologique hebdomadaire 18 octoBER 2013, 88th year / 18 octoBRE 2013, 88e année No. 42, 2013, 88, 449–464 http://www.who.int/wer
Contents 449 Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness 463 Monthly report on dracunculiasis cases, January–August 2013
Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness September 2013 The development of representative candidate influenza vaccine viruses, coordinated by WHO, remains an essential component of the overall global strategy for pandemic preparedness. Comparisons of the candidate vaccine viruses with respect to antigenicity and their relationship to newly emerging viruses are ongoing and will be reported periodically by WHO.
Caractéristiques génétiques et antigéniques des virus grippaux zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats en vue de la préparation à une pandémie Septembre 2013 La mise au point de virus vaccinaux candidats représentatifs, coordonnée par l’OMS, reste une composante essentielle de la stratégie générale mondiale de préparation à une pandémie grippale. Les comparaisons entre virus vaccinaux candidats sous l’angle de l’antigénicité et de la parenté avec les nouveaux virus émergents se poursuivent et l’OMS en rendra compte périodiquement.
Sommaire 449 Caractéristiques génétiques et antigéniques des virus grippaux zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats en vue de la préparation à une pandémie 463 Rapport mensuel des cas de dracunculose, janvier-août 2013
(1) Influenza A(H5N1) Since their re-emergence in 2003, highly pathogenic avian influenza A(H5N1) viruses have become enzootic in some countries and continue to cause outbreaks in poultry as well as sporadic human infections. The A(H5N1) viruses have diversified both genetically and antigenically leading to the need for multiple candidate vaccine viruses for pandemic preparedness purposes. This summary provides updates on the characterization of A(H5N1) viruses isolated from birds and humans, and the current status of the development of influenza A(H5N1) candidate vaccine viruses. Influenza A(H5N1) activity: 19 February – 23 September 2013 A(H5N1) viruses have been detected in birds in Africa and Asia. Human infections have been reported to the WHO by Cambodia, Egypt, Indonesia, and Viet Nam, countries in which infections have been detected in birds (Table 1). Antigenic and genetic characteristics of A(H5N1) viruses The nomenclature for phylogenetic relationships among the haemagglutinin (HA) genes of A(H5N1) viruses is defined in
(1) Grippe A(H5N1) Depuis leur réémergence en 2003, les virus de la grippe aviaire A(H5N1) hautement pathogène sont devenus enzootiques dans certains pays et continuent de provoquer des flambées chez les volailles et des infections sporadiques chez l’homme. Ces virus A(H5N1) se sont diversifiés sur les plans génétique et antigénique, d’où la nécessité de mettre au point plusieurs virus vaccinaux candidats dans le cadre de la préparation à une pandémie. Le présent résumé fait le point sur la caractérisation des virus A(H5N1) isolés chez des oiseaux et chez l’homme et sur l’état d’avancement actuel de la préparation des virus vaccinaux candidats A(H5N1). Activité de la grippe A(H5N1): 19 février – 23 septembre 2013 Des virus A(H5N1) ont été détectés chez des oiseaux en Afrique et en Asie. Des infections humaines ont été notifiées à l’OMS par le Cambodge, l’Égypte, l’Indonésie et le Viet Nam, pays où l’on a également recensé des infections chez les oiseaux (Tableau 1). Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux A(H5N1) La nomenclature des liens de parenté phylogénétique existant entre les gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux 449
World Health Organization Geneva Organisation mondiale de la Santé Genève Annual subscription / Abonnement annuel Sw. fr. / Fr. s. 346.– 10.2013 ISSN 0049-8114 Printed in Switzerland
Table 1 Recent influenza A(H5N1) activity reported to international agencies Tableau 1 Activité récente de la grippe A(H5N1) signalée aux agences internationales Country, area or territory – Pays, zone ou territoire Bangladesh Cambodia – Cambodge China – Chine Democratic People’s Republic of Korea – République démocratique populaire de Corée Egypt – Égypte India – Inde Indonesia – Indonésie Nepal – Népal Viet Nam
Host/source – Hôte/Source Poultry/environmental – Volaille/Environnemental Poultry – Volaille Human (10)a – Humain (10)a Poultry/environmental – Volaille/Environnemental Poultry – Volaille Poultry – Volaille Human (3) – Humain (3) Poultry/wild birds – Volaille/oiseaux sauvages Poultry/wild birds – Volaille/oiseaux sauvages Human (1) – Humain (1) Poultry/wild birds – Volaille/oiseaux sauvages Poultry/wild birds – Volaille/oiseaux sauvages Human (2) – Humain (2)
Genetic clade – Clade génétique 2.3.2.1 1.1 1.1 2.3.2.1, 2.3.4.2, 7.2 2.3.2.1 2.2.1 2.2.1 2.3.2.1 2.3.2.1b 2.1.3.2 2.3.2.1 1.1/2.3.2.1/7.2 1.1
a
Numbers in parentheses denotes number of human cases with illness onset dates falling within reporting period. – Les chiffres entre parenthèses indiquent le nombre de cas humains notifiés au cours de cette période. Wild birds illegally imported into Europe from Indonesia were positive for A(H5N1) clade 2.3.2.1 virus. – Des oiseaux sauvages importés illégalement d’Indonésie vers l’Europe ont été testés positif au virus A (H5N1) de clade 2.3.2.1.
b
consultation with representatives of the WHO, the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO), the World Organisation for Animal Health (OIE) and academic institutions. The updated nomenclature report can be found on WHO web site.1 Viruses circulating and characterized from 19 February to 23 September 2013 belonged to the following clades. Clade 1.1 viruses were detected in poultry and humans in Cambodia and Viet Nam. Genetic characterization of the HA genes showed that these viruses were closely related to viruses detected previously in these countries (Figure 1). Some recent clade 1.1 viruses had reduced haemagglutination inhibition (HI) titres to post-infection ferret antisera raised against A/Viet Nam/1203/2004 and/or A/Cambodia/R0405050/2007 from which candidate vaccine viruses have been produced. Conversely, these viruses reacted well with post-infection ferret antisera raised against recent viruses isolated in Cambodia (Table 2). A new A/Cambodia/W0526301/2012like candidate vaccine virus is proposed. Clade 2.1.3.2 viruses continue to circulate in Indonesia. The HA gene sequence of a 2013 human virus was very similar to that of the candidate vaccine virus A/Indonesia/ NIHRD11771/2011. No antigenic information is available. Clade 2.2.1 viruses, similar to clade 2.2.1 viruses detected in previous years, were detected in poultry and
A(H5N1) est définie en consultation avec des représentants de l’OMS, de l’Organisation des Nations Unies pour l’Alimentation et l’Agriculture (FAO), de l’Organisation mondiale de la Santé animale (OIE) et d’établissements d’enseignement supérieur. Le rapport portant sur l’actualisation de cette nomenclature est consultable sur le site Web de l’OMS.1 Les virus circulants et caractérisés entre le 19 février et le 23 septembre 2013 appartenaient aux clades suivants. Clade 1.1 Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles et des êtres humains au Cambodge et au Viet Nam. La caractérisation des gènes de l’hémagglutinine (HA) a montré que ces virus étaient étroitement apparentés à des virus précédemment détectés dans ces pays (Figure 1). Certains virus récents du clade 1.1 donnaient des titres d’inhibition de l’hémagglutination (IH) réduits en présence d’immunsérums de furet postinfection, obtenus après inoculation des virus A/Viet Nam/1203/2004 et/ou A/Cambodia/R0405050/2007 à partir desquels les virus vaccinaux candidats avaient été préparés. Un nouveau virus vaccinal candidat, analogue du virus A/Cambodia/W0526301/2012 (Tableau 2) est proposé. Clade 2.1.3.2 Des virus de ce clade continuent de circuler en Indonésie. La séquence de gènes de l’hémagglutinine HA d’un virus humain de 2013 était très similaire à celle du virus vaccinal candidat /Indonesia/NIHRD11771/2011. Aucune information sur le plan antigénique n’est disponible. Clade 2.2.1 Des virus de ce clade, similaires à ceux du même clade détectés les années précédentes, ont été mis en évidence
1
Updated unified nomenclature system for the highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses. Geneva, World Health Organization, 2011 (http://www.who.int/ influenza/gisrs_laboratory/h5n1_nomenclature/en/, accessed September 2013).
1
Updated unified nomenclature system for the highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses. Genève, Organisation mondiale de la Santé, 2011 (http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/h5n1_nomenclature/en/, consulté en septembre 2013). Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
450
Figure 1 Phylogenetic relationships of A(H5N1) clade 1.1 virus haemagglutinin genes Figure 1 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine des virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 1.1
A/Cambodia/X0125302/2013 # A/Cambodia/X0621333/2013 # A/Vietnam/VP13-28H/2013 # A/duck/Vietnam/13-4804/2013 A/Cambodia/X0123312/2013 # A/duck/Cambodia/59W3M1/2013 A/duck/Cambodia/33W2M3/2013 A/duck/Cambodia/46W2M4/2013 A/Cambodia/X0123311/2013 # A/chicken/Vietnam/13-4479/2013 A/Vietnam/VP12-3/2012 # A/Cambodia/W0526301/2012 # A/duck/Vietnam/NCVD-0193/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-1188/2012 A/Cambodia/W0112303/2012 # A/Cambodia/W0329318/2012 # A/Cambodia/V0813302/2011 # A/marabou stork/Cambodia/TM068/2011 A/Cambodia/V0719348/2011 # A/chicken/Cambodia/089LC3/2011 A/chicken/Cambodia/089LC1/2011 A/Cambodia/V0219301/2011 # A/Chicken/Vietnam/CVVI-KH07 A2153 /2012 A/chicken/Cambodia/008LC1/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-878/2011 A/Cambodia/V0417301/2011 # A/Cambodia/V0203306/2011 # A/Cambodia/U0417030/2010 # A/chicken/Vietnam/NCVD-775/2011 A/chicken/Vietnam/BL-S12-1415/2009 A/duck/Vietnam/BL-S9-1505/2009 A/duck/Vietnam/CT-S3-190/2009 A/duck/Vietnam/BL-S6-1320/2009 A/duck/Vietnam/CT-S3-73/2009 A/chicken/Vietnam/NCVD-359/2009 A/chicken/Vietnam/NCVD-779/2011 A/Cambodia/V0606311/2011 # A/chicken/Vietnam/NCVD-876/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-784/2010 A/chicken/Vietnam/NCVD-879/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-827/2011 A/Cambodia/V0401301/2011 # A/muscovy duck/Vietnam/OIE-559/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-776/2011 0.008 A/duck/Vietnam/NCVD-363/2009 A/duck/Vietnam/BL-S4-1417/2009 A/chicken/Vietnam/CT-S11-401/2010 A/Muscovy duck/Vietnam/33/2007 A/Muscovy duck/Vietnam/NCVD-5/2007 A/duck/Vietnam/NCVD-016/2007 A/Cambodia/R0405050/2007 # A/Cambodia/JP52a/2005 # A/Vietnam/1203/2004 # A/Vietnam/1194/2004 #
The available candidate vaccine viruses are indicated in bold and the HI reference viruses are highlighted in grey. The proposed vaccine candidate is indicated (•) as well as human viruses (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus vaccinaux candidats disponibles sont indiqués en caractères gras et les virus de référence pour l’épreuve d’IH sont surlignés en gris. Le vaccin candidat proposé est indiqué par (•) et les virus humains sont repérés par (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site.
releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 18 octobRE 2013
451
Table 2 Haemagglutination inhibition reactions of influenza A(H5N1) clade 1.1 viruses Tableau 2 Réactions d’inhibition de l’hémagglutination obtenues avec les virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 1.1 Reference antigens – Antigènes de référence A/Viet Nam/1203/2004 A/Cambodia/R0405050/2007 A/duck/Viet Nam/NCVD-016/2007 A/chicken/Viet Nam/NCVD-775/2011 A/Cambodia/W0526301/2012 A/Cambodia /W0329318/2012 Test antigens – Antigènes d’épreuve A/Cambodia/X0123311/2013 A/Cambodia/X0123312/2013 A/Cambodia/X0125302/2013 A/duck/Cambodia/33W2M3/2013 A/duck/Cambodia/59W3M1/2013 A/Viet Nam/VP12-3/2012 40 160 160 40 80 160 40 160 160 20 40 40 160 320 160 40 80 320 320 2560 1280 160 640 640 40 160 160 20 80 80 VN/1203 160 40 160 160 80 160 CB/R0405050 40 160 10 40 20 40 CK/VN/775 320 5 160 320 160 160 CB/W0526301 320 20 80 320 320 80 CB/W0329318 160 20 80 160 80 160
Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum homologue.
humans in Egypt. These viruses reacted well with postinfection ferret antisera raised against available candidate vaccine viruses produced from A/Egypt/N03072/2010 and/or A/Egypt/2321-NAMRU3/2007. Clade 2.3.2.1 viruses fall into 3 HA genetic groups as follows. A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010-like viruses were detected in birds in China and Viet Nam but in reduced numbers compared to recent reporting periods. These viruses were genetically similar to viruses detected previously. A/Hubei/1/2010-like viruses were detected in birds and/ or environmental samples from Bangladesh, China, India, Nepal, and Viet Nam (Figure 2). While some viruses reacted well with post-infection ferret antisera raised against the available candidate vaccine virus produced from A/Hubei/1/2010, others did not (Table 3). Due to these observations and the widespread distribution of these viruses, a new A/duck/Bangladesh/19097/2013-like candidate vaccine virus is proposed. A/Hong Kong/6841/2010-like viruses were detected in China, Democratic People’s Republic of Korea, Indonesia (detected in birds illegally imported into Europe), and Viet Nam. Antigenically (Table 4) and genetically (Figure 3) some of these viruses have diverged from available candidate vaccine viruses, hence a new A/duck/Viet Nam/1584/2012-like candidate vaccine virus is proposed. Clade 2.3.4.2 viruses were isolated from birds and environmental samples in China. The HA genes of these 452
chez des volailles et des êtres humains en Égypte. Ces virus réagissaient bien avec les immunsérums de furet postinfection obtenus après inoculation des virus vaccinaux candidats disponibles, préparés à partir des souches A/Egypt/N03072/2010 et/ou A/Egypt/2321-NAMRU3/2007. Clade 2.3.2.1 Les virus de ce clade se répartissent en 3 groupes génétiques définis en fonction de HA comme suit. Des virus analogues à la souche A/barn swallow/Hong Kong/ D10-1161/2010 ont été détectés chez des oiseaux en Chine et au Viet Nam, mais en nombres plus réduits que pendant les périodes de rapport récentes. Ces virus étaient génétiquement similaires à ceux détectés précédemment. Des virus analogues à la souche A/Hubei/1/2010 ont été décelés chez des oiseaux et/ou dans des échantillons environnementaux au Bangladesh, en Chine, en Inde, au Népal, et au Viet Nam (Figure 2). Si certains de ces virus réagissaient bien avec les immunsérums de furet postinfection obtenus après inoculation des virus vaccinaux candidats préparés à partir de la souche A/Hubei/1/2010, d’autres non (Tableau 3). En raison de ces observations et de la distribution étendue de ces virus, un nouveau virus vaccinal candidat, analogue à la souche A/duck/ Bangladesh/19097/2013, est proposé. Des virus analogues à la souche A/Hong Kong/6841/2010 ont été détectés en Chine, en République démocratique populaire de Corée, en Indonésie (détectés chez des oiseaux importés illégalement en Europe) et au Viet Nam. Sur le plan antigénique (Tableau 4) et génétique (Figure 3), certains de ces virus ont divergé par rapport aux virus vaccinaux candidats disponibles, c’est pourquoi un nouveau virus vaccinal candidat, analogue à la souche A/duck/Viet Nam/1584/2012, est proposé. Clade 2.3.4.2 Des virus de ce clade ont été isolés chez des oiseaux et dans des échantillons environnementaux en Chine. Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
Figure 2 Phylogenetic relationships of A(H5N1) clade 2.3.2.1 A/Hubei/1/2010-like virus haemagglutinin genes Figure 2 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine des virus grippaux A(H5N1) analogues à A/Hubei/1/2010 et appartenant au clade 2.3.2.1
0.008
A/duck/Bangladesh/18948/2013 A/quail/Bangladesh/19254/2013 A/chicken/Bangladesh/12VIR-7140-11/2012 A/duck/Bangladesh/19097/2013 A/Duck/Bangladesh/19490/2013 A/duck/Bangladesh/17753/2012 A/Bangladesh/8002/2013 # A/chicken/Bangladesh/1-B/2013 A/duck/Bangladesh/19099/2013 A/chicken/Bangladesh/12VIR-7140-15/2012 A/chicken/Bangladesh/12VIR-7140-4/2012 A/chicken/Bangladesh/15841/2012 A/wild bird/Bangladesh/315T/2011 A/environment/Bangladesh/15131/2012 A/chicken/Bangladesh/15205/2012 A/chicken/Bangladesh/15089/2012 A/chicken/Bangladesh/18247/2012 A/duck/Bangladesh/18949/2013 A/duck/Bangladesh/4120T/2011 A/environment/Bangladesh/18989/2013 A/chicken/Bangladesh/18061/2012 A/environment/Bangladesh/19338/2013 A/chicken/India/CL03485/2011 A/chicken/Bangladesh/12VIR-7140-13/2012 A/chicken/Bangladesh/12VIR-7140-6/2012 A/chicken/Bangladesh/21719/2012 A/chicken/Bangladesh/12VIR-7140-5/2012 A/chicken/Bangladesh/15078/2012 A/duck/India/02AF1/2011 A/crow/Bangladesh/1061/2011 A/chicken/Bhutan/297/2012 A/duck/Nepal/5Tzoo/2011 A/crow/Bangladesh/1058/2011 A/chicken/Bangladesh/15097/2012 A/chicken/Tanse Myanmar/SP-11-329/2011 A/chicken/Sittwe Myanmar/11-084/2011 A/chicken/Yinmarbin Myanmar/SP-10-295/2010 A/muscovy duck/Vietnam/NCVD-1220/2012 A/environment/Hunan/00245/2013 A/chicken/Vietnam/NCVD-1488/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-1963/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1312/2012 A/Chicken/Vietnam/NCVD120725 A1868 /2012 A/Duck/Vietnam/NCVD120717 A1857 /2012 A/quail/Vietnam/HCMC-5237 A2550 /2013 A/chicken/Vietnam/NCVD-715/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-760/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-806/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-825/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-815/2010 A/duck/Vietnam/CT S10 739/2009 A/Hubei/1/2010 # A/duck/Lao/507/2012
HK6841-like viruses A/chicken/Sagaing/295/2010 A/Swan/Shanghai/10/2009 A/chicken/Korea/Gimje/2008 A/whooper swan/Hokkaido/1/2008 A/common magpie/Hong Kong/5052/2007
The available candidate vaccine viruses are in bold and the HI reference viruses are highlighted in grey. The proposed vaccine candidate is indicated (•) as well as human viruses (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus vaccinaux candidats disponibles sont indiqués en caractères gras et les virus de référence pour l’épreuve d’IH sont surlignés en gris. Le vaccin candidat proposé est indiqué par (•) et les virus humains sont repérés par (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site. releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 18 octobRE 2013 453
Table 3 Haemagglutination inhibition reactions of influenza A(H5N1) clade 2.3.2.1 A/Hubei-like viruses Tableau 3 Réactions d’inhibition de l’hémagglutination obtenues avec les virus grippaux A(H5N1) analogues à A/Hubei et appartenant au clade 2.3.2.1 Reference antigens – Antigènes de référence A/Hong Kong/6841/2010 A/Hubei/1/2010 (RG30) A/common magpie/Hong Kong/5052/2007 A/chicken/Bangladesh/15205/2012 A/duck/Bangladesh/19097/2013 Test antigens – Antigènes d’épreuve A/environment/Bangladesh/15131/2012 A/chicken/Bangladesh/15089/2012 A/chicken/Bangladesh/18061/2012 A/duck/Bangladesh/18949/2013 A/duck/Bangladesh/18948/2013 A/quail/Bangladesh/19254/2013 A/chicken/Bangladesh/19338/2013 A/duck/Laos/507/2012 ND = not done – non réalisé Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum homologue.
HK/6841 40 40 40 40 40
Hubei (RG30) 10 80 10 10 <10
CM/HK 40 80 80 <10 20
CK/BG/ 15205 40 40 40 80 20
DK/BG/19097 160 320 160 320 160
ND ND ND 40 20 20 20 40
40 40 20 20 <10 <10 <10 10
80 40 <10 80 80 80 20 160
20 20 20 10 20 10 <10 20
ND ND ND 320 160 160 320 320
Table 4 Haemagglutination inhibition reactions of influenza A(H5N1) clade 2.3.2.1 A/Hong Kong 6841-like viruses Tableau 4 Réactions d’inhibition de l’hémagglutination obtenues avec les virus grippaux A(H5N1) analogues à A/HongKong/6841 et appartenant au clade 2.3.2.1 Reference antigens – Antigènes de référence A/common magpie/Hong Kong/5052/2007 A/Hong Kong/6841/2010 A/duck/Viet Nam/NCVD-1584/2012 A/duck/Viet Nam /NCVD-2848/2013 Test antigens – Antigènes d’épreuve A/duck/Viet Nam/NCDV-2745/2013 A/swiftlet/Viet Nam/NCVD-3000/2013 A/duck/Viet Nam/NCVD-0145/2012 A/duck/Viet Nam/NCVD-0027/2012 A/duck/Viet Nam/NCVD-0033/2012 A/duck/Viet Nam/NCVD-0130/2013 ND = not done – non réalisé Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum homologue.
CM/HK 1280 160 160 40
HK/6841 320 640 320 320
DK/VN/1584 640 160 160 160
DK/VN/2848 160 160 320 640
320 80 160 160 160 160
80 320 320 640 640 320
80 40 80 160 160 160
ND 80 160 2560 160 2560
viruses were genetically similar to those of viruses detected previously. Antigenic characterization of these viruses is pending. Clade 7.2 viruses were detected in China and Viet Nam. Genetically these viruses were similar to viruses char454
Les gènes HA de ces virus étaient similaires à ceux des virus détectés précédemment. Leur caractérisation antigénique est en cours. Clade 7.2 Des virus de ce clade ont été détectés en Chine et au Viet Nam. Sur le plan génétique, ces virus sont similaires à ceux Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
Figure 3 Phylogenetic relationships of A(H5N1) clade 2.3.2.1 A/Hong Kong/6841/2010-like virus haemagglutinin genes Figure 3 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine des virus grippaux A(H5N1) analogues à A/Honk Kong/6841/2010 et appartenant au clade 2.3.2.1
Hubei-like viruses A/Duck/Vietnam/NCVD120752 A1954 /2012 A/duck/Vietnam/NCVD-2736/2013 A/Duck/Vietnam/R3-13-01 A2690 /2013 A/Duck/Vietnam/NCVD121001 A2350 /2013 A/Duck/Vietnam/NCVD120911 A2204 /2012 A/duck/Vietnam/NCVD-0130/2013 A/duck/Vietnam/NCVD-1544/2012 A/Duck/Vietnam/NCVD120984VAHIP A2513 /2013 A/duck/Vietnam/NCVD-0027/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-0033/2012 A/quail/Vietnam/NCVD120800 A2046 /2012 A/Duck/Vietnam/R3-12-3630 A2688 /2013 A/duck/Vietnam/NCVD-0145/2012 A/Duck/Vietnam/CVVI-KH12 A2552 /2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1944/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1584/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1974/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-2848/2013 A/Swiftlet/Vietnam/NCVD-3000/2013 A/duck/Vietnam/NCVD-2745/2013 A/duck/Vietnam/NCVD-0004/2013 A/duck/Blitar/BBVW-1731-11/2012 A/duck/Tegal/BBVW-1727-11/2012 A/muscovy duck/Tegal/BBVW-1732-11/2012 A/mynah/Austria-quarantine/13063485-025/2013 A/duck/Bantul/BBVW-1443-9/2012 A/Scaly-breasted-Munia/Hong Kong/12795/2012 A/Peregrine Falcon/Hong Kong/4538/2012 A/environment/Jiangxi/00433/2013 A/environment/Anhui/00464/2013 A/environment/Chongqing/00510/2013 A/House Crow/Hong Kong/5343/2012 A/environment/Chongqing/00410/2013 A/Hong Kong/6841/2010 # A/chicken/Tibet/1/2011 A/chicken/Bangladesh/15079/2012 A/duck/Laos/471/2010 A/tundra swan/Mongolia/1T/2010 A/chicken/Nepal/111/2010 A/bar-headedgoose/Mongolia/X53/2009 A/whooper swan/Hokkaido/4/2011 A/duck/Laos/1020/2010 A/chicken/Sagaing/295/2010 A/Swan/Shanghai/10/2009 A/chicken/Korea/Gimje/2008 A/whooper swan/Hokkaido/1/2008 A/common magpie/Hong Kong/5052/2007
0.008
The available candidate vaccine viruses are in bold and the HI reference viruses are highlighted in grey. The proposed vaccine candidate is indicated (•) as well as human viruses (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus vaccinaux candidats disponibles sont indiqués en caractères gras et les virus de référence pour l’épreuve d’IH sont surlignés en gris. Le vaccin candidat proposé est indiqué par (•) et les virus humains sont repérés par (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site.
releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 18 octobRE 2013
455
acterized previously. These viruses had reduced reactivity to post-infection ferret antisera raised against available candidate vaccine viruses and further analyses are proposed to determine if production of additional candidates is needed. Influenza A(H5N1) candidate vaccine viruses Based on the available antigenic, genetic and epidemiologic data, A/duck/Bangladesh/19097/2013-like (clade 2.3.2.1), A/duck/Viet Nam/NCVD-1584/2012-like (clade 2.3.2.1) and A/Cambodia/W0526301/2012-like (clade 1.1) candidate vaccine viruses are proposed. The available and proposed candidate A(H5N1) vaccine viruses are listed in Table 5. On the basis of geographic spread, epidemiology and antigenic and genetic properties of A(H5N1) viruses in particular locations, national authorities may consider the use of one or more of these candidate vaccine viruses for pilot lot vaccine production, clinical trials and other pandemic preparedness purposes. As the viruses continue to evolve, new A(H5N1) candidate vaccine viruses will be developed and announced as they become available. Institutions that wish to receive these candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2
caractérisés auparavant. Ils ont présenté une réactivité réduite à l’égard d’immunsérums de furet postinfection obtenus après inoculation des virus vaccinaux candidats disponibles et des analyses plus poussées sont proposées pour déterminer si la préparation d’autres virus candidats est nécessaire. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H5N1) Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques disponibles, de nouveaux virus vaccinaux candidats analogues aux virus A/duck/Bangladesh/19097/2013 (clade 2.3.2.1), A/duck/ Viet Nam/NCVD-1584/2012 (clade 2.3.2.1) et A/Cambodia/ W0526301/2012 (clade 1.1) sont proposés. Les virus vaccinaux candidats A(H5N1) disponibles et proposés sont recensés dans le Tableau 5. D’après la propagation géographique, l’épidémiologie et les propriétés antigéniques et génétiques des virus A(H5N1) en certains lieux, les autorités nationales peuvent envisager d’utiliser un ou plusieurs de ces virus vaccinaux candidats pour produire des lots pilotes de vaccin, réaliser des essais cliniques ou d’autres activités relevant de la préparation à une pandémie. Les virus continuant d’évoluer, de nouveaux virus vaccinaux candidats A(H5N1) seront mis au point et annoncés à mesure qu’ils deviennent disponibles. Les institutions souhaitant recevoir ces virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse gisrs-whohq@who.int ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
(2) Influenza A(H9N2) Influenza A(H9N2) viruses are enzootic in poultry populations in parts of Africa, Asia and the Middle East. The majority of viruses that have been sequenced belong to the G1, chicken/Beijing (Y280/G9), or Eurasian clades. Since 1998, when the first human infection was detected, the isolation of A(H9N2) viruses from humans and swine has been reported infrequently. In all human cases the associated disease symptoms have been mild and there has been no evidence of human-tohuman transmission. Influenza A(H9N2) activity from 19 February to 23 September 2013 No human cases of A(H9N2) infection have been reported in this period. A(H9N2) viruses continue to be isolated from birds in many regions of the world. Influenza A(H9N2) candidate vaccine viruses Based on the current antigenic, genetic and epidemiologic data, no new A(H9N2) candidate vaccine viruses are proposed. The available A(H9N2) candidate vaccine viruses are listed in Table 6. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2
(2) Grippe A(H9N2) Les virus grippaux A(H9N2) sont enzootiques parmi les populations de volailles de certaines parties de l’Afrique, de l’Asie et du Moyen-Orient. La majorité des virus qui ont été séquencés appartiennent au clade G1, chicken/Beijing (Y280/G9) ou eurasien. Depuis 1998, année au cours de laquelle on a détecté le premier cas d’infection humaine, l’isolement des virus A(H9N2) chez l’homme ou chez le porc a été rarement notifié. Dans tous les cas connus chez l’homme, les symptômes associés ont été bénins et aucune transmission interhumaine n’a été mise en évidence. Activité de la grippe A(H9N2) du 19 février au 23 septembre 2013 Aucun cas humain d’infection par le virus A(H9N2) n’a été notifié pendant cette période. Des virus A(H9N2) continuent d’être isolés chez des oiseaux dans de nombreuses régions du monde. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H9N2) Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H9N2) n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H9N2) disponibles sont recensés dans le Tableau 6. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
2
Candidate vaccine viruses and potency testing reagents for influenza A(H5N1). Available at http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/en/, accessed September 2013.
2
Candidate vaccine viruses and potency testing reagents for influenza A(H5N1). Disponible à l’adresse: http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/en/, consulté en septembre 2013. Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
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Table 5 Status of development of influenza A(H5N1) candidate vaccine virus Tableau 5 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H5N1) Available – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Availability – Disponibilité Pending – En attente Pending – En attente Pending – En attente Pending – En attente Pending – En attente
Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Viet Nam/1203/2004 (CDC-RG; SJRG-161052) A/Viet Nam/1194/2004 (NIBRG-14) A/Cambodia/R0405050/2007 (NIBRG-88) A/duck/Hunan/795/2002 (SJRG-166614) A/Indonesia/5/2005 (CDC-RG2) A/Indonesia/NIHRD11771/2011 (NIIDRG-9) A/bar-headed goose/Qinghai/1A/2005 (SJRG-163222) A/chicken/India/NIV33487/2006 (IBCDC-RG7) A/whooper swan/Mongolia/244/2005 (SJRG-163243) A/Egypt/2321-NAMRU3/2007 (IDCDC-RG11) A/turkey/Turkey/1/2005 (NIBRG-23) A/Egypt/N03072/2010 (IDCDC-RG29) A/Egypt/3300-NAMRU3/2008 (IDCDC-RG13) A/common magpie/Hong Kong/5052/2007 (SJRG-166615) A/Hubei/1/2010 (IDCDC-RG30) A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010 (SJ-003) A/chicken/Hong Kong/AP156/2008 (SJ-002) A/Anhui/1/2005 (IBCDC-RG6) A/duck/Laos/3295/2006 (CBER-RG1) A/Japanese white eye/Hong Kong/1038/2006 (SJRG-164281) A/goose/Guiyang/337/2006 (SJRG-165396) A/chicken/Viet Nam/NCVD-016/2008 (IDCDC-RG12) A/chicken/Viet Nam/NCDV-03/2008 (IDCDC-RG25A) Candidate vaccine viruses in preparation – Virus vaccinaux candidats en préparation A/chicken/Bangladesh/11RS1984-30/2011-like A/Guizhou/1/2013-like A/duck/Bangladesh/19097/2013-like A/duck/Viet Nam/NCVD-1584/2012-like A/Cambodia/W0526301/2012-like a
Clade 1 1 1.1 2.1 2.1.3.2 2.1.3.2 2.2 2.2 2.2 2.2.1 2.2.1 2.2.1 2.2.1.1 2.3.2.1 2.3.2.1 2.3.2.1 2.3.4 2.3.4 2.3.4 2.3.4 4 7.1 7.1 Clade 2.3.4.2 2.3.4.2 2.3.2.1 2.3.2.1 1.1
Institutiona CDC and SJCRH NIBSC NIBSC SJCRH CDC NIID SJCRH CDC/NIV SJCRH CDC NIBSC CDC CDC SJCRH CDC SJCRH SJCRH CDC FDA SJCRH SJCRH CDC CDC Institution CDC CDC/CCDC SJCRH NIBSC CDC
Institutions distributing the candidate vaccine viruses: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, USA; CDC/CCDC, Centers for Disease Control and Prevention, USA/Chinese Centers for Disease Control and Prevention; CDC/NIV, Centers for Disease Control and Prevention, USA/National Institute of Virology, India; FDA, Food and Drug Administration, USA; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control (a centre of the Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), UK; NIID- National Institute of Infectious Diseases, Japan; SJCRH, St Jude Children’s Research Hospital, USA. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; CDC/CCDC, CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis/Centres chinois de contrôle et de prévention des maladies, Chine; CDC/NIV, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis, en collaboration avec le National Institute of Virology, Inde; FDA, Food and Drug Administration, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, (un centre sur les produits médicamenteux et de soins de l’agence de réglementation (MHRA), Royaume-Uni; NIID, Institut national des maladies infectieuses, Japon ; SJCRH, St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis. 457
releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 18 octobRE 2013
Table 6 Status of development of A(H9N2) candidate vaccine virus Tableau 6 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H9N2) Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Hong Kong/1073/1999 A/chicken/Hong Kong/G9/1997 (NIBRG-91) A/chicken/Hong Kong/G9/1997 (IBCDC-2) A/Hong Kong/33982/2009 (IDCDC-RG26) A/Bangladesh/0994/2011 (IDCDC-RG31) a
Type Wild type – Type sauvage Reverse genetics – Génétique inverse Conventional reassortant – Réassorti classique Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse
Clade G1 Y280/G9 Y280/G9 G1 G1
Institutiona NIBSC NIBSC CDC CDC CDC
Available – Disponibilité Yes Yes Yes Yes Yes
Institutions distributing the candidate vaccine viruses: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, USA; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency (a centre of the Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), UK. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats:CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control (un centre sur les produits médicamenteux et de soins de l’agence de réglementation (MHRA), Royaume-Uni.
(3) Influenza A(H7) Influenza A(H7) viruses have been detected in poultry populations worldwide with the associated disease ranging from mild to severe. Occasionally, during outbreaks in poultry, human cases have been detected in those with direct poultry exposure. These infections often cause conjunctivitis or mild influenza-likeillness3, 4 but some H7 infections, notably A(H7N9),5 can cause severe respiratory disease. Influenza A(H7N9) activity from February to 23 September 2013 The first instance of A(H7N9) infecting humans was reported to WHO on 31 March 2013. There were 135 human cases including 44 deaths. Geographic distribution of these human cases (and genetically related avian and/ or environmental samples) has been restricted to China. HA gene sequence and HI test comparison of A(H7N9) viruses isolated from humans and poultry suggest limited genetic and antigenic diversity among this group of viruses (Table 7 and Figure 4). Influenza A(H7N9) candidate vaccine viruses Based on the current epidemiologic data, A(H7N9) candidate vaccine viruses have been developed. Available A(H7N9) candidate vaccine viruses are shown in Table 8. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@ who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2
(3) Grippe A(H7) Des virus grippaux A(H7) ont été décelés dans des populations de volailles partout dans le monde, avec une maladie associée allant de bénigne à sévère. Occasionnellement, lors des flambées touchant des volailles, des cas d’infection humaine ont été détectés chez des personnes exposés directement à ces oiseaux. Ce type d’infection est souvent à l’origine d’une conjonctivite ou d’un syndrome de type grippal bénin,3, 4 mais certaines infections par des virus H7, et notamment par des virus A(H7N9),5 peuvent aussi provoquer une maladie respiratoire sévère. Activité de la grippe A(H7N9) du mois de février au 23 septembre 2013 Le premier cas d’infection humaine par un virus A(H7N9) a été notifié à l’OMS le 31 mars 2013. Il y eu au total 135 cas humains, parmi lesquels 44 décès. La distribution géographique de ces cas humains (et celle des virus génétiquement apparentés isolés dans des échantillons aviaires et/ou environnementaux) se limite à la Chine. Le séquençage des gènes de l’hémagglutinine HA et la comparaison des épreuves d’IH réalisées sur des virus A(H7N9) isolés chez des êtres humains ou chez des volailles laissent entrevoir une diversité génétique et antigénique limitées parmi ce groupe de virus (Tableau 7 et Figure 4). Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H7N9) Sur la base des données épidémiologiques actuelles, des virus vaccinaux candidats A(H7N9) ont été mis au point. Les virus vaccinaux candidats A(H7N9) disponibles sont présentés dans le Tableau 8. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
3
Tweed, SA et al. Human illness from avian influenza H7N3, British Columbia. Emerging Infectious Diseases, 2004, 10(12): 2196–2199. de Jong MC et al. Intra- and interspecies transmission of H7N7 highly pathogenic avian influenza virus during the avian influenza epidemic in the Netherlands in 2003. Revue scientifique et technique de l’Office international des épizooties (OIE), 2009, 28(1):333–340. Avian influenza A(H7N9) virus. Available at http://www.who.int/influenza/human_ animal_interface/influenza_h7n9/en/, accessed September 2013.
3
Tweed, SA et al. Human illness from avian influenza H7N3, British Columbia. Emerging Infectious Diseases, 2004, 10(12): 2196-2199. de Jong MC et al. Intra- and interspecies transmission of H7N7 highly pathogenic avian influenza virus during the avian influenza epidemic in the Netherlands in 2003. Revue scientifique et technique de l’Office international des épizooties (OIE), 2009, 28(1):333-340. Virus de la grippe aviaire A(H7N9). Disponible à l’adresse: http://www.who.int/influenza/ human_animal_interface/influenza_h7n9/en/, consulté en septembre 2013. Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
4
4
5
5
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Table 7 Haemagglutination inhibition reactions of influenza A(H7N9) viruses Tableau 7 Réactions d’inhibition de l’hémagglutination obtenues avec les virus grippaux A(H7N9) Reference antigens – Antigènes de référence A/Anhui/1/2013 A/Shanghai/2/2013 A/wild gs/Dongting/PC0360/2012 A/mallard/Netherlands/12/2000 Test antigens – Antigènes d’épreuve A/Shanghai/1/2013 A/Jiangsu/01/2013 A/Zhejiang/01/2013 A/Beijing/01-A/2013 A/Henan/01/2013 A/Shandong/01/2013 A/Fujian/01/2013 A/Jiangxi/01/2013 A/Hunan/01/2013 A/Anhui/02/2013 A/Shandong/0068A/2013 A/chicken/Shanghai/S1053/2013 A/pigeon/Shanghai/S1069/2013 A/environment/Shandong/1/2013 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 H7N9 160 320 320 320 160 320 320 320 160 320 320 160 320 320 320 640 640 640 320 640 640 640 640 1280 640 320 640 640 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 160 80 80 160 640 640 640 640 320 320 640 640 640 640 640 640 640 1280 Subtype H7N9 H7N9 H7N7 H7N3 AH1 320 320 40 160 SH2 640 640 160 320 PC360 80 80 160 80 NL12 320 1280 640 640
Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum homologue.
Influenza A(H7N3) activity from 19 February to 23 September 2013 Highly pathogenic A(H7N3) viruses continue to circulate in poultry in Mexico. No human cases have been reported during this period. Influenza A(H7N7) activity from 19 February to 23 September 2013 Since 14 August 2013 there have been 6 outbreaks of highly pathogenic avian influenza A(H7N7) in poultry in Italy. Three cases of A(H7N7) conjunctivitis were documented in personnel involved in culling operations with one case developing influenza-like illness. All individuals recovered without treatment. Genetically, the A(H7N7) viruses were similar to low pathogenic viruses circulating in wild birds in Europe and those causing sporadic and limited outbreaks in poultry in Central and Northern Europe (Figure 4). Antigenically, the A(H7N7) virus reacted well to post-infection ferret antisera raised against the candidate vaccine viruses A/turkey/Virginia/4529/2002 (H7N2) IBCDC-5 and A/mallard/Netherlands/12/2000 (H7N7) IBCDC-1. releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 18 octobRE 2013
Activité de la grippe A(H7N3) du 19 février au 23 septembre 2013 Des virus A(H7N3) hautement pathogènes continuent de circuler chez les volailles au Mexique. Aucun cas humain n’a été notifié pendant cette période. Activité de la grippe A(H7N7) du 19 février au 23 septembre 2013 Depuis le 14 août 2013, il y a eu 6 flambées de grippe de grippe aviaire hautement pathogène A(H7N7) chez les volailles en Italie. Trois cas de conjonctivite à A(H7N7) ont été enregistrés parmi le personnel participant aux opérations d’abattage, l’un d’entre eux ayant également présenté un syndrome de type grippal. Toutes ces personnes se sont rétablies sans traitement. Génétiquement, ces virus A(H7N7) étaient similaires à des virus faiblement pathogènes circulant en Europe chez des oiseaux sauvages et à ceux à l’origine de flambées sporadiques et limitées chez les volailles en Europe centrale et septentrionale (Figure 4). Sur la plan antigénique, ces virus A(H7N7) réagissaient bien avec des immunsérums de furet postinfection obtenus après inoculation des virus vaccinaux candidats A/turkey/Virginia/4529/2002 (H7N2) IBCDC-5 et A/mallard/ Netherlands/12/2000 (H7N7) IBCDC-1. 459
Figure 4 Phylogenetic relationships of A(H7) virus haemagglutinin genes Figure 4 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine des virus grippaux A(H7) appartenant au clade 1.1
The available candidate vaccine viruses are in bold and the HI reference viruses are highlighted in grey. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus vaccinaux candidats disponibles sont indiqués en caractères gras et les virus de référence pour l’épreuve d’IH sont surlignés en gris. Les virus humains sont repérés par (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site. 460 Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
Table 8 Status of development of influenza A(H7N9) candidate vaccine virus Tableau 8 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H7N9) Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Anhui/1/2013 (H7N9) IDCDC-RG33Ab A/Anhui/1/2013 (H7N9) NIBRG-268 A/Anhui/1/2013 (H7N9) NIIDRG-10.1 A/Shanghai/2/2013 (H7N9) NIBRG-267 A/Shanghai/2/2013 (H7N9) CBER-RG4A A/Shanghai/2/2013 (H7N9) IDCDC-RG32A a
Type Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse
Institutiona CDC NIBSC NIID NIBSC FDA CDC
Available – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui
Institutions distributing the candidate vaccine viruses: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, USA; FDA, Food and Drug Administration, USA; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency (a centre of the Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), UK; NIID- National Institute of Infectious Diseases, Japan. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; FDA, Food and Drug Administration, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control (un centre sur les produits médicamenteux et de soins de l’agence de réglementation (MHRA), Royaume-Uni; NIID, Institut national des maladies infectieuses, Japon; SJCRH, St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis. Downgrading of biosafety level pending WHO working group review. – La diminution du niveau de sécurité biologique dépend du rapport du groupe de travail du l’OMS.
b
Table 9 Status of development of influenza A(H7) candidate vaccine virus Tableau 9 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H7) Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/turkey/Virginia/4529/2002 (H7N2) IBCDC-5 A/mallard/Netherlands/12/2000 (H7N7) IBCDC-1 A/mallard/Netherlands/12/2000 (H7N3) NIBRG-60 A/mallard/Netherlands/12/2000 (H7N1) NIBRG-63 A/Canada/RV444/2004 (H7N3) A/New York/107/2003 (H7N2) NIBRG-109 a
Type Conventional reassortant – Réassorti classique Conventional reassortant – Réassorti classique Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse
Institutiona CDC CDC NIBSC NIBSC SJCRH NIBSC
Institutions distributing the candidate vaccine viruses: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, USA; FDA, Food and Drug Administration, USA; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency (a centre of the Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), UK; NIID- National Institute of Infectious Diseases, Japan ; SJCRH, St Jude Children’s Research Hospital, USA. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control (un centre sur les produits médicamenteux et de soins de l’agence de réglementation (MHRA), Royaume-Uni; NIID, Institut national des maladies infectieuses, Japon; SJCRH, St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis.
Influenza A(H7) candidate vaccine viruses Available A(H7) candidate vaccine viruses are shown in Table 9 additional to those available for A(H7N9) described in Table 8. Based on current data, no new A(H7N3) or A(H7N7) candidate vaccine viruses are proposed. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@ who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2
Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H7) Les virus vaccinaux candidats A(H7) disponibles sont presentés dans le Tableau 9 en plus de ceux disponibles pour préparer un vaccin contre la grippe A(H7N9) décrits dans le Tableau 8. Au vu des données actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H7N3) ou A(H7N7) n’est proposé. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
(4) Influenza A(H3N2) variant (v)6 Influenza A(H3N2) viruses are enzootic in swine populations in most regions of the world. Depending on
(4) Variant du virus grippal A(H3N2) [A(H3N2)v)]6 Des virus grippaux A(H3N2) sont enzootiques parmi les populations porcines de la plupart des régions du monde. Les
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Standardization of terminology for the variant A(H3N2) virus recently infecting humans. Available at http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ ah3n2v/en/index.html/, accessed September 2013.
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Standardization of terminology for the variant A(H3N2) virus recently infecting humans. Disponible à l’adresse: http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ah3n2v/en/index.html/, consulté en septembre 2013. 461
releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 18 octobRE 2013
Table 10 Status of development of A(H3N2)v candidate vaccine virus Tableau 10 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H3N2)v Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Minnesota/11/2010 (NYMC X-203) A/Indiana/10/2011 (NYMC X-213) a
Type Conventional reassortant – Réassorti classique Conventional reassortant – Réassorti classique
Institution CDCa CDC
Institution distributing the candidate vaccine viruses: – CDC, Centers for Disease Control and Prevention, USA. – Institution distribuant les virus vaccins candidats: CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis.
geographic location, the genetic and antigenic characteristics of these viruses differ. Human infections with swine A(H3N2) viruses have been documented in Asia, Europe and North America.7 Influenza A(H3N2)v activity from 19 February to 23 September 2013 Eighteen human cases of A(H3N2)v infection were reported in the United States (USA) during this reporting period.8 These viruses were genetically and antigenically similar to previously characterized A(H3N2)v viruses. All cases had known exposure to swine at agricultural fairs. Similar viruses continue to be isolated from pigs in the USA. Influenza A(H3N2)v candidate vaccine viruses Based on the current antigenic, genetic and epidemiologic data, no new A(H3N2)v candidate vaccine viruses are proposed. Available candidate vaccine viruses are shown in Table 10. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrswhohq@who.int or Centers for Disease Control and Prevention, USA.
caractéristiques génétiques et antigéniques de ces virus diffèrent selon le lieu géographique. Des infections humaines par des virus porcins A(H3N2) ont été attestées en Asie, en Europe et en Amérique du Nord.7 Activité de la grippe A(H3N2)v du 19 février au 23 septembre 2013 Dix-huit cas humains d’infection par un virus A(H3N2)v infection ont été notifiés aux Etats-Unis pendant la période couverte par le rapport.8 Ces virus étaient similaires sur le plan génétique et antigénique aux virus A(H3N2)v précédemment caractérisés. Tous les cas avaient subi une exposition connue aux porcs lors de foires agricoles. Des virus similaires continuent d’être isolés chez les porcs aux Etats-Unis. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H3N2)v Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H3N2)v n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats disponibles sont présentés dans le Tableau 10. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les Centers for Disease Control and Prevention des Etats-Unis.
(5) Influenza A(H1N1)v Influenza A(H1N1) viruses circulate in swine populations in many regions of the world. Depending on geographic location, the genetic characteristics of these viruses differ. Human infections with swine A(H1) viruses have been documented for many years.9 Two human infections with A(H1N1)v viruses have been detected in the USA during the reporting period. These viruses are genetically similar to viruses circulating in swine in the region and to A(H1N1)v viruses detected in previous years. Influenza A(H1N1)v candidate vaccine viruses Based on a risk assessment of the antigenic and genetic characteristics of the A(H1N1)v viruses, candidate vaccine viruses are not proposed at this time. 7
(5) Grippe A(H1N1)v Des virus grippaux A(H1N1) circulent parmi les populations porcines dans de nombreuses régions du monde. Les caractéristiques génétiques de ces virus diffèrent selon le lieu géographique. Des infections humaines par des virus porcins A(H1) ont été enregistrées pendant un grand nombre d’années.9 Deux infections humaines par des virus A(H1N1)v ont été détectées aux Etats-Unis sur la période couverte par le rapport. Ces virus étaient génétiquement similaires aux virus circulant chez les porcs dans la région et aux virus A(H1N1)v détectés au cours des années antérieures. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H1N1)v Au vu de l’évaluation des risques liés aux caractéristiques antigéniques et génétiques des virus A(H1N1)v, il n’est pas proposé de virus vaccinal candidat en ce moment. 7
Myers KP et al. Cases of swine influenza in humans: a review of the literature. Clinical Infectious Diseases, 2007, 44:1084–1088. Situation summary on influenza A (H3N2) variant viruses (H3N2v). Available at http://www.cdc.gov/flu/swineflu/h3n2v-situation.htm, accessed September 2013. Shu B et al. Genetic analysis and antigenic characterization of swine origin influenza viruses isolated from humans in the United States, 1990–2010. Virology, 2012, 422:151.
Myers KP et al. Cases of swine influenza in humans: a review of the literature. Clinical Infectious Diseases, 2007, 44:1084-1088. Situation summary on influenza A (H3N2) variant viruses (H3N2v). Disponible à l’adresse: http:// www.cdc.gov/flu/swineflu/h3n2v-situation.htm, consulté en septembre 2013. Shu B et al. Genetic analysis and antigenic characterization of swine origin influenza viruses isolated from humans in the United States, 1990-2010. Virology, 2012, 422:151. Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
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(6) Influenza A(H6N1) A human infection with A(H6N1) virus was detected in Taiwan, China in May.10 No human A(H6N1) infections had been detected previously. The virus was genetically similar to viruses isolated from chickens in Taiwan, China but different from A(H6N1) viruses circulating in poultry in other regions of Asia. Influenza A(H6N1) candidate vaccine viruses Based on a risk assessment, no candidate vaccine viruses have been proposed at this time. 10
(6) Grippe A(H6N1) Une infection humaine par un virus A(H6N1) a été détectée à Taïwan, en Chine, au mois de mai.10 Aucune infection humaine par un tel virus n’avait été repérée auparavant. Le virus en cause était similaire sur le plan génétique à des virus isolés chez les poulets à Taïwan, mais différait des virus A(H6N1) circulant chez les volailles dans d’autres régions d’Asie. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H6N1) Sur la base de l’évaluation des risques, aucun virus vaccinal candidat n’a été proposé pour le moment. 10
Yuan, J. et al. Origin and molecular characteristics of a novel 2013 avian influenza A(H6N1) virus causing human infection in Taiwan, 2013. Clinical Infectious Diseases, 2013 [Epub ahead of print].
Yuan, J. et al. Origin and molecular characteristics of a novel 2013 avian influenza A(H6N1) virus causing human infection in Taiwan, 2013. Clinical Infectious Diseases, 2013 [Epub en avance d’impresssion].
How to obtain the WER through the Internet (1) WHO WWW server: Use WWW navigation software to connect to the WER pages at the following address: http://www.who.int/wer/ (2) An e-mail subscription service exists, which provides by electronic mail the table of contents of the WER, together with other short epidemiological bulletins. To subscribe, send a message to listserv@who.int. The subject field should be left blank and the body of the message should contain only the line subscribe wer-reh. A request for confirmation will be sent in reply.
Comment accéder au REH sur Internet? 1) Par le serveur Web de l’OMS: A l’aide de votre logiciel de navigation WWW, connectez-vous à la page d’accueil du REH à l’adresse suivante: http://www.who.int/wer/ 2) Il existe également un service d’abonnement permettant de recevoir chaque semaine par courrier électronique la table des matières du REH ainsi que d’autres bulletins épidémiologiques. Pour vous abonner, merci d’envoyer un message à listserv@who.int en laissant vide le champ du sujet. Le texte lui même ne devra contenir que la phrase suivante: subscribe wer-reh.
WWW access • http://www.who.int/wer E-mail • send message subscribe wer-reh to listserv@who.int Fax: (+4122) 791 48 21/791 42 85 Contact: wantzc@who.int or wer@who.int
Accès WWW • http://www.who.int/wer Courrier électronique • envoyer message subscribe wer-reh à listserv@who.int Fax: +41-(0)22 791 48 21/791 42 85 Contact: wantzc@who.int ou wer@who.int
Monthly report on dracunculiasis cases, January–August 2013 In order to monitor the progress accomplished towards dracunculiasis eradication, district-wise surveillance indicators, a line list of cases and a line list of villages with cases are sent to WHO by the national dracunculiasis eradication programmes. Information below is summarized from these reports. releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 18 octobRE 2013
Rapport mensuel des cas de dracunculose, janvier-août 2013 Afin de suivre les progrès réalisés vers l’éradication de la dracunculose, les programmes nationaux d’éradication de la dracunculose envoient à l’OMS des indicateurs de surveillance des districts sanitaires, une liste exhaustive des cas ainsi qu’une liste des villages ayant signalé des cas. Les renseignements ci-dessous sont résumés à partir de ces rapports. 463
Country – Pays
Total no. of rumoursb of suspected dracunculiasis cases in 2013 Date of receipt of the reporta– Date de – Nombre a réception du rapport total de rumeursb de cas suspects January – de dracunculose en 2013 Janvier 3 October 2013 – 3 octobre 2013 7 October 2013 – 7 octobre 2013 4 October 2013 – 4 octobre 2013 30 September 2013 – 30 septembre 2013 867 495 20 280 0 0 0 0
No. of new dracunculiasis cases reported in 2013c – Nombre de nouveaux cas de dracunculose signalés en 2013c
February – March – April – Février Mars Avril
May – Mai
June – Juin
July – August – Juillet Août
Total no. of reported Total no. of cases for the same villages months of 2012 – reporting cases in Nombre total de – Nombre total de cas signalés pour villages signalant les mêmes mois des cas en en 2012 Total 2013 2012
Year – Année
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Month of emergence of last reported indigenous case – Mois d’émergence du dernier cas autochtone signalé
Endemic countries – Pays d’endémie Chad – Tchad Ethiopia – Ethiopie Malid South Sudan – Soudan du Sud Côte d’Ivoire Ghana Kenya Niger Nigeria – Nigéria Sudan – Soudan Total 0 0 0 2 0 0 0 4 3 1 0 25 1 4 3 24 1 1 1 19 2 0 0 13 1 0 0 9 8 6 4 96 7 3 4 485 8 4 3 70 7 3 3 250 August 2013 – Août 2013 June 2013 – Juin 2013 June 2013 – Juin 2013 August 2013 – Août 2013
Precertification countries – Pays au stade de la précertification 27 September 2013 – 27 septembre 2013 10 October 2013 – 10 octobre 2013 25 September 2013 – 25 septembre 2013 16 September 2013 – 16 septembre 2013 4 October 2013 – 4 octobre 2013 1 October 2013 – 1er octobre 2013 64 279 1 117 211 198 21532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 29 0 0 0 0 0 0 32 0 0 0 0 0 1e 23 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 1 115 0 0 0 0 0 0 499 0 0 0 0 0 1 86 0 0 0 0 0 0 263 July 2006 – Juillet 2006 May 2010 – Mai 2010 October 1994 – Octobre 1994 October 2008 – Octobre 2008 November 2008 – Novembre 2008 June 2013 – Juin 2013
Source: Ministries of Health – Ministères de la Santé. a Each monthly report is due by the 30th of the following month. – Chaque rapport mensuel est attendu pour le 30 du mois suivant. b Rumour of dracunculiasis. Information about an alleged case of dracunculiasis (Guinea-worm disease) obtained from any source (informants). – Rumeur de dracunculose. Information au sujet d’un cas présumé de dracunculose (maladie du ver de Guinée) obtenue à partir de n’importe quelle source (informateurs). The total number of dracunculiasis cases includes both indigenous and imported cases.– Le nombre total de cas de dracunculose regroupe les cas autochtones et les cas importés. d Data regarding the number of dracunculiasis cases reported in Mali for the months of May and June were updated from the latest report published (see No. 39, 2013, pp. 427–428).– Les données concernant le nombre de cas de dracunculose signalés au Mali au cours des mois de mai et juin ont été mises à jour en se basant sur le dernier rapport publié (voir le No 39, 2013, pp. 427-428). e Based on laboratory report from the WHO Collaborating Centre (at the US Centers for Diseases Control and Prevention) of the worm sample from a suspected case in southern Darfur region of Sudan. The source of transmission is being investigated. – Basé sur le rapport de laboratoire fourni par le centre collaborateur de l’OMS (situé au sein des Centers for Diseases Control and Prevention des Etats-Unis) concernant un échantillon de ver prélevé chez un cas présumé vivant dans une région du sud du Darfour, au Soudan. L’enquête pour déterminer la source de transmission est en cours. NR= No report received for the month. – Aucun rapport reçu pour le mois. c
Weekly epidemiological record, No. 42, 18 octoBER 2013
No. of dracunculiasis cases reported worldwide, 2009–2013 – Nombre de cas de dracunculose signalés dans le monde, 2009-2013 2009 2010 2011 2012 2013 2588 1440 969 499
3190 1797 1058 542 The value outside the bar indicates the total number of dracunculiasis cases reported for that year. – La valeur à l’extérieur de la barre indique le nombre total de cas de dracunculose signalés pour l’année en question. The shaded portion and the number inside the bar indicate reported dracunculiasis cases for that period compared with the number of cases reported in 2013. – La portion colorée et le nombre à l’intérieur de la barre indiquent le nombre de cas de dracunculose au cours de cette période comparativement au nombre de cas signalés en 2013.
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