Services statistiques et informatisation à l'OCP : rapport d'activités et plan d'action

WORLD HEALTH .ORGANIZATION ORGANISATION MONDIALE DE LA SANTÉ . PBO!fu}4ME DE IUTTB CONTRE L?OIICH^CESCOSE DÂI{S L,ê- R.EGIO}I DU FASSIII DE LÀ VOIT SEP.VICES SÎAÎISTIQUES ET INFOP,J,IATI§,TTION A LIOCP BJPPORT DI '\CTIITITE9 ET PLAttr D'A.CTION ocP/srAl/PR/85. r Original: Ang.lais 1. Historioue Quand le Progranme de LutÈe contre 1'Onchocercose (0C?) adénarrô en 1975, on s'est rendu compte oue la Easse Ce donnâes drêvaluation à collecter nécessitait 1'utilisation d'ordinateur pour le stockage et ltanalyse des données. En conséquence, un systène sonhistiqué de saisie des données et de base de données a êt4 créé en utilisant les services informatiques de 11O'1S à Genève, cependant ouc des consultants en statistique ont arrPorté leur concours au développenent de plusieurs programtes dranalyess de routine. Depuis 1975 le système, de base de données a fonctionné normalement mais lgexploitation sta:istique de ces données a été laissée à la traîne. Cela est en gartie dû au fait oue l'0OCP nta !:as eu de sEatisticien jusquten 198f. De l9B1 à 1983 le statisticicn était basé à Genève et devait travailter d'une manière relativement isolée du rrersonnel professionnel de ItOCP et I'anatyse rlemeurait donc Limitée aux denandes soécifiques venant de Ouagadougou. A cause .lu besoin urgcnt d'analyse intégrée pour rêoondre aux exigences et au dêveloopement du Pro4rarrne, le Directeur du Progranoe a transfêré on juitlet 1983 le ooste Ce statisticien de Genève au siège de I'OCP à Ouaga<lougou. La orioritâ a 6té donnêe à une analyse intégrée des données épidémiologiques, qui sera suivie Dar une extension aux donnêes entornologiques et par un suDîort analytique aux opérations et à la ple.nifi- cation du progranroe. Pour nernettre de rêaliser Itanalyse, deux ordin.eteurs de rype IBI! PC-Xr ont êté achetés Dour le Service Statistique (STAT) et un prograrmeutlopêtateur expérinenté a été recruté à Ouagadougou. Le nouvcau systàtre a pernis le déveloDpement «le rrréthodes analytigucs olus anprorriées pour 1'analyse des données épidémiologiques et lcs résultats d'une prenière analysc intégrée de 1'évaluation épidéniologique de lrimpacE de la lutte antivectorielle ont été comolêtês en juin 1984. -2- Le Cosritê consultatif drExperts (CCE) au cours de sa réunion cn IqB4 a concl.u oue "l'an6lioration du service statistiquc à Ouagadougou a facilit4 lranalyse épi«lémiolocioue raoirle, st.etistiauenent fiable et 6on interprôtation pour Drendre cles rlécisions destin4es à anréliorer les activités,!e ltOC!''. De plus, le CCE, conscicnt Cu voltn're considêrable Ce données à analysere a recon'' oandé qu"une aide supnl4mentairc soit rrise à Ia disnosition du Prograunce nour coorrlêter une analyse exhaustive, imaginative eÈ exacte des données". Faisant suite à cette recomaandation, Ie Directeur du Prograune a approuvê le recrutenent dtun second statisticien pour Ouagadoug,ou et aprâs une procéCure cmplète de sélection, un candirlat a maintenant étê identifié, et on s'attendàce qutil rejoigne le Programe en mâi 1985. De alus le Directeur a décidé de renforcer les installations infomatiques de 1'OCP et de transfércr les activités restantes de Gcnève à Ouagadoug,ou afin de perureÈÈre pleinêBêrlÈ g'ê réaliser Itanalyse exact.è, exhaustive et rapide exigée. Le hardware nécessaire a êtê conrrrandé, et le transfert clu systèue informatique de saisie a déjà cc.qrtenc4. Dans 1e futur ltordinateur principal de Genève sera seulement utilis6 pour des opérations rle soutien. Cela aura aussi pour résultat l.e réalisation d'êcononies considérables malgré lraccrcissement rtes calculs et des analyses. 2. Informatisation 2.1 Saisie des Connées et contrôle Un goulot d'É;trangle{'rent dans l'inforaatisation réside dans le systà.ne actuel de saisie des données et dans le systène de contrôle qui est fait en utilisant Itordinateur orincipal. à Genève. La nécossitô d'envoyer des fiches à Genève par valise, ltattente de la liste des erreurs, I'envoi de corrections à GenÀ-ve et Irattente d,u retour des données fi.nales enregistrées sur des disoues souoles, entraînent des reÈ.errls inévitablcs qui peuvent atteindre deux mois ; à ce moment 1à, lîanalyse des âonnéese en Farticulier entomologiques a peu de signification orrérationnelle. L'OCP a donc déci.t4 de transférer cette activit6 ct de grocéder à la saisie de toutes les données épidêuiologiques et entomologiqu-:s à Ouagadougou. A cet effet, deux ordinateurs simples de tyoe IBH-PCs onÈ 6t6 achetés et le software aporoprié est en train d'être mis en place. Les proqî:arules relatifs aux donnéeo entonologiques ont déjè étê conplêtés et testê8" Du personnel de 1'Unité de Lutte antivectorielle (VCU) a étê formê pour cela et le nouveau sysÈème a dê'rarré, avec une pêrioCe dressai au cours de laquelle il -3- fonctionnera en parallèle avec le systèroe de Genève. Le nouveau système destiné à 1'Unité drEvaluation éoid€niologique (EPI) est prévu pour être opérationnel en août. Cependant, pour lrinstant un système de saisie ad-hoc a été créê pour permettre une analyse rapide des donnêes relatives aux biogrsies cuÈanées et aux microfilaires Cans la chambre antêrieure de 1'oeil (MFCA) pour des cohortes dans des villages spécifiques, isroédiatement après le retour des équipes épidéuiologiques du terrain. 2.2 Stockage massif des donnéesl__qgtgglggggq Un autre problÈ-me technique, - gui empêche une analyse complète et exhaustive - r réside dans la caoacité limitée de stockage des ordinateurs à Ouagadougou, et présentement seulement des sous-ensesrbles de données sgêcifiques peuvent être transférês de Genôve et utilisés dans les analyses. Du hardware supplé-mentaire (c'est-à-dire Ces boîtes de Bernouilly) a été corrnanCé pour petmettre le stockagc et 1'cxploitaÈion de toutes les tlonnées EPI et drévalue- tion entquologique (ENIO) à Ouagarlougou après le Èransfert de Genève. De nmbreux problènes se sont posés pour passer la comrrande des boîtes de Dernouilly mais maint,enant on attend leur arrivée à la fin dravril. 2.3 Infor:matisation des données de vol aux bases d'opérations l6riennes L'informatisation a jusqulà prêsent été limitée à f i:valuation dcs données épidéniologiques et entonologiques, mais nta pas encore êté appliquée à des données opérationnelles Èelles que les heures de vol, Itutilisation des insecticides etc., bien gue ces donnêes aient été enregistrées et analysêes manueltement aepuis le d6but de 1'OCP pour en faire des rapports. Un consultanÈ pour les opérations aôriennes a étudié Ia procé.lure présente et a conclu que le personnel de rang supérieur des bases aÉriennes perdait un. temps pr6cieux pour des analyses de routine et pour la rérlaction dcs raDports. Son raoPorÈ a concltt que ce travail pourrait facilement être effectué par de simnles enployés avec I'aide d'un simple micro-ordinateur avec de base de données de softhrâre 3pproprii:a pour la production autotratique de rapports. .linsi le personnel de rang sunérieur serait libêrê et pourrait se consacrer à des tâches plus imporEentes. Le rarPort a été accepté et le consultant a ôtê recruté en 1984 pour la nise en place du software nécessaire. Ltinformatisation des données relatives aux opérations aériennes a été terurinée de nême qutun progrltrnne destiné à calculer autonatique- ment ch.tque semàine les rlosages d'insecticides requiss une tâche r6alisêe -4- auparavant à 1a main. Un ordinateur Ce tyoe IBH-PC e êté conrnandé pour la bas;, aêrienne de Bobo-Dioulasso eÈ le nouvcâu sysÈème sera mis en service en juin' Une fois que le sysÈème sera pleinement op6rationncl et qu'il sera testâ il se:r'. mis en service à la deuxi-ème base rles opi:rations aériennes à Kara. 2.4 Base principale de donn6os Pour les opérations aériennes Un bon nombre de jonnfes rlcs opérations a6riennes sont d'une applicai:i'cn directe pour 1'analyse intégr.ie, pour un support analytique dans la prise de décision eE pour les analyses écononiques. Durant une réunion avec ltUnitê Ce Lurte antivectorielle il a donc étê décidé de créer en plus Ces bases de donnôes EpI et Etr11O une troisiènne base de données pour les opérations aériennes (AOPS). Cette base de données contiendra par ''bief" (une éturle de rivière bien dêfinie) des données hebdomadaires sur le type et la quantitê dtinseccicides utilisôs, le type d'appareil er Ie tomps Cc vol, et rles inforrp.ations hydrologiques - La base ,le données a ét6 conçue <lc nanière à permettre une connecti.on avec les autres bas':s de données durant 1'analyse intégrée;1?enÈr6e cles Connées relatives aux opérati-ons sériennes se fera à Genève à partir des fiches de données existantes et les donni:es seront ensuite fransf6rées à Ouagadougou. Dans le futur 1?information scra automatiqueslent extraite de la base des donnôes du vol et du progranlte de caleul des dosages (voir 2.3) et les fiches encombrantes Ce donnêes seronÈ éliminées, 2,5 Développement du sofÈware Les cosroosants rle sofÈware disponibles à Ouagadougou sont SPSS-PC, DBASE II, I|ORDSTAR, LOTUS et SyI,IPHONY et les deux rlerniers comDosanÈs en Darti- culier sont extensivement utilisés pour la manipulation finale iles résultats et pour les graphiques. Cependant ces composants ne sont Pas apPropriés pour les besoins actuets de I'aaalyse des données et de ce fait tous les progr€rmmes cl'analyse doivent être,Jévelopp6s à !'OCP. Jusqu'à ce jour plus Ce 150 Progrârmes ont été écrits sur lrorCinateur de bype PCrs. La progratmraÈion constitue unc activitÉ majeure de STÂT eE cela sera spÉcialement le cas pendant la prochaine annéc' après lrarrivée des boîtes de BernouilIy, le transfert de toutes les donnr-ras cle Genève et le début de ltanalyse clétaillée des clonnées entomologiques. Dans ce contexte il. est très important de mentionner que le deuxième statisticien recruÈé est très expérirnentê en infor:sratique appliquée à la statistique aussi bien en nacrc qu' en micro-informatique. "5- 2.6 Autteq gplltçeEen§ Le personnel des <iiffi'rentes ünités a 6té encouragé à utiliser 1':s micro-ordinaÈeurs çrour le travail d'analysc ct plusieurs professionnels se faniliarisent déjâ avec 1'utilisation Crr LOTUS. Un consultant a dé'rclonp6 '.tr: programmc pour VCU pour les projectionsde la portée des insecticides. lin rrtili-" sanc DB^SE II unc base dc données a êté C6velop»6e, qui connrend tout lc personnel de 1'OCP et qui est utilisSe par le départer4enÈ du Personnel nendnnt 1'après-raidi ou les week-ends. Une êtude de factibil.itê a étô, faite Pour uri système informatis6 de base de donnêes pour le 2.ara?.e. Bien que le raPPort finrl ne soiÈ pas encore prêt, la conclusion prêliminaire est gu'une informatisation complèÈc ne sera ni avanta3euse financièrenent ni d'un intérêt pratioue. Finalc'- rnent quelques unit6s corrme I'Information se servent des ordinateurs PC's po'.rr le Èraitenent do textes Èoutes les fois gutun ordinateur nrcst pas utilisé 1.'our 1'analyse. CepenCant cette activité devra Drendre fin,lès que les deux systè.'r'es de saisie deviendront opérationnels. 2.7 Charobre des ordinateurs Deux bureaux contigus du siège de IiOCP ont ét6 transforrnés en chanbres des ordinateurs avec des fenêtres scell/:es et des climatiseurs en split. Chaq're micro-ordinateur est reliê à un régulateur de tension avec une baÈte.is rle sccotrrs qui perrnet le foncÈionnenent de 1'ordinaÈeur pendant trenÈe rlinutes en cas Ce panne d t électriciti:. 3. Services statistiques 3.1 Analyse rles Connées épidémiologioues Un temps considérable a ât6 consacré à l'analyse continue des Conn4es épidémiologigues dont les rêsultats ont êté reportés ail1eurs. Les analyscs !.cs plus irnportanÈes qui ont êtê exécutées sont les suivantes i a) La nouvellc méthodologie d'analyse pour 1'ôvaluation dc 1a lutte et la régression de lrinfection a êtê 1?objet de tests plus poussés et est maintenant employ6e sur une base de routine. ELle concerne les indices d'infee^ tion parmi les enfants nés après le début du Prog,rammc, I,e tendance Cans la charge microfilarienne dans la com,unauté, Cans la peau (CMFC) et la charge microfilarienne dans la chambre antérieure de 1roeiI. Les Ceux derniers indices -6- qui découlent du urodèle de la force d'infecÈion, sont calculés pour des cohort:-e dradulÈes de 20 ans et plus. on a coomencé lranalyse relative à lreffet de 1:absentéisme sur les tendances observées et les résuttats préliminaires su1;r'ir;nt que I'abscntéisme affecte seulenent la ehar3c moyenne (les absents étant moins infectês) mais non la tendanco anrès lc Cébut du Prog.ramote' Dc nouvelles Eéthod3s analytiques sont, aussi en train d'être dévelopnées pour 1'analyse des donnêes relatives à la ponulation rltun âge cornpris ent-re 0 ct 20 ans au début'Ju Prelrarnc. b) Lranalyse déÈai1}ée des données ophcalurologiques pour une cohorte de populacion de 12 villages après 7 à B années de lutte anEivectorielle, y s6i;nris une analyse.Je 1'effet fle I'absentôisoe. La rrrochaine êtape consistera à analyser Itincidence et la rêgression Ces lésions oculaires Cistinctes et les facteu=s 'lc risques qui sty rattachent, en mettant lraccent sur la diffêrence entre les 1ésions du se6pent postérieur eÈ ancêrieur. c) Ltanalyse des données relatives à la nodulectomie - Lranalysa descriptive est prcsque terminée. La prochaine étape consistera à tester 1a valeur des résultats observés avec différentes hypothèses utilisant les r;rodè1cs appliqués. d) L'analyse «les donn6es êpidérrigloo,iques pour la zone de forêt et la zone internnidiaire et la cornparaison entre la Èendance observée et lrépiC6micl'ogi-e dravant 1a lutte antivectorielle cn zone de savane. Une attention parËiculièr:e a ét6 donnêe à la comparaison rle la c6ci.té, aFrès correction pour le niveau d'endérnici cé. 3,7- Hodelisation aonliquée Un progrès consirlêrable a étê fait dans Ic rléveloPpement «le mo'-lèles appliqu6s i lri:pidémiologie et à 1a lutte contre I'onchocercose, et cêla fere 1'objet Crun rapport séDaré. Un premier modèIe Ce ''1'histoire de la vie hôre/narasite'n a clêjà ôt6 d6veloppê et prograrmé et est actuellement utilis(i par ST;'.T nour 1'analyse intég,rêe des rlonnées épirl6rniologigues. La priorité est donnée dans cette analyse à f interprêtation correcte de toutes les donnÉ-es c"ri reflètent la dynamiquc «tes changements des populations parmi la population der vers adulÈes après le CébuÈ du Programme. -7- 3.3 Analyse des clonnées morP,hométri.ques Des analyses ,liscriminantes mrrltidinensionnelles ont étê faites 'l.ilr'3 unc analyse pr6lirninaire Ces rlcnnées morphotttétriques des sinulies aciuttcs, :--f i:, dc tester 1'utilité potenticllc de ces techniques pour 1a classificatiorr Cerr clifférentes cspôces du vecÈeur en rrtilisanc des critÈrcs morphomét,'riqut:s. 1')rt:-' les données rle râférence linitées âisponibles, des analyses discrininantes sr' sont révé1ées plus perfonaantcs que 1es nêthodcs utilisées présentement eE 1cs résultats Étaient.?ssez prometteurs pour -irrstifier la collecte de donaées dc référence provenant .le plus rle si.tes et pcur inclure des variables supplénentaires dans 1'analyse. 3"4 Analyse dcs données entomologiques Lranalyse ,létailtée et inÈf:gr'ee des donnâes cnÈonologioues n't Des encore conrnencé, aa:rgtî:le besoin urgcnt rltune telle analyse. Les r'rincipsles raisons sont le nanque de personnel eE le retard rlans la livraison des boîtes de 3ernouilly qui sont nécessaires au stockage Ce L'ênorme quantité Ce donnécs enÈomologiques réunie par ItOCP. Cepen«lant cet équiDe@ent est aEtendu rour bientôt et avec l,arrivée du deuxième sÈatisticien et du nouveau système Ce saisi' des données on scattend à ce que I'analyse cles données EI{TO rlécollera à pleine viËesse en juin 1985. On peut envisager trois aoproches CiffÉrentes à cetÈe analyse. a) L'analyse génârale détai11êe rles Conn6es cntornoloçiques en meËt3nt lracceng sur les taux <lc aiqûres, les taux de pioûres infectantes, et la distri- bution ries larves infect.qntes. Les rapPorts entre les diif6rents inJices en relation avec la <l.urée Ce la lutte anEivectoriellc' avcc les espèces du vecteur et avec ta situation êpirtêmiolog,ioue. Lr,rnalyse cles caractâristiques Ce 1a réinvasion et rJes Eaux de niqüres en relation avec !''utilisntion des insecticides et avec les données hydrologiques. b) Un support analytique au râpnort lrebdomadaire tle VCU. lL a êt'ê proposé 4e faire entrer .lans le fuÈur les ,lonnées hebComaCaires qui scnÈ envo'yâcs à 6uagarlougou par radio, comne données Èemporaires, «lans la base de données de I'ordinateur pour ENTO, pour permettre un support analytique irunédiat à unc nrise de décision opérationnelle. Un tel suoport devra utiliser les résult,aÈs de 1'analysa nentionnée ci.-Cessus (1) et ne Dourra donc cas ôtre opérationnelle avânt la saison des pluics en 1986. -B- c) L'analyse intép,ri:e des données entomologirlues et énid6miolcgic-ues " Un objectif important Ce cette analysc consiste à Cêterminer la significatio"r êpidéoiologique des indices entonologiOues en nettant spÉ:cialement liaccent sur les faibles Dotcntiels de transmissipn et les niveaux de tolérabilitê des taux de piqûres ,lans les cr.ifférents sitesi (:pidémiologiques. La modélisation apl:iicuil ser€l extensi.rement utilis6c dans ceÈte analyse. 4, Âutres activités Le statisti.cien a oris une part très active dans une série de rêunions destinées à prénarer le plan rlrooérations rle la 3ème phase financière, à la planification de la recherche, à Ia dévolution ct à la planification des âctivités êpidéniologiques. Les r6sultats épidéroiologioues ont étê présent6s à plusie'rrs réunions et ateliers et à. une conférencc eÈ quelques publications sont en pri!r'a- raÈion. Des visites on3 été rendues au personnel staÈistioue de I'OC? à Gcnàve et quatre réunions sur la modélisation appliquée cnt eu lieu. En général la rêCaction de raooorts a constitu6 durant ltannâe écouli:,e une activité majetrre reguérant beaucoug de temps. 11 est tout à fait reconnu que ltanatyse des donr,êer' a peu de signification si les résult.qte nc sont pas correcEelnent enregistrôs r't appligués à un programrc cp6rationnel tel que ItOCP, et que tes act,ivités ci-dessus font partie inté.grante des responsabilités de STÊT. I1 y a eu ccpendant souvênt des interruptions rle 1'analyse des donnôes et ces charg,es suoplérnentaires consti- tuent une autre raison qui fait que ltarrivée dtun seconC statisticien est atEendue d'urgence. 5. Renarque s gênérales Les renlances principales err épidémiologie à IrOCP ont été décrites maintenant et 1'analyse des données i:oi,léniologiques est entr6e dans une "Dhasê .le consolidation", avec la continuation dtune analyse détaillée et intégrée. Les prochains drmaines "drattaque" dans Itorrlre du jour sont 1'analyse "tes données ENTO et AOPS, le développemenÈ supplôrnentaire et I'açolication de moCèles appliqués à lranalyse intégrée, et le transfert des acEivités relatives au traite- Dent des donnêes et des bases de Connées à Ouagadougou. Ce ne sera pas un travail facile, vu f importancc <!es donnôes à analyser et la n6cessit6 d'une PrograEûnation innovatrice pour accomnlir les tâches principales sur des mi.cro-ordinateurs. -9- Notre expSrience nous a dênontrê que lnanalyse à Ouagadougou n'cst Pes seulenent réali.sable mais absolunent nêcessaire à 1'analyse apDrooriée, intégrêe et affinôe qui doit être faite. Cependant 1'accroissement orévisibl,e les activités âu cours de lrannée à venir pose la question de savoir si notre nain-d'oeuvre et notre harCwarc sont suffisants pour ce travail. Àu cours ,Je ltannée à venir une 6nctn"- quantité de travail de programation devra être fait nais cela sera Deut-Être réalisé avec une assistance sunplémentaire de notre perscnnel .le Cenàve, qui est déjà activenent engagê,lans lc transfert des activitâs, eÈ.avec Itaide de ccnsul- tants. Pour le rléveloppement eÈ la prograonation cle modô.les apoliqui:s nous espérons pouvoir continuer à. compter sur la collaboration dtauÈres institutions" Une faible extension du hardware sera pêut-être aussi nêcessaire mais avant rlc faire des pronositions concrèt,es on devra attendre de connaître les résultats .le I'expérience des boîtes de Bernouilly et la capacité des ordinateurs IBM )3s à. réaliser des traitemenÈs de routine ainsi que des analyses détaillées et des simulations. La qucstion du hardware sera donc revue aux environs de septenbre 1985.