SALMONELLA PHAGE TYPES AND DRUG RESISTANCE IN 19751 Salmonella typhi (a) Phage Typing Table 1 shows the phage typing of the cultures sent for special examination by 17 countries. ‘ See No. 6, pp. 48-50.
LYSOTYPES ET PHARMACORÉSISTANCE DES SALMONELLA EN 19751 Salmonella typhi a) Lysotypie Le Tableau 1 donne les lysotypes des cultures envoyées pour examen spécial par 17 pays. 1 Voir N» 6, pp. 48-50.
Table 1. Phage Types of S . typhi Strains Examined in WHO Collaborating Centre for Phage Typing and Resistance of Enterobacteria, 1975 Tableau 1. Lysotypes des souches de S . typhi examinés au Centre collaborateur OMS pour la lysotypie et l’étude de la résistance des entérobactéries, 1975 Country — Pays Phage Typos (Number of Cultures Shown in Parenthesis) Lysotypes Ge nombre de cultures est indiqué entre parenthèses) Total
Algeria — A lg é rie ................................... Canada ...................................................... Chile — C h i l i ........................................... Ethiopia — E th io p ie ................................ Germany, Federal Republic o f ................ Allemagne, République fédérale d ’ India — I n d e ........................................... Indonesia — In d o n é sie ........................... Ireland — I r l a n d e ................................... Israel — Israël ............................................. Malaysia — Malaisie ............................... Mexico — Mexique ........................................ Socialist Republic of Viêt-Nam .................. République socialiste du Viêt-Nam Somalia — S o m a l i e .................................... Sudan — Soudan ............................................. Sweden — S u è d e ........................................ Trinidad — T rin ité ........................................ Yugoslavia — Y o u g o sla v ie .......................
A (5), B2 (1), C l (1), D I (3), E l (4), N (6), 42 (3), 46 (6), D l-N (2), DYS (2), DVS3 (7), DVS4 (3), DVS6 (2), DVS12 (6) D V S (l), DVS4 (2) 46 G1 A C5 (4), D l-N (1) 53 El DVS13 (6), 42 (5) A (1), B1 (4), C4 (2), D I (5), D2 (1), E l (2), E2 (2), J1 (2), L1 (1), M l (1), M2 (1), N (1), 25 (1), UVS (1) E l (1), DVS (2), DVS2 (5) 56 (5), D6 (2), E10 (2), M l (2), UVS (1), UVS1 (3), UVS2 (1) 0 (1), UYS1 (1) G1 53 (1), DVS (1), DVS12 (1) DVS14 (3) Variants of type Cl (12) — Variants du type C l (12)
51 3 3 1 32 5 14 3 11 26 8
16 2 1 3 3 12
194
Epidemiological notes contained in this number:
Informations épidémiologiques contenues dans ce numéro:
Influenza, Salmonella Phage Types and Drug Resistance, Smallpox, Suspected Viral Haemorrhagic Fever. List of Infected Areas, p. 323.
Grippe, lysotype et pharmacorésistance des salmonella, pous sées soupçonnées de fièvre hémorragique virale, variole. Liste des zones infectées, p. 323.
Wkly Epidem. Sec.: No. 41 - 8 Oct. 1976
- 318 -
Relevé épldénu hebd.: N* 41 - 8 oct. 1976
The cultures of Vi-type A from the Federal Republic of Germany were isolated in an outbreak in Baden-Württemberg: 411 cases, five fatal, occurred. Potato salad was the suspected vehicle of infection. (b) Drug Resistance Resistance studies on S. typhi are summarized in Table 2,
Les cultures du type Vi A reçues de la République fédérale d ’Alle magne ont été isolées lors d ’une épidémie qui s’est produite dans le Bade-Wurttemberg (411 cas, dont cinq décès). Q semble que le véhicule de l ’infection ait été une salade de pommes de terre. b) Pharmacorésistance Les études de résistance sur S. typhi sont résumées au Tableau 2.
Table 2. Drug Resistance in S. typhi Examined in WHO Collaborating Centre for Phage Typing and Resistance of Enterobacteria, 1975 Tableau 2. Pharmacorésistance de S. typhi examinees au Centre collaborateur OMS pour la lysotypie et l’étude de la résistance des entérobactéries, 1975 Total Number of Cultures Nombre total de cultures Drug-Resistant Strains Total Number of Resistant Souches pharmacoPhage Types Vi-Phage Types * résistantes Lysotypes Vi Nombre résistants ♦ total de No. lysotypes % Nombre 0 0 3 0 0 5 14 0 0 0 4 2 6 0 0 0 0 0 14 2 1 1 1 2 1 1 1 15 3 Total Number of R-Types R-Types Identified** Nombre Spectres de total de spectres de pharmacorésistance identifiés ** pharmacorésistance 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0
Country Pays
Algeria — Algérie ........................... Canada ............................................... Chile — C h i l i ................................... Ethiopia — E t h i o p i e ........................ Germany, Federal Republic of . . . Allemagne, République fédérale d ’ India — Inde ................................... Indonesia — I n d o n é s ie .................... Ireland — Irlande ........................... Israel — I s r a ë l ................................... Malaysia — M a la is ie ........................ Mexico — Mexique ........................ Socialist Republic of Viet-Nam . . République socialiste du Viet-Nam Direct ........................................... *** Somalia — S o m alie........................... Sudan — Soudan ........................... Sweden — S u è d e ............................... Trinidad — T r i n i t é ........................... Yugoslavia — Yougoslavie................
51 3 3 1 32 5 14 3 11 26 8 3 13 2 1 3 3 12
. 100
—
46
CSSuT — — CSSuT CSSuT — —
100 100 , 50 67 46
C5 (4), D l-N 53
DVS2
— CSSuT
2 6 2 1 3 1 1
56, M l 56(4),D 6(1), UYS2 (1)
CSSuT CSSuT
— —
— —
194
34
17.5 • Le nombre de cultures résistantes est indiqué entre parenthèses pour les lysotypes résistants prédominants. " Spectre de pharmacorésistance: C = Chloramphenicol, S = streptomycine, Su —sulphamides, T —tétracyclines. *** Reçu de Baltimore, Etats-Unis d’Amérique. DVS —Souches Vi dégénérées présentant des réactions croisées caractéristiques avec les phages de lysotypie Vi. UVS —Souches Vi non typables, résistantes aux phages de lysotypie Vi C ™ ai< présentant une réaction caractéristique aux phages Vi non appropriés.
* Number of resistant cultures is shown in parenthesis for predominant resistant phage types. ** R-type = spectrum of drug resistance: C —chloramphenicol, S = strepto mycin, Su —sulphonamides, T —tetracyclines. *** Sent from Baltimore, USA. DVS = Degraded Vi-strains showing characteristic cross reactions with Vi-typing phages. UVS = Untypable Vi-strains, resistant to Vi n typing phages but reacting char acteristically with unadapted Vi-phages.
Chloramphenicol-resistant cultures of S. typhi were predominantly from South-East Asia: five from India, 14 from Indonesia and eight from the Socialist Republic of Viet-Nam. Most of the phage types involved had been encountered previously.1 However, four of the five resistant cultures from India belonged to phage type C5, which had not previously been observed to be resistant. The four re sistant strains from Mexico were indistinguishable from those isolated during the large outbreak in 1972-1973. Three resistant cultures from Chile belonged to type 46. All these resistant cultures belonged to the same R-type, CSSuT (see Table 2), and all the R factors involved belonged to group Hj. In this respect the type 46 cultures from Chile present the first recorded appearance o f the H i group of R factors in S . typhi in that country. S. paratyphi B Of eight cultures received from Ireland for special examination, one, of phage type Dundee, was resistant to ampicillin, streptomycin and sulphonamides.
Les cultures de S . typhi résistantes au chloramphénicol venaient surtout de l’Asie du Sud-Est: cinq de l’Inde, 14 d ’Indonésie et huit de la République socialiste du Viet-Nam. La plupart des lysotypes avaient déjà été observés précédemment.1 Toutefois, quatre des cinq cultures résistantes provenant de l’Inde appartenaient au lysotype C5 qui n ’était pas apparu résistant jusqu’alors. Les quatre souches résistantes reçues du Mexique ne se distinguaient pas de celles isolées pendant la grande épidémie de 1972-1973. Trois cultures résistantes venant du Chili appartenaient au lysotype 46. Toutes ces cultures résistantes possédaient le même spectre de résistance, soit CSSuT (voir Tableau 2) et tous les facteurs R appar tenaient au groupe H^ A cet égard, les cultures du lysotype 46 venant du Chili représentaient la première apparition enregistrée des facteurs R du groupe Hj chez S. typhi dans ce pays. S. paratyphi B Sur huit cultures reçues d ’Irlande en vue d ’un examen spécial, une, du lysotype Dundee, était résistante à l’ampicilline, à la strepto mycine et aux sulfamides. * Voir N» 6, pp. 48-50.
1See No. 6, pp. 48-50.
Wkiy Epldem. Bec.: No. 4 1 -8 Oct. 1976
- 319 -
B deti épidém. hcbd.: N° 41 - 8 oct 1976
S . typhimurium Thirty-eight resistant phage types were identified in the 1117 cultures received from 16 countries for special examination. Re sistance studies were also carried out and are summarized in Table 3.
S. typhimurium Trente-huit lysotypes résistants ont été identifiés dans les 1117 cultures reçues de 16 pays pour examen spécial. Des études de résis tance ont été faites également et elles sont résumées au Tableau 3.
Table 3. Drug Resistance in S . typhimurium Strains Examined in WHO Collaborating Centre for Phage Typing and Resistance of Enterobacteria, 1975 Tableau 3. Pharmacoresistance des souches S . typhimurium examinées au Centre collaborateur OMS pour la lysotypie et l’étude de la résistance des entérobactéries, 1975 Total Number of Cultures total de cultures Drug-Resistant Cultures pharmacorésistantes No. Nombre % Total Number of Phage TVpes total de lysotypes Total Number of R-Types Nombre total dc spectres de résistance
Country Pays
Resistant Phage Types * Lysotypes résistants *
Predominant R-Types ** Spectres de résistance prédominants **
Belgium — Belgique . .
237
178
75.1
20
Brazil — Brésil................
242
124
51.2
23
145, 146, 193,194 (62), 195, 200, 203, 207 (77), 208, Untypable — Non typable 4, 19, 22, 141, 157, 178, 193 (86), U274
11
ACKSSuT (88), T (74) ACSSuT (5), ST (4) ACKSSuT (41), ACKSSuFuNx (18), S (6), T (5), ACKSSu (5), ACKSSuTFuNx (5), ASSu (5) ASSuT (31), SSuT (7), ST (7), ACSSuT (6)
27
Canada E d m o n t o n ................
215
78
36.3
27
O tta w a ....................... Chile — C h i l i ................ Germany, Federal Rep. of Allemagne, Rep. fédérale d ’ India — I n d e ................ I r a n ...............................
13 2 110 4 142
11 2 68 62.4
5 2 5 3 13
2,10,12,203,49,92, 94,143,145,181,193 (30), Untypable — Non typable 123, 145, 178 12, Untypable — Non typable 193, 194 (50), 195, 200, Untypable — N on typable __ 2, 24, 170, 208 (91), Untypable — Non typable (21) ***, N C **** 44,123,135,193,203 3aer,6,24,41,93 (12), 135, 193, 208 (26)
14
5 2 10 0 25
ACKSSuT (3), ACSSuT (3), CKST (2), AST (2) ACKSSuT (1), ACKSSuTFu (1) T (53), ACKSSuT (4), S (3), ACSSuT (2) — ACKSSuTFu (52), ACKSSuT (30) Su (3), A (2) ACKSSuT (17), ACKSSuTFu (12), ACKSSuTTmFu (8), ACKSSuTGFu (2) ACSSuT (2), AST (1) — SSu (3), SSuT (2) — — — ACSSuT (1), SSu (1)
0 127
89.4
Ireland — Irlande . . . Israel — Israel................
44 57
11 55
25.0 96.5
9 8
8 9
K e n y a ........................... M alta — Malte . . . . New Z e a la n d ................ Nouvelle-Zélande Sudan — Soudan. . . . Trinidad — Trinité . . . U S A ............................... Etats-Unis d ’Amérique Zambia — Zambie . .
5 1 20 1 7 6 11
3 0 7 0 0 0 2
35.0
3 1 11 1 3 2 5
2,135 — 1, 6,42,193 — — _ 41,95
2 0 4 0 0 0 2
m •
1117
667
59.7
—
—
—
—
* Number of resistant cultures is shown in parenthesis for predominant resis tant phage types. M R-type = spectrum of drug resistance: A = ampicillin, C —chloramphenicol» K —neomycin-kanamydn, S = streptomycin, Su = sulphonamideis, T — tetracyclines, Tm = trimethoprim, G = gentamicin, Fu = furazolidone, Nx nalidixic acid. *** Untypable, but closely related to type 208. •*** NC = cultures react with S. typhimurium typing phages of the WHO Collaborating Centre but do not conform to recognized patterns.
* Le nombre de cultures résistantes est indiqué entre parenthèses pour les lysotypes résistants prédominants. ** Spectre de phar^ ^ rési^tar™- A ** ampicilline, C *= chloramphémcol, K = néomyeme-kanamyeme, S = streptomycine, Su - sulfamides, T « tétracyclines, Tm = tnmétboprime, G » gentamîcme, Fu » furazolidone, Nx » acide natidixique. *•* Non typable, mais étroitement apparenté au type 208. **** NC « ces cultures réagissent aux phages du Centre collaborateur OMS qui typent S. typhimurium, mais ne sont pas conformes aux types reconnus.
WklyEpidem. gee.: No. 41 - 8 Oct. 1976
— 320 —
Relevé épldém. hcbtL: N° 41.8 ott. 1976
Of the 1117 cultures, 667 (59.7 %) were drug-resistant. Most of the groups of cultures received showed a substantial degree of drug resistance, but small numbers from India (4), Sudan (1), Trinidad (7) and the United States of America (6) were drug-sensitive.
Sur les 1117 cultures, 667 (59,7%) étaient pharmacorésistantes. La plupart des groupes de cultures reçues présentaient un degré important de pharmacorésistance, mais de petits nombres de cul tures provenant de l’Inde (4), du Soudan (1), de la Trinité (7) et des Etats-Unis d ’Amérique (6) étaient sensibles aux médicaments. A specially interesting group of resistant cultures came from the Un groupe particulièrement intéressant de cultures résistantes Middle East, particularly from Iran and Israel, and it is clear that the venait du Moyen-Orient, notamment d ’Iran et d ’Israël, et il est R factors concerned, which all code for multiple resistance, belong clair que les facteurs R en cause, qui tous codaient une résistance to a single type. Indeed there is evidence to suggest that only one multiple, appartenaient à un seul type. En fait les résultats donnent or very few resistant strains of S. typhimurium have become widely à penser qu’une seule, ou très peu, des souches résistantes de S. typhimurium se sont largement propagées au Moyen-Orient et distributed in the Middle East, and possibly North Africa. Many peut-être en Afrique du Nord. Beaucoup de cultures ne transfèrent cultures do not transfer their resistances, which are nevertheless pas leurs résistances, qui sont néanmoins à médiation plasmidique plasmid-determined and mobilisable. et mobilisables. Il y avait de nouveau de nombreuses souches résistante venant Resistant strains from Belgium again figured largely, the phage types concerned being type 194 of human (40) and porcine origin de Belgique, les lysotypes étant le type 194 d ’origine humaine MO) et (17), and type 207, mainly from cattle (56), but also from man (6) d ’origine porciDe (17) et le type 207 provenant principalement de bovins (56), mais également de l’homme (6) et de porcins (5). Le type and pigs (5). Type 194 was generally resistant only to tetracyclines, 194 n ’était généralement résistant qu’aux tétracyclines, mais toutes but all type 207 cultures were multirésistant, the predominant pattern les cultures du type 207 étaient pluri-résistantes, le spectre de résis being ACKSSuT (63). Type 207 is known to be mainly o f bovine tance prédominant étant ACKSSuT (63). Le type 207 est connu origin. All resistances were transferable in types 194 and 207. comme étant le plus souvent d ’origine bovine. Pour les types 194 et 207, toutes les résistances étaient transférables. Le Brésil a envoyé 242 cultures, dont 124 (51,2 %) étaient pharmacoBrazil contributed 242 cultures, of which 124 (51.2%) were drugrésistantes. Cent quarante cultures (57,9%) étaient d ’origine resistant. One hundred and forty cultures (51.9 %) were o f human humaine, 75 (31 %) étaient d ’origine animale et 27 avaient été faites origin, 75 (31 %) were of animal origin, and 27 cultures were isolated à partir d ’eaux usées. Les 86 cultures du type 193 étaient toutes from sewage. All of 86 type 193 cultures were drug-resistant and pharmacorésistantes et, dans la plupart des cas, les résistances most of the resistances were transferable. The human phage types étaient transférables. Les lysotypes humains différaient généralement were generally different from those identified in animals. The de ceux identifiés chez l’animal, celui qui prédominait étant le type predominant human type was 193 (64), which was rare in animals. 193 (64), qui était rare par contre chez les animaux. Ce type présente This type carries a distinctive variety of transfer system, of which the une variété particulière de système de transfert, son facteur de trans transfer factor is classified as fi+ N. fert étant classé)?+ N. Deux cent vingt-huit souches venaient du Canada, principalement Two hundred and twenty-eight strains were received from d ’Edmonton, dans la province d ’Alberta (215). L ’analyse des souches Canada, mainly from Edmonton, Alberta (215). Analysis of the de l’Alberta est la suivante: 122 (56,7 %) étaient d ’origine humaine, Alberta strains was as follows: 122 (56.7%) were of human origin, tandis que 93 (43%) provenaient d’animaux et surtout de poulets. while 93 (43%) were from animals, mainly chicken. There was a La distribution des lysotypes est large; certains ont été trouvés aussi wide spread of phage types, some of which were found in both human and animal strains. Of the human cultures, 59 (48.4 %) were bien dans les souches humaines que dans les souches animales. drug-resistant. Nineteen of the 93 animal cultures (20.4%) were Parmi les cultures d ’origine humaine, 59 (48,4%) étaient pharmacorésistantes. Dix-neuf des 93 cultures d ’origine animale (20,4%) drug-resistant. Multiple transferable resistance was the rule. étaient pharmacorésistantes. La résistance multiple transférable était la règle. Sur les cinq souches d’origine humaine venant du Kenya, trois Of five strains of human origin from Kenya, three were drugétaient pharmacorésistantes. Deux, appartenant au lysotype 135, resistant. Two, belonging to phage type 135, showed the R-type ACSSuT, the third resistant culture of R-type AST belonged to présentaient le spectre de résistance ACSSuT; la troisième culture résistante, de spectre AST, appartenait au type 2 (voir Tableau 3). type 2 (see Table 3). Both resistant types have previously been Ces deux lysotypes résistants avaient déjà été mis en cause pour des inculpated in fatal meningitis in children. méningites à issue fatale chez les enfants. Of 110 human cultures from the Federal Republic of Germany, Sur les 110 cultures humaines venant de la République fédérale 68 (61.8%) were drug-resistant. The predominant type was 194, d ’Allemagne, 68 (61,8%) étaient pharmacorésistantes. Le lysotype of which all 50 cultures were resistant, mainly to tetracyclines only. prédominant était le type 194, représenté par 50 cultures qui étaient There is reason to suppose that type 194 is of porcine origin. (See toutes résistantes, mais la plupart seulement aux tétracyclines. On above reference to Belgium). a tout lieu de penser que le type 194 est d ’origine porcine. (Voir ci-dessus référence à la Belgique.) S. enteritidis A total of 113 cultures were received from six countries for special examination. Three cultures from Canada were drug-resistant; one of phage type 13 and one of phage type 8 were resistant to ampicillin, and one of phage type 8 was resistant to tetracyclines. One culture of phage type 13 from India was resistant to chloramphenicol, streptomycin, suiphonamides and tetracyclines. The R factor it carried belonged to group Hj, and was indistinguishable from the Hj R factors identified in chloramphenicol-resistant strains of S. typhi from India. S . thompson Of 103 cultures received from Canada and Ireland for special examination, five from Canada were drug-resistant: one of phage type 1 was resistant to streptomycin and two of phage type 1 were resistant to suiphonamides; one of phage type 7 was resistant to ampicillin and one of phage type 13 was resistant to streptomycin and tetracyclines. S . enteritidis Au total, 113 cultures ont été envoyées par six pays pour examen spécial. Trois cultures venant du Canada étaient pharmacorésistantes; une appartenant au lysotype 13 et une appartenant au lysotype 8 étaient résistante à l’ampicilline; une, du lysotype 8, était résistante aux tétracyclines. Une culture du lysotype 13 venant de l’Inde était résistante au chloramphenicol, à la streptomycine, aux sulfamides et aux tétracyclines. Elle portait un facteur R du groupe H j indifférenciable de ceux qui avaient été identifiés dans les souches de S . typhi résistantes au chloramphénicol en provenance de l’Inde. S . thompson Sur les 103 cultures reçues du Canada et d ’Irlande pour examen spécial, cinq venant, du Canada étaient pharmacorésistantes: une, dy lysotype 1, était résistante à la streptomycine et deux du lysotype 1 étaient résistantes aux sulfamides; une, appartenant au lysotype 7, était résistante à l’ampicilline et une, appartenant au lysotype 13, était résistante à la streptomycine et aux tétracyclines.
(Based on/D ’après: Annual Report to the World Health Organization on the Work o f the Collaborating Centre fo r Phage Typing and Resistance o f Enterobacteria, 1975, by Prof. E.S. Anderson.)