2012, 87, 401–412
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Weekly epidemiological record Relevé épidémiologique hebdomadaire 19 october 2012, 87th year / 19 octobre 2012, 87e année No. 42, 2012, 87, 401–412 http://www.who.int/wer
Contents 401 Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness
Sommaire 401 Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats en vue de la préparation à une pandémie
Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness September 2012 The development of representative candidate influenza vaccine viruses, coordinated by WHO, remains an essential component of the overall global strategy for pandemic preparedness. Comparisons of the candidate vaccine viruses with respect to antigenicity and their relationship to newly emerging viruses are ongoing and will be reported periodically by WHO.
Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats en vue de la préparation à une pandémie Septembre 2012 La mise au point de virus vaccinaux candidats représentatifs, coordonnée par l’OMS, reste une composante essentielle de la stratégie mondiale de préparation à une pandémie grippale. Les comparaisons entre virus vaccinaux candidats sous l’angle de l’antigénicité et de la parenté avec les nouveaux virus émergents se poursuivent et l’OMS en rendra compte périodiquement.
(1) Influenza A(H5N1) Since their re-emergence in 2003, highly pathogenic avian influenza A(H5N1) viruses have become enzootic in some countries and continue to cause outbreaks in poultry as well as sporadic human infections. The A(H5N1) viruses have diversified both genetically and antigenically leading to the need for multiple candidate vaccine viruses for pandemic preparedness purposes. This summary provides updates on the characterization of A(H5N1) viruses isolated from birds and humans, and the current status of the development of candidate A(H5N1) vaccine viruses. Influenza A(H5N1) activity: 23 February –18 September 2012 A(H5N1) viruses have been detected in birds in Africa, Asia and the Middle East, and from a cat in Israel. Human infections have been reported to WHO by Bangladesh, Cambodia, Hong Kong Special Administrative Region of China (Hong Kong SAR), Egypt, Indonesia and Viet Nam, countries in which infections have also been detected in birds (Table 1). Antigenic and genetic characteristics of influenza A(H5N1) viruses The nomenclature for phylogenetic relationships among the haemagglutinin (HA) genes of A(H5N1) viruses is defined in con-
1) Grippe A(H5N1) Depuis leur réémergence en 2003, les virus de la grippe aviaire A(H5N1) hautement pathogène sont devenus enzootiques dans certains pays et continuent de provoquer des flambées chez les volailles et des infections sporadiques chez l’homme. Ces virus se sont diversifiés sur le plan génétique et antigénique, d’où la nécessité de mettre au point plusieurs virus vaccinaux candidats dans le cadre de la préparation à une pandémie. Le présent résumé fait le point sur la caractérisation des virus A(H5N1) isolés chez des oiseaux et chez l’homme et sur l’état d’avancement de la préparation des virus vaccinaux candidats A(H5N1). Activité de la grippe A(H5N1): 23 février-18 septembre 2012 Des virus A(H5N1) ont été détectés chez des oiseaux en Afrique, en Asie et au MoyenOrient, ainsi que chez un chat en Israël. Des infections humaines ont été notifiées à l’OMS par le Bangladesh, le Cambodge, Hong Kong, Région administrative spéciale de la Chine (Hong Kong RAS), l’Égypte, l’Indonésie et le Viet Nam, pays où l’on a également recensé des cas d’infection chez les oiseaux (Tableau 1). Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux A(H5N1) La nomenclature des liens de parenté phylogénétique existant entre les gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) est 401
World Health Organization Geneva Organisation mondiale de la Santé Genève Annual subscription / Abonnement annuel Sw. fr. / Fr. s. 346.– 10.2012 ISSN 0049-8114 Printed in Switzerland
Table 1 Influenza A(H5N1) activity, 23 February–18 September 2012 Tableau 1 Activité de la grippe A(H5N1), 23 février-18 septembre 2012 Country, area or territory – Pays, zone ou territoire Bangladesh Bhutan – Bhoutan Cambodia – Cambodge China – Chine China, Hong Kong SAR – Hong Kong, Région administrative spéciale de la Chine Egypt – Égypte India – Inde Indonesia – Indonésie Israel – Israël Myanmar Nepal – Népal Viet Nam Host – Hôte Poultry – Volailles Human (3)a – Humain (3)a Poultry – Volailles Poultry – Volailles Human (2) – Humain (2) Poultry – Volailles Wild birds – Oiseaux sauvages Human (1) – Humain (1) Poultry – Volailles Humans (5) – Humain (5) Poultry – Volailles Wild birds – Oiseaux sauvages Poultry – Volailles Humans (5) – Humain (5) Poultry – Volailles Feline – Félin Poultry – Volailles Poultry – Volailles Wild birds – Oiseaux sauvages Poultry – Volailles Humans (1) – Humain (1) Genetic clade – Clade génétique 2.3.2.1 2.3.2.1 [3]b 2.3.2.1 1.1 1.1 [2] 2.3.2.1/7.2 2.3.2.1 2.3.2.1 [1] 2.2.1 2.2.1 [2] 2.3.2.1 2.3.2.1 Unknown – Inconnue 2.1.3.2 [1] 2.2.1 2.2.1 2.3.4.2 2.3.2.1 2.3.2.1 1.1/2.3.2.1 1.1 [1]
a
Numbers in parentheses denote number of reported cases during this period. – Les chiffres entre parenthèses correspondent au nombre de cas confirmés survenus au cours de cette période. Numbers in brackets denote the number of viruses for which genetic information is available. – Les chiffres entre crochets correspondent au nombre de virus pour lesquels les caractéristiques génétiques sont connues.
b
sultation with representatives of WHO, the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO), the World Organisation for Animal Health (OIE) and academic institutions. The updated nomenclature report can be found on the WHO website.1 Viruses circulating and characterized from 23 February to 18 September 2012 belonged to the following clades. Clade 1.1 viruses were detected in poultry and humans in Cambodia and Viet Nam. Genetic characterization of the HA genes showed that the human and poultry viruses were closely related to each other and to viruses detected previously in these countries. The recent avian viruses reacted well with post-infection ferret antisera raised against the clade 1 virus A/Viet Nam/1203/2004 from which candidate vaccine viruses have been developed. Clade 2.1.3.2 viruses were detected in humans in Indonesia during this period. Genetic characterization of the HA genes of these viruses and recently circulating viruses from poultry showed that they were similar to previously reported clade 2.1.3.2 viruses but are diver1
définie en consultation avec des représentants de l’OMS, de l’Organisation des Nations Unies pour l’Alimentation et l’Agriculture (FAO), de l’Organisation mondiale de la Santé animale (OIE) et d’établissements d’enseignement supérieur. Le rapport portant sur l’actualisation de cette nomenclature est consultable sur le site Web de l’OMS.1 Les virus circulants et caractérisés entre le 23 février et le 18 septembre 2012 appartiennent aux clades qui suivent. Clade 1.1 Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles et des êtres humains au Cambodge et au Viet Nam. La caractérisation des gènes de l’hémagglutinine (HA) a montré que les virus humains et aviaires étaient étroitement apparentés entre eux et avaient également des liens de parenté proche avec des virus précédemment détectés dans ces pays. Les virus aviaires récents ont bien réagi en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenu après inoculation du virus A/Viet Nam/1203/2004 appartenant au clade 1, qui a servi à la mise au point de virus vaccinaux candidats. Clade 2.1.3.2 Des virus de ce clade ont été détectés chez des êtres humains en Indonésie au cours de la période considérée. La caractérisation des gènes de l’hémagglutinine (HA) de ces virus et des virus ayant circulé récemment chez les volailles a montré qu’ils étaient similaires aux virus du clade 2.1.3.2 précé1
Updated unified nomenclature system for the highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses. Geneva, World Health Organization, 2011 (http://www.who.int/ influenza/gisrs_laboratory/h5n1_nomenclature/en/, accessed October 2012).
Updated unified nomenclature system for the highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses. Genève, Organisation mondiale de la Santé, 2011. (http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/h5n1_nomenclature/en/, consulté en octobre 2012). Weekly epidemiological record, No. 42, 19 october 2012
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gent from A/Indonesia/5/2005, from which a candidate vaccine virus has been developed (Figure 1). Viruses isolated from humans during 2011 and 2012 showed reduced titres to post-infection ferret antiserum raised against the candidate vaccine virus developed from A/Indonesia/5/2005 (Table 2). Clade 2.2.1 viruses were detected in poultry and humans in Egypt, and in poultry and a cat in Israel. Viruses detected during the period were genetically similar to those isolated previously from poultry and humans in the region. Three human viruses isolated in 2012 reacted well with post-infection ferret antiserum raised against A/Egypt/N03072/2010, a virus from which a candidate vaccine virus has been developed. Clade 2.3.2.1 viruses were detected in wild birds in Hong Kong SAR, India and Nepal, and in poultry in Bangladesh, Bhutan, China, India, Nepal and Viet Nam. Human cases were reported in Bangladesh and Hong Kong SAR. Increased genetic heterogeneity in HA gene sequences was observed within recent viruses from this clade. Two genetic groups, A/Hubei/1/2010-like (Figure 2) and A/barn swallow/Hong Kong/D101161/2010-like (Figure 3), were previously identified. A third group, A/Hong Kong/6841/2010-like (Figure 4), is spreading in southeast Asia. The human virus from Hong Kong SAR and the majority of recent clade 2.3.2.1 avian viruses in the A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010like genetic group reacted well with post-infection ferret antiserum raised against the candidate vaccine virus developed from A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010. The majority of recent avian viruses from the A/Hubei/1/2010-like genetic group reacted well with postinfection ferret antiserum raised against the candidate vaccine virus developed from A/Hubei/1/2010. No viruses were isolated from the human cases in Bangladesh. Recent avian viruses from the A/Hong Kong/6841/2010like genetic group reacted well with post-infection ferret antiserum raised against the candidate vaccine virus developed from the clade 2.3.2.1 virus A/common magpie/ Hong Kong/5052/2007.
demment signalés, mais présentaient des divergences avec le virus A/Indonesia/5/2005, à partir duquel un virus vaccinal candidat a été mis au point (Figure 1). Les virus isolés chez des êtres humains en 2011 et 2012 ont donné des titres d’anticorps réduits en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenu après inoculation du virus vaccinal candidat préparé à partir d’A/Indonesia/5/2005 (Tableau 2). Clade 2.2.1 Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles et des êtres humains en Égypte et chez des volailles et un chat en Israël. Les virus détectés sur cette période étaient génétiquement similaires à ceux isolés précédemment chez des volailles et des êtres humains dans la Région. Trois virus humains isolés en 2012 ont bien réagi en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenu après inoculation du virus A/Egypt/N03072/2010, à partir duquel un virus vaccinal candidat a été mis au point. Clade 2.3.2.1 Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux sauvages à Hong Kong RAS, en Inde et au Népal et également chez des volailles au Bangladesh, au Bhoutan, en Chine, en Inde, au Népal et au Viet Nam. Des cas humains ont été notifiés au Bangladesh et à Hong Kong RAS. On a observé une hétérogénéité génétique accrue dans les séquences de gènes de l’hémagglutinine chez des virus récents de ce clade. Deux groupes génétiques avaient été précédemment identifiés: les virus analogues à A/Hubei/1/2010 (Figure 2) et ceux analogues à A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010 (Figure 3). Un troisième groupe, A/Hong Kong/6841/2010 (Figure 4), se propage en Asie du Sud-Est. Le virus humain provenant de Hong Kong RAS et la majorité des virus aviaires récents du clade 2.3.2.1 appartenant au groupe génétique A/barn swallow/Hong Kong/ D10-1161/2010 ont bien réagi en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenu après inoculation du virus vaccinal candidat mis au point à partir de la souche A/Hubei/1/2010. Aucun virus n’a été isolé chez les cas humains apparus au Bangladesh. Des virus aviaires récents appartenant au groupe génétique A/Hong Kong/6841/2010 ont bien réagi en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenu après inoculation du virus vaccinal candidat mis au point à partir du virus A/common magpie/Hong Kong/5052/2007 appartenant au clade 2.3.2.1.
Table 2 Antigenic properties of influenza A(H5N1) 2.1.3.2 viruses Tableau 2 Propriétés antigéniques des virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 2.1.3.2 Reference antigens – Antigènes de référence A/Indonesia/5/2005 A/Indonesia/5/2005(IBCDC-RG2) A/Indonesia/NIHRD11771/2011 A/Indonesia/6/2005 Test antigens – Antigènes d’épreuve A/Indonesia/NIHRD11931/2011 A/Indonesia/NIHRD11949/2012 A/Indonesia/NIHRD12379/2012 2.1.3.2 2.1.3.2 2.1.3.2 80 80 80 40 40 40 640 640 640 10 10 10 Reference ferret antiserum – Immunsérum de furet de référence Clade 2.1.3.2 2.1.3.2 2.1.3.2 2.1.3.3 IND/5 640 640 320 1280 RG2 640 640 80 640 NIHRD1177/111 160 80 1280 320 IND/6 160 320 40 640
Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antisérum homologue/antigènes. releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 19 octobre 2012 403
Figure 1 Phylogenetic relationships of influenza A(H5N1) clade 2.1.3.2 virus HA genes Figure 1 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) appartenant au clade 2.1.3.2 Viruses underlined are included in the antigenic analysis as presented in Table 2. The available candidate vaccine virus is in bold. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus dont le nom est souligné figurent dans l’analyse antigénique présentée dans le Tableau 2. Le virus vaccinal candidat disponible est indiqué en caractères gras. Les virus humains sont repérés (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site.
0.0050
A/Indonesia/NIHRD11771/2011# A/Indonesia/NIHRD11767/2011# A/chicken/Bangli/BBVD-0245A-4/2011 A/chicken/Tabanan/BBVD-0178-3/2011 A/chicken/Tabanan/BBVD-0212-4/2011 A/chicken/Sukoharjo/BBVW-218-03/2011 A/chicken/Sukoharjo/BBVW-1148-07/2011 A/chicken/Kulon Progo/BBVW-1081-07A/2011 A/chicken/Melak/BPPVRV-32-1/2011 A/chicken/Banjarbaru/BPPVRV-126-4/2011 A/chicken/Gorontalo/BBVM-228-10/2011 A/Indonesia/NIHRD12379/2012# A/chicken/Indonesia/199/2011 A/chicken/Indonesia/200/2011 A/chicken/Kuningan/BBVW-1004-VI/2009 A/chicken/Sleman/BBVW-180-III/2010 A/chicken/Kudus/BBVW-1486-IX/2009 A/Indonesia/8228/2008# A/Indonesia/NIHRD11073/2011# A/chicken/Temanggung/BBVW-1203b-VIII/2009 A/bird/Gunung Kidul/BBVW-52-I/2010 A/Indonesia/NIHRD11931/2011# A/Indonesia/NIHRD11949/2012# A/chicken/Lampung/BPPVRIII-10-161/2010 A/chicken/Indonesia/170/2011 A/chicken/Padang/BPPVRII-62-2/2011 A/Indonesia/7261/2008# A/Indonesia/7272/2008# A/Indonesia/NIHRD11815/2011# A/Indonesia/CDC1032/2007# A/chicken/Banyumas/BBVW-1555b-XII/2008 A/chicken/East Java/Blitar/029/2009 A/chicken/Klaten/BBVW109-II/2010 A/Indonesia/5/2005# A/Indonesia/7379/2008# A/quail/Klaten/BBVW-110-II/2010 A/chicken/Central Java/UT561/2010 A/chicken/South Kalimantan/UT521/2010 A/chicken/Banjarbaru/BPPVRV-26/2010 A/Indonesia/7/2005# A/Indonesia/6/2005#
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A/chicken/Vietnam/HaNoi(SocSon)/NCVD120258(A1416)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD3-31/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-935/2011 A/muscovy duck/Vietnam/NCVD-1220/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1210/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-715/2011 A/duck/Vietnam/QuangNinh(HaLong)/R2-192-29(V167)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-760/2011 A/muscovyclade duck/Vietnam/NCVD-1049/2011 Figure 2 Phylogenetic relationships of influenza A(H5N1) 2.3.2.1 A/Hubei/1/2010-like virus HA genes Figure 2 Classification phylogénétique des gènes A/duck/Vietnam/NCVD-952/2011 de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) analogues au virus A/HuA/duck/Vietnam/NCVD-947/2011 bei/1/2010 et appartenant au clade 2.3.2.1 A/duck/Vietnam/NCVD-1221/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1029/2011 The available candidate vaccine virus is in bold. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Le virus vacA/XX/Vietnam/QuangNam(DiemBang)/R4-CD12-15(A1309)/2012 cinal candidat disponible est indiqué en caractères gras. Les virus humains sont repérés (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site. A/chicken/Vietnam/NCVD-1038/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-806/2011 A/duck/Vietnam/HaiPhong(TienLang)/R2-382/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-1247/2012 A/duck/Lao/152/2011 A/duck/Vietnam/HaNoi(GiaLam)/NCVD120344(A1440)/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-700/2011 A/duck/Vietnam/HaiPhong/R2-12-464-1(A1294)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-712/2011 A/duck/Vietnam/NinhBinh(GiaBien)/NCVD120315(A1433)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1312/2012 A/duck/Vietnam/ThanhHoa(ThangLong)/R3-1-183(V96)/2012 A/duck/Vietnam/BacNinh/NCVD120136(A1285)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD1-48/2011 A/chicken/Vietnam/NgheAn(NamDan)/R3-327(A1487)/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-1059/2011 A/duck/Vietnam/DienBien(TP)/NCVD120437(A1494)/2012 A/chicken/Vietnam/HaNoi(SocSon)/NCVD120258(A1416)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-943/2011 A/duck/Vietnam/NCVD3-31/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-1034/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-935/2011 A/duck/Can Tho Vietnam/CT-S10-739/2009 A/muscovy duck/Vietnam/NCVD-1220/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1210/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-825/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-715/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-815/2010 A/duck/Vietnam/QuangNinh(HaLong)/R2-192-29(V167)/2012 A/Hubei/1/2010# A/duck/Vietnam/NCVD-760/2011 A/muscovy duck/Vietnam/NCVD-1049/2011 A/duck/Vietnam/TayNinh(TanBien)/R6-179/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-952/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-1171/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-947/2011 A/duck/Vietnam/HaNoi/12024(A1171)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1221/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1029/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-1304/2012 A/XX/Vietnam/QuangNam(DiemBang)/R4-CD12-15(A1309)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1306/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-1038/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-1207/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-806/2011 A/duck/Lao/152/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-1206/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-700/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-1217/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-712/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-1219/2012 A/duck/Vietnam/ThanhHoa(ThangLong)/R3-1-183(V96)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD1-48/2011 A/duck/Vietnam/QuangTri(KheSanh)/R3-4-51(V92)/2012 A/chicken/Vietnam/NCVD-1059/2011 A/duck/Vietnam/QuangNam(VinhDien)/R4-219(V113)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-943/2011 A/chicken/Yinmarbin Myanmar/SP-10-295/2010 A/chicken/Vietnam/NCVD-1034/2011 A/duck/Can Tho Vietnam/CT-S10-739/2009 A/chicken/Sittwe Myanmar/11-084/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-825/2011 A/chicken/Tanse Myanmar/SP-11-329/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-815/2010 A/chicken/Nepal/T1P/2012 A/Hubei/1/2010# A/duck/Vietnam/TayNinh(TanBien)/R6-179/2012 A/chicken/Nepal/T4P/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1171/2012 A/duck/Bangladesh/4120T/2011 A/duck/Vietnam/HaNoi/12024(A1171)/2012 A/chicken/India/04MO03/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1304/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1306/2012 A/environment/Bangladesh/1019-G/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1207/2012 A/Bangladesh/2/2012# A/duck/Vietnam/NCVD-1206/2012 A/environment/Bangladesh/1019-E/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1217/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1219/2012 A/chicken/Bangladesh/15841/2012 A/duck/Vietnam/QuangTri(KheSanh)/R3-4-51(V92)/2012 A/crow/India/02CA07/2012 A/duck/Vietnam/QuangNam(VinhDien)/R4-219(V113)/2012 A/Bangladesh/3/2012# A/chicken/Yinmarbin Myanmar/SP-10-295/2010 A/chicken/Sittwe Myanmar/11-084/2011 A/chicken/Bangladesh/42010/2012 A/chicken/Tanse Myanmar/SP-11-329/2011 A/chicken/Bangladesh/15077/2012 A/chicken/Nepal/T1P/2012 A/chicken/Bangladesh/15089/2012 A/chicken/Nepal/T4P/2012 A/duck/Bangladesh/4120T/2011 A/chicken/Bangladesh/15210a/2012 A/chicken/India/04MO03/2012 A/environment/Bangladesh/15114/2012 A/environment/Bangladesh/1019-G/2012 A/Bangladesh/2/2012# A/environment/Bangladesh/15126/2012 A/environment/Bangladesh/1019-E/2012 A/chicken/Bangladesh/15110/2012 A/chicken/Bangladesh/15841/2012 A/duck/Bangladesh/32077/2012 A/crow/India/02CA07/2012 A/chicken/India/09CA10/2011 A/Bangladesh/3/2012# A/chicken/Bangladesh/42010/2012 A/chicken/India/01CA01/2012 A/chicken/Bangladesh/15077/2012 A/crow/India/03CA06/2012 A/chicken/Bangladesh/15089/2012 A/chicken/Bangladesh/11303/2011 A/chicken/Bangladesh/15210a/2012 A/environment/Bangladesh/15114/2012 A/chicken/Bangladesh/15085/2012 A/environment/Bangladesh/15126/2012 A/chicken/Bangladesh/15204/2012 A/chicken/Bangladesh/15110/2012 A/environment/Bangladesh/15661/2012 A/duck/Bangladesh/32077/2012 A/chicken/India/09CA10/2011 A/environment/Bangladesh/16298/2012 A/chicken/India/01CA01/2012 A/duck/Bangladesh/1849/2011 A/crow/India/03CA06/2012 A/crow/Bangladesh/1061/2011 A/chicken/Bangladesh/11303/2011 A/chicken/Bangladesh/15085/2012 A/wild bird/Bhutan/357/2012 A/chicken/Bangladesh/15204/2012 A/chicken/Bhutan/1031/2012 A/environment/Bangladesh/15661/2012 A/chicken/Bhutan/367/2012 A/environment/Bangladesh/16298/2012 A/duck/Bangladesh/1849/2011 A/chicken/Lalitpur/KG-4/2012 A/crow/Bangladesh/1061/2011 A/chicken/Jhapa/JHJ-2/2012 A/wild bird/Bhutan/357/2012 A/chicken/Lalitpur/DG-3/2012 A/chicken/Bhutan/1031/2012 A/chicken/Bhutan/367/2012 A/crow/India/01CA16/2012 A/chicken/Lalitpur/KG-4/2012 A/chicken/Bhutan/260/2012 A/chicken/Jhapa/JHJ-2/2012 A/chicken/Bhutan/1026/2012 A/chicken/Lalitpur/DG-3/2012 A/crow/India/01CA16/2012 A/chicken/Bhutan/345/2012 A/chicken/Bhutan/260/2012 A/chicken/Bhutan/257/2012 A/chicken/Bhutan/1026/2012 A/chicken/Bhutan/345/2012 A/chicken/Bhutan/259/2012 A/chicken/Bhutan/257/2012 A/chicken/Bhutan/01CL140/2012 A/chicken/Bhutan/259/2012 A/duck/Nepal/5Tzoo/2011 A/chicken/Bhutan/01CL140/2012 A/duck/Nepal/5Tzoo/2011 A/chicken/India/01CA06/2012 0.0030 A/chicken/India/01CA06/2012 A/chicken/India/09CA01/2011 0.0030 A/chicken/India/09CA01/2011
releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 19 octobre 2012
405
Figure 3 Phylogenetic relationships of influenza A(H5N1) clade 2.3.2.1 A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010-like virus HA genes Figure 3 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) analogues au virus A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010 et appartenant au clade 2.3.2.1 The available candidate vaccine virus is in bold. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Le virus vaccinal candidat disponible est indiqué en caractères gras. Les virus humains sont repérés (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site.
A/goose/Hong Kong/631.1/2009 A/Guangxi/1/2009# A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010 A/duck/Vietnam/NCVD-927/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-920/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-921/2011 A/swine/Guangxi/NS592/2011 A/duck/Vietnam/NCVD-885/2010 A/duck/Vietnam/NCVD-1025/2011 A/black-headed gull/Hong Kong/84/2012 A/chicken/Hong Kong/5572/2010 A/duck/Vietnam/NCVD-672/2011 A/black-headed gull/Hong Kong/4514/2012 A/Hong Kong/5923/2012# A/oriental magpie robin/Hong Kong/2950/2012 A/Oriental Magpie Robin/Hong Kong/4126/2012 A/Oriental Magpie Robin/Hong Kong/4199/2012 A/black-headed gull/Hong Kong/44/2012 A/Guangdong/1/2011# A/black-headed gull/Hong Kong/6671/2011 A/little egret/Hong Kong/1237/2012 A/little egret/Hong Kong/2883/2012 A/little egret/Hong Kong/2953/2012 A/duck/Vietnam/BachNinh/12001(A1163)/2012 A/chicken/Vietnam/BacNinh/NCVD120107(A1254)/2012 A/duck/Vietnam/BacKan/12053(A1185)/2012 A/duck/Vietnam/ThaiNguyen/NCVD120136(A1283)/2012 A/chicken/Vietnam/ThaiNguyen(PhoYen)/NCVD120329(A1437)/2012 A/duck/Vietnam/NCVD-1160/2011 A/chicken/Vietnam/NCVD-1254/2012 A/black-headed gull/Hong Kong/2348/2012 A/duck/Vietnam/NCVD129-7/2011 A/peregrine falcon/Hong Kong/2316/2012 A/peregrine Falcon/Hong Kong/5089/2012 A/Oriental Magpie Robin/Hong Kong/6783/2012 A/Grey heron/Hong Kong/3030/2012 A/chicken/Hong Kong/7035-1/2011 A/domestic goose/Hong Kong/1771/2012 A/domestic goose/Hong Kong/1733/2011 A/brown-headed gull/Hong Kong/709/2011 A/chicken/Vietnam/SonLa(TP)/NCVD120187(A1410)/2012 A/crested goshawk/Hong Kong/4082/2012 A/duck/Vietnam/NgheAn(NamDan)/R3-560(A1491)/2012 A/duck/Vietnam/NinhBinh(YenMo)/NCVD120441(A1497)/2012 0.0050
A/duck/Vietnam/QuangNinh(HaiHa)/R2-bp1062(A1463)/2012 A/duck/Vietnam/NgheAn(YenThanh)/R3-549(A1489)/2012 Weekly epidemiological record, No. 42, 19 october 2012
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Figure 4 Phylogenetic relationships of influenza A(H5N1) clade 2.3.2.1 A/Hong Kong/6841/2010-like virus HA genes Figure 4 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H5N1) analogues au virus A/Hong Kong/6841/2010 et appartenant au clade 2.3.2.1 The A/Hong Kong/6841/2010 virus is indicated in bold. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Le virus A/Hong Kong/6841/2010 est indiqué en caractères gras. Les virus humains sont repérés (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site. A/duck/Laos/1020/2010 A/peregrine falcon/Aichi/2302O017/2011 A/mallard duck/Korea/W404/2011 A/peregrine falcon/Tochigi/15/2011 A/whooper swan/Hokkaido/4/2011 A/duck/Iran/11VIR5316-1/2011 A/baikal teal/Korea/Q34/2011 A/chicken/Korea/YS171/2011 A/herring gull/Mongolia/833T/2009 A/common buzzard/Bulgaria/38WB/2010 A/bar-headed goose/Mongolia/X53/2009 A/chicken/Nepal/111/2010 A/duck/Nepal/DTS24/2010 A/grebe/Tyva/2/2010 A/tundra swan/Mongolia/1T/2010 A/duck/Laos/471/2010 A/chicken/Tibet/1/2011 A/chicken/Bangladesh/15083/2012 A/Hong Kong/6841/2010# A/chicken/Liaoning/3/2012 A/peregrine falcon/Hong Kong/4538/2012 A/scaly-breasted Munia/Hong Kong/12795/2012 A/house crow/Hong Kong/5343/2012 A/crested myna/Hong Kong/8381/2012 A/duck/Vietnam/NinhBinh/NCVD120602/2012 A/duck/Vietnam/NamDinh/NCVD120599/2012 A/duck/Vietnam/HaTinh/R3-875/2012 0.0020
A/duck/Vietnam/ThanhHoa/R3-848/2012 A/chicken/Vietnam/BacKan/NCVD120617/2012
Clade 2.3.4.2 viruses were isolated from poultry in Myanmar. Genetically these viruses were similar to A/chicken/Bangladesh/11RS1984-30/2011, from which the development of a candidate vaccine virus has been proposed. A Clade 7.2 virus was isolated from poultry in China. No antigenic data for this virus are yet available.
Clade 2.3.4.2 Des virus de ce clade ont été isolés chez des volailles au Myanmar. Sur le plan génétique, ces virus étaient similaires au virus A/chicken/Bangladesh/11RS1984-30/2011, à partir duquel il a été proposé de mettre au point le virus vaccinal candidat. Clade 7.2 Un virus de ce clade a été isolé chez des volailles en Chine. Aucune donnée antigénique n’est encore disponible pour ce virus. Virus vaccinaux candidats pour préparer le vaccin contre la grippe A(H5N1) Sur la base des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques disponibles, un nouveau virus vaccinal candidat analogue au virus A/Indonesia/NIHRD11771/2011 du clade 2.1.3.2 a été proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H5N1) disponibles et proposés sont recensés dans le Tableau 3. D’après la propagation géographique, l’épidémiologie et les propriétés antigéniques et génétiques des virus A(H5N1) dans certains lieux, les autorités nationales peuvent envisager d’utiliser un ou plusieurs de ces virus vaccinaux candidats pour la production 407
Influenza A(H5N1) candidate vaccine viruses Based on the available antigenic, genetic and epidemiologic data, a new A/Indonesia/NIHRD11771/2011-like clade 2.1.3.2 candidate vaccine virus is proposed. The available and proposed candidate A(H5N1) vaccine viruses are listed in Table 3. On the basis of geographic spread, epidemiology and antigenic and genetic properties of the A(H5N1) viruses in particular locations, national authorities may consider the use of one or more of these candidate vaccine viruses for pilot lot vaccine releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 19 octobre 2012
Table 3 Status of development of influenza A(H5N1) candidate vaccine viruses, September 2012 Tableau 3 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H5N1), septembre 2012 Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Viet Nam/1203/2004(CDC-RG; SJRG-161052) A/Viet Nam/1194/2004(NIBRG-14) A/Cambodia/R0405050/2007(NIBRG-88) A/duck/Hunan/795/2002(SJRG-166614) A/Indonesia/5/2005(CDC-RG2) A/bar-headed goose/Qinghai/1A/2005(SJRG-163222) A/chicken/India/NIV33487/2006(IBCDC-RG7) A/whooper swan/Mongolia/244/2005(SJRG-163243) A/Egypt/2321-NAMRU3/2007(IDCDC-RG11) A/turkey/Turkey/1/2005(NIBRG-23) A/Egypt/N03072/2010(IDCDC-RG29) A/Egypt/3300-NAMRU3/2008(IDCDC-RG13) A/common magpie/Hong Kong/5052/2007(SJRG-166615) A/Hubei/1/2010(IDCDC-RG30) A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010(SJ-003) A/chicken/Hong Kong/AP156/2008(SJ-002) A/Anhui/1/2005(IBCDC-RG6) A/duck/Laos/3295/2006(CBER-RG1) A/Japanese white eye/Hong Kong/1038/2006(SJRG-164281) A/goose/Guiyang/337/2006(SJRG-165396) A/chicken/Viet Nam/NCVD-016/2008(IDCDC-RG12) A/chicken/Viet Nam/NCDV-03/2008(IDCDC-RG25A) Candidate vaccine viruses in preparation – Virus vaccinaux candidats en préparation A/chicken/Bangladesh/11RS1984-30/2011-like A/Indonesia/NIHRD11771/2011-like a
Clade 1 1 1.1 2.1 2.1.3.2 2.2 2.2 2.2 2.2.1 2.2.1 2.2.1 2.2.1.1 2.3.2.1 2.3.2.1 2.3.2.1 2.3.4 2.3.4 2.3.4 2.3.4 4 7.1 7.1 Clade 2.3.4.2 2.1.3.2
Institutiona CDC and SJCRH NIBSC NIBSC SJCRH CDC SJCRH CDC/NIV SJCRH CDC NIBSC CDC CDC SJCRH CDC SJCRH SJCRH CDC FDA SJCRH SJCRH CDC CDC Institution CDC NIID
Available – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Availability – Disponibilité Pending – En attente Pending – En attente
Institutions distributing the candidate vaccine viruses. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats.
CDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States; CDC/NIV, Centers for Disease Control and Prevention, United States/National Institute of Virology, India; FDA, Food and Drug Administration, United States; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, England; NIID- National Institute of Infectious Diseases, Japan; SJCRH, St Jude Children’s Research Hospital, United States.– CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis: CDC/NIC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis en collaboration avec le National Institute of Virology, Inde: FDA, Food and Drug Administration, États-Unis: NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, Angleterre: SJCRH, St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis: NIID, Institut national des Maladies infectieuses, Japon.
production, for clinical trials and other pandemic preparedness purposes. As the viruses continue to evolve, new A(H5N1) candidate vaccine viruses will be developed and announced as they become available. Institutions that wish to receive these candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2
de lots pilotes de vaccin, les essais cliniques et d’autres activités relevant de la préparation à une pandémie. Les virus continuant d’évoluer, de nouveaux virus vaccinaux candidats A(H5N1) seront mis au point et annoncés à mesure qu’ils deviennent disponibles. Les institutions souhaitant recevoir ces virus vaccinaux candidats devront contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
(2) Influenza A(H9N2) Influenza A(H9N2) viruses are enzootic in poultry populations in parts of Asia and the Middle East. The majority of viruses that have been sequenced belong either to the G1 clade or the chicken/Beijing (Y280/G9) clade. Since 2
2) Grippe A(H9N2) Les virus grippaux A(H9N2) sont enzootiques parmi les populations de volailles de certaines parties de l’Asie et du MoyenOrient. La majorité des virus qui ont été séquencés appartiennent au clade G1 ou au clade chicken/Beijing (Y280/G9). Depuis 1998, 2
Candidate vaccine viruses and potency testing reagents for influenza A(H5N1). Available at http://www.who.int/influenza/vaccines/virus October 2012.
Candidate vaccine viruses and potency testing reagents for influenza A(H5N1). Document disponible à l’adresse: http://www.who.int/influenza/vaccines/virus, consulté en octobre 2012. Weekly epidemiological record, No. 42, 19 october 2012
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1998, when the first human infection was detected, the isolation of A(H9N2) viruses from humans and swine has been reported infrequently. In all human cases the associated disease symptoms have been mild and there has been no evidence of human-to-human transmission. Influenza A(H9N2) activity: 23 February–18 September 2012 No human cases of A(H9N2) infections have been reported in the period. A(H9N2) viruses continue to be isolated from birds in many regions of the world. Influenza A(H9N2) candidate vaccine viruses Based on the current antigenic, genetic and epidemiological data, no new A(H9N2) candidate vaccine viruses are proposed. The available A(H9N2) candidate vaccine viruses are listed in Table 4. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrs-whohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2
année au cours de laquelle on a détecté le premier cas d’infection humaine, l’isolement des virus A(H9N2) chez l’homme ou chez le porc a été peu souvent notifié. Dans tous les cas connus chez l’homme, les symptômes associés ont été bénins et aucune transmission interhumaine n’a été mise en évidence. Activité de la grippe A(H9N2): 23 février-18 septembre 2012 On n’a enregistré aucun cas d’infection humaine par le virus A(H9N2) au cours de cette période. Des virus A(H9N2) continuent d’être isolés chez des oiseaux dans de nombreuses régions du monde. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H9N2) Compte tenu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H9N2) n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H9N2) disponibles sont recensés dans le Tableau 4. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats doivent contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
(3) Influenza A(H3N2) variant (v)3 Influenza A(H3N2) viruses are endemic in swine populations in many regions of the world. Depending on geographic location, the genetic and antigenic characteristics of these viruses differ. Human infections with swine A(H3N2) viruses have been documented in Asia, Europe and North America.4 Influenza A(H3N2)v activity: 23 February–18 September 2012 In multiple states of the United States, 305 human infections of A(H3N2)v have been detected since July 2012. Limited human-to-human transmission has been detected. Characteristics of A(H3N2)v viruses Genetically, the A(H3N2)v viruses were similar to viruses that circulate in swine in the United States and also to the
3) Grippe A(H3N2) variant (v)3 Les virus grippaux A(H3N2) sont endémiques parmi les populations porcines de nombreuses régions du monde. Les caractéristiques génétiques et antigéniques de ces virus diffèrent selon le lieu géographique. Des infections humaines par des virus porcins A(H3N2) ont été attestées en Asie, en Europe et en Amérique du Nord.4 Activité de la grippe A(H3N2)v: 23 février-18 septembre 2012 Aux États-Unis, 305 cas d’infection humaine par des virus A(H3N2) ont été détectés dans plusieurs États depuis le mois de juillet 2012. Une transmission interhumaine limitée a été décelée. Caractéristiques des virus A(H3N2)v Sur le plan génétique, les virus A(H3N2)v étaient similaires à ceux circulant chez les porcs aux États-Unis et également au virus
Table 4 Status of development of influenza A(H9N2) candidate vaccine viruses, September 2012 Tableau 4 État d’avancement de la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H9N2), septembre 2012 Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Hong Kong/1073/1999 A/chicken/Hong Kong/G9/1997(NIBRG-91) A/chicken/Hong Kong/G9/1997(IBCDC-2) A/Hong Kong/33982/2009(IDCDC-RG26) A/Bangladesh/0994/2011(IDCDC-RG31) a
Type Wild type – Type sauvage Reverse genetics – Génétique inverse Conventional reassortant – Réassorti classique Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse
Clade G1 Y280/G9 Y280/G9 G1 G1
Institutiona NIBSC NIBSC CDC CDC CDC
Available – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui
Institutions distributing the candidate vaccine viruses. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats.
CDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, England.– CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis: NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, Angleterre.
Standardization of terminology for the variant A(H3N2) virus recently infecting humans. Available at http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ ah3n2v/en/, accessed October 2012. 4 Myers KP et al. Cases of Swine Influenza in Humans: A Review of the Literature. Clinical Infectious Diseases, 2007, 44:1084. 3
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Standardization of terminology for the variant A(H3N2) virus recently infecting humans. Disponible à l’adresse: http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ah3n2v/en/, consulté en octobre 2012. Myers KP et al. Cases of Swine Influenza in Humans: A Review of the Literature. Clinical Infectious Diseases, 2007, 44:1084. 409
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previously reported A(H3N2)v virus.5 These viruses reacted well with post-infection ferret antisera raised against A/Minnesota/11/2010 and A/Indiana/10/2011 viruses, from which candidate vaccine viruses (NYMC X-203 and NYMC X-213, respectively) have been prepared. The A(H3N2)v viruses tested so far were susceptible to neuraminidase inhibitors and resistant to the adamantanes. Influenza A(H3N2)v candidate vaccine viruses Based on the current antigenic, genetic and epidemiologic data, no new A(H3N2)v candidate vaccine viruses are proposed. Available candidate vaccine viruses are shown in Table 5. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrswhohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2
A(H3N2)v précédemment notifié.5 Ces virus ont bien réagi en présence d’immunsérum de furet postinfection obtenus après inoculation des virus A/Minnesota/11/2010 et A/Indiana/10/2011, à partir desquels des virus vaccinaux candidats (NYMC X-203 et NYMC X-213, respectivement) ont été préparés. Les virus A(H3N2)v testés jusqu’à présent étaient sensibles aux inhibiteurs de la neuraminidase et résistants aux adamantanes. Virus vaccinaux candidats pour préparer un vaccin contre la grippe A(H3N2)v Compte tenu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H3N2)v n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats disponibles sont présentés dans le Tableau 5. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats doivent contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
(4) Influenza A(H1N1)v and A(H1N2)v Influenza A(H1N1) and A(H1N2) viruses circulate in swine populations in many regions of the world. Depending on geographic location, the genetic and antigenic characteristics of these viruses differ. Human infections with swine A(H1) viruses have been documented for many years.6 Influenza A(H1N1)v and A(H1N2)v activity: 23 February–18 September 2012 Human infections with A(H1N1)v (1 case) and A(H1N2)v (3 cases) viruses have been detected in the United States in the reporting period. Characteristics of influenza A(H1N1)v and A(H1N2)v viruses The A(H1N1)v virus, which is similar to viruses that circulate in swine in the United States, contains an HA gene genetically and antigenically related to the A(H1N1) pdm09 viruses. The A(H1N2)v viruses are also similar to viruses known to circulate in swine in the United States and have HA genes similar to A(H1N1) viruses that circulated in humans until 2007. The A(H1N1)v and A(H1N2) v viruses were susceptible to oseltamivir and zanamivir and resistant to the adamantanes. Influenza A(H1N1)v and A(H1N2)v candidate vaccine viruses Based on the risk assessment of the antigenic and genetic characteristics of the A(H1N1)v and A(H1N2)v viruses, candidate vaccine viruses are not proposed at this time.
4) Grippes A(H1N1)v et A(H1N2)v Des virus grippaux A(H1N1) et A(H1N2) circulent parmi les populations porcines de nombreuses régions du monde. Les caractéristiques génétiques et antigéniques de ces virus diffèrent selon le lieu géographique. Des infections humaines par des virus porcins A(H1) sont enregistrées depuis de nombreuses années.6 Activité des grippes A(H1N1)v et A(H1N2)v: 23 février-18 septembre 2012 Des cas d’infection humaine par le virus A(H1N1)v (1 cas) et par le virus A(H1N2)v (3 cas) ont été détectés aux États-Unis pendant la période couverte par le rapport. Caractéristiques des virus grippaux A(H1N1)v et A(H1N2)v Le virus A(H1N1)v, qui est similaire aux virus circulant chez les porcs aux États-Unis, contient un gène de l’hémagglutinine qui le relie sur le plan génétique et antigénique aux virus A(H1N1) pdm09. Les virus A(H1N2)v sont également similaires à des virus dont on sait qu’ils circulent parmi les populations porcines aux États-Unis et présentent des gènes HA similaires à ceux des virus A(H1N1) ayant circulé chez l’homme jusqu’en 2007. Les virus A(H1N1)v et A(H1N2)v étaient sensibles à l’oseltamivir et au zanamivir et résistants aux adamantanes. Virus vaccinaux candidats A(H1N1)v et A(H1N2)v D’après l’évaluation des risques liés aux caractéristiques antigéniques et génétiques des virus A(H1N1)v et A(H1N2)v, il n’est pas proposé de virus vaccinal candidat actuellement.
Table 5 Status of development of A(H3N2)v candidate vaccine viruses, September 2012 Tableau 5 État d’avancement de la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H3N2)v, septembre 2012 Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/Minnesota/11/2010(NYMC X-203) A/Indiana/10/2011(NYMC X-213) a
Type Conventional reassortant – Réassorti classique Conventional reassortant – Réassorti classique
Institutiona CDC CDC
Available – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui
Institutions distributing the candidate vaccine viruses. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats.
Centers for Disease Control and Prevention, United States. – CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis.
5 6
See No. 10, 2012, pp. 83–95.
5 6
Voir No 10, 2012, pp. 83-95. Shu B et al. Genetic analysis and antigenic characterization of swine origin influenza viruses isolated from humans in the United States, 1990-2010. Virology, 2012, 422:151. Weekly epidemiological record, No. 42, 19 october 2012
Shu B et al. Genetic analysis and antigenic characterization of swine origin influenza viruses isolated from humans in the United States, 1990–2010. Virology, 2012, 422:151.
410
(5) Influenza A(H7N3) Influenza A(H7) viruses cause sporadic outbreaks in poultry populations worldwide. Occasionally, during outbreaks in poultry, human cases are documented in those with direct poultry exposure. These infections often cause conjunctivitis with occasional respiratory disease.7, 8 Influenza A(H7N3) activity: 23 February–18 September 2012 Two human cases of conjunctivitis due to A(H7N3) viruses were reported by Mexico during the period. Both individuals were occupationally exposed to poultry associated with the ongoing highly pathogenic A(H7N3) outbreak in birds in the region. Fever and respiratory illness were absent in both cases. Characteristics of influenza A(H7N3) viruses A(H7N3) viruses isolated from infected poultry and humans in Mexico were genetically closely related (Figure 5). These viruses reacted well with post-infection ferret antiserum raised against A/Canada/RV444/2004, a virus from which a candidate vaccine virus has been developed (Table 6). The one human virus tested for susceptibility to antiviral drugs was sensitive to oseltamivir, zanamivir and the adamantanes. Influenza A(H7) candidate vaccine viruses Based on the current antigenic, genetic and epidemiologic data, no new A(H7) candidate vaccine viruses are proposed. Available A(H7) ca ndidate vaccine viruses are shown in Table 7. Institutions that wish to receive candidate vaccine viruses should contact WHO at gisrswhohq@who.int or the institutions listed in announcements published on the WHO website.2 Table 6 Antigenic properties of influenza A(H7) viruses Tableau 6 Propriétés antigéniques des virus A(H7)
5) Grippe A(H7N3) Les virus grippaux A(H7) sont responsables de flambées sporadiques parmi les populations de volailles dans le monde entier. Occasionnellement, pendant les flambées touchant les volailles, des cas humains sont enregistrés chez des personnes exposées directement à ces oiseaux. Ces infections sont souvent à l’origine de conjonctivites et occasionnellement de maladies respiratoires.7, 8 Activité de la grippe A(H7N3): 23 février-18 septembre 2012 Deux cas humains de conjonctivites imputables à des virus A(H7N3) ont été notifiés par le Mexique sur la même période. Les 2 individus concernés avaient subi une exposition professionnelle à des volailles en association avec la flambée de virus A(H7N3) hautement pathogène en cours chez les oiseaux dans cette région. Aucun des 2 cas ne présentait de fièvre ou de maladie respiratoire. Caractéristiques des virus grippaux A(H7N3) Les virus A(H7N3) isolés chez des volailles et des êtres humains infectés au Mexique étaient étroitement apparentés sur le plan génétique (Figure 5). Ces virus ont bien réagi en présence d’antisérum de furet postinfection obtenu après inoculation du virus A/Canada/RV444/2004, à partir duquel un virus vaccinal candidat a été mis au point (Tableau 6). Le seul virus humain testé pour déterminer sa sensibilité aux antiviraux s’est révélé sensible à l’oseltamivir, au zanamivir et aux adamantanes. Virus vaccinaux candidats pour la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H7) Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques, aucun nouveau virus vaccinal candidat A(H7) n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H7) disponibles sont présentés dans le Tableau 7. Les institutions souhaitant recevoir des virus vaccinaux candidats doivent contacter l’OMS à l’adresse suivante: gisrs-whohq@who.int, ou les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2
Reference ferret antiserum – Immunsérum de furet de référence Reference antigens – Antigènes de référence A/New York/107/2003 A/Canada/RV444/2004 A/Canada/RV504/2004 A/chicken/Arkansas/10/2008 Test antigens – Antigènes d’épreuve A/turkey/Virginia/4529/2002 A/goose/Nebraska/17097-4/2011 A/Mexico/InDRE7218/2012 H7N2 H7N9 H7N3 1280 80 80 160 160 160 320 320 320 160 10 10 Subtype – Sous-type H7N2 H7N3 H7N3 H7N3 NY/107 1280 80 80 80 CN/RV444 160 80 160 80 CN/RV504 320 160 320 320 ck/AR/10 10 10 10 80
Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent des titres homologues d’antisérum en présence d’antigènes. Tweed SA et al. Human illness from avian influenza H7N3, British Columbia. Emerging Infectious Diseases, 2004, 10:2196. de Jong MC et al. Intra- and interspecies transmission of H7N7 highly pathogenic avian influenza virus during the avian influenza epidemic in the Netherlands in 2003. Revue scientifique et technique de l’Office international des épizooties (OIE), 2009, 28 (1):333–340. Tweed SA et al. Human illness from avian influenza H7N3, British Columbia. Emerging Infectious Diseases, 2004, 10:2196. de Jong, MC et al. Intra- and interspecies transmission of H7N7 highly pathogenic avian influenza virus during the avian influenza epidemic in the Netherlands in 2003. Revue scientifique et technique de l’Office international des Épizooties (OIE), 2009, 28 (1):333-340. 411
7
7
8
8
releve epidemiologique hebdomadaire, No 42, 19 octobre 2012
Figure 5 Phylogenetic relationships of influenza A(H7) virus HA genes Figure 5 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine (HA) des virus grippaux A(H7) Viruses underlined are included in the antigenic analysis as presented in Table 6. The available A(H7N3) candidate vaccine virus is represented in bold. Human viruses are indicated (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. – Les virus dont le nom est souligné figurent dans l’analyse antigénique présentée dans le Tableau 6. Le virus vaccinal candidat disponible est indiqué en caractères gras. Les virus humains sont repérés (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site.
0.0090
A/chicken/Jalisco/CPA1/2012 A/Mexico/InDRE7218/2012# A/goose/Nebraska/11-017097-4/2011 A/guinea fowl/Nebraska/11-017096-1/2011 A/Turkey/MN/014135-4/2009 A/mallard/Missouri/220/2009 A/mallard/Wisconsin/4236/2009 A/mallard/California/1390/2010 A/chicken/Arkansas/10/2008 A/environment/California/7451/2010 A/green-winged teal/California/1841/2009 A/mallard/Alaska/44430-052/2008 A/environment/Indiana/08OS2885/2008 A/chicken/SK/HR-00011/2007 A/northern shoveler/California/28327/2007 A/environment/Maryland/1637/2006 A/ruddy turnstone/Delaware Bay/285/2006 A/mallard/Alaska/44187-130/2006 A/blue-winged teal/Ohio/658/2004 A/chicken/British Columbia/04/2004 A/Canada/rv504/2004# A/Canada/rv444/2004# A/laughing gull/Delaware/22/2002 A/chicken/Jalisco/1994 A/turkey/New York/23165-8/2005 A/TurkeyVirginia/4529/02 A/New York/107/2003# A/chicken/New York/31621-6/2005 A/environment/New York/641/2005 A/turkey/Oregon/1971
Table 7 Status of development of influenza A(H7) candidate vaccine viruses (September 2012) Tableau 7 État d’avancement de la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H7) (septembre 2012) Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats A/turkey/Virginia/4529/2002(H7N2)IBCDC-5 A/mallard/Netherlands/12/2000(H7N7)IBCDC-1 A/mallard/Netherlands/12/2000(H7N3)NIBRG-60 A/mallard/Netherlands/12/200(H7N1)NIBRG-63 A/Canada/RV444/2004(H7N3) A/New York/107/2003(H7N2)NIBRG-109 a
Type Conventional reassortant – Réassorti classique Conventional reassortant – Réassorti classique Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse Reverse genetics – Génétique inverse
Institutiona CDC CDC NIBSC NIBSC SJCRH NIBSC
Availability – Disponibilité Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui Yes – Oui
Institutions distributing the candidate vaccine viruses. – Institutions distribuant les virus vaccins candidats.
CDC, Centers for Disease Control and Prevention, United States; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, England; SJCRH, St Jude Children’s Research Hospital, United States .– CDC, Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis; NIBSC, National Institute for Biological Standards and Control, Health Protection Agency, Angleterre; SJCRH, St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis. 412 Weekly epidemiological record, No. 42, 19 october 2012