'''ORLD HEALTH ORGANIZATION AFRICAN REGION ORGANISATION MONDIALE DE LA SANTE REGION DE L'AFRIQTJE ONCHOCERCIASIS CONTROL PROGRAMME IN WEST AFRICA PROGRAMME DE LUTTE CONTRE L'ONCHOCERCOSE EN AFRIQUE DE L'OUEST MODT]LE DE FORMATION EN ANALYSE DES DONNEES DE L' EVALUATION EPIDEh/trOLOGIeIIE Ouagadougou, Novembre 1997
)RLD HEALTH ORGAMZATION AFRICAN REGION ORGANISATION MONDIALE DE LA SANTE REGION DE L'AFRIQUE ONCHOCERCIASIS CONTROL PROGRAMME IN WEST AFRICA PROGRAMME DE LUTTE CONTRE L'ONCHOCERCOSE EN AFRIQUE DE L'OUEST MODT'LE DE FORMATION EN ANALYSE DES DONNEES DE L' EVALUATION EPIDEMTOLO GIQUE Ouagadougou, Novembre 1997 ORGANISATION MONDIALE DE I-A SANTE PROGRAMME DE LUTTE, CONTRE L'ONCHOCERCOSE EN AFRIQT E DE L',OUEST (OCP) TRAITEMENT ET ANALYSE DES DONNEES E,PIDEMIOLOGIQUES DE L'EVALUATION SIMPLE Ce document concerne sculement I'exploitation des résultats parasrtologrques du formulaire N60? l)txunrcnt ( )('l'/ltl\/l \l'/l I.rnrrcr l(II1 PROGRAMME DE LUT'TE CONTRE L'ONCHOCERCOSE EN AFRIQUE DE L'OU EST MODULE DE FORMATION EN INFORMATIQUE ET ANALYSE DES DONNEES DE L'EVALUATION EPIDEMIOLOGIQUE OBJECTIFS A la f-rn de la formation, les participants seront capables de I) comprendre le lonctionnement d'un micro-ordinateur 2) utiliser un micro-ordinateur pour faire des calculs et graphiques simples 3) utiliser un micro-ordinateur pour lairc le traitcment de te xte 4) réaliser les différcntcs étapes nécessairc§ à l'analyse des données dc l'évaluation épidémiologique d'un vi[lage du Procramme de lutte contre l'Onchoccrcose: Dépouillement manuel d'un village évalué Calcul de la Prévalence brute. standardisée Calcul de la CMFL Notion de I'anal1,se longitudinalc PROGRAMME Le programme est établi sur 5 jours. Il est demandé à chaque participant de lirc les documents, et de revoir les differents didacticiels pour nrieux comprendre et utiliser un micro-ordinateur. ler jour: DOCUMENT OCP/BIS/tNIr/3 lntroduction au lonc(ionncn-icnt d'urt micro-ordinatcur Notion du DOS Chargemenl. d'un programme E,tude d'un didactrcicl * Didacticiel IBM * Didacticicl DOS + Didacticicl WOI(l)t'lrltFLrC-l- (cn Arrgl:ris trnrqttcrttcrtl) * [)rditctrcrcl l-() ltJS (crr Anglrris untqttcrttcttt) 2ème iour: DOCUMENT OCPiBIS/INF/2 Dépouillement d'un village * Classification par sexe et âge Calcul manuel de la Prévalence Démonstration de EPICROS Didacticiel DOS Introduction à LOTUS 123 3ème iour: Manuel de Lotus 123 En utilisant l'ordinateur, faire le Calcul de la Prévalence brute Calcul de la Prévalence standardisée Calcul de la CMFL E,xercices libres sur le calcul des différents indices 4ème iour: Manuels de WORD PERFECT et EPI-INFO lntroduction à WORDPER-F ECT Démonstration du logiciel E,PI-INFO Discussion sur [a surveillance épidémiologique lntroduction de l'analyse Iongitudinale 5ème iour Vérification des différents documents Copie de certains programmes Rér,ision des diflérents concepts Mise au point du rapporl de hn de formation Renrarque: Ceux qui ont dc1à des connaissances avancées en Infornratiquc pourront s'attaquer directement à I analy,se des données en utilisant lc plus possiblc lcs logiciels Lotus l2i ct EPI-lNFO. 1TRAITEMENT ET ANALYSE DES DONNEES Saisie et validation des données . l-e. ÿpe de formulaire utilisé pour I'évaluation épidémiologque simple est le N602(Annexe 1). Sur le terrain, l'équipe utilise la fiche de I'annËxà z por. le premierdéporrillsment des résultats de l'ènquête en cours. Dès le retour du terrain, lesformulaires des'üliages évalués sont remis aux responsables de Ia saisie des données,pour la mise à jour de la banque de données épidémiologiques installée sur les micro- ordinateun de I'OCP. I-a toute première opération consiste à vérifier systématiquement tous les champs de tous les formulaires afin de corriger ou de remettre à leur place les codes appropriés.Cette vérification se fait famille par famille, individu par individu. Dans le cas d,un village à plus d'un_ passage deux personnes procèdent à cette vérification: Ia premièrelit le passage précédent et la seconde vérifie le passage en cours. A titre d'exemple, un village doit comporter sur toutes les fiches la màme i"l"u, pour cerrain-s champs (mois, année, village, état, .--), alors que certains champs varient t"L lu famille (à I'intérieur duüllage), ou Ie num.éro individuel (à I'intérieui d'rn" famille). Tout Àoureau üllage reçoit un numéro ainsi que chaque individu nouvellement enregistré. [-es numéros des villages airui que les numéros individuels sont tenus à jour da,is un cahier répertoire. Dès la fin de la vérification ra saisie peut corrrmencer. [-es données des villages sont saisies deux fois à l'ordinateur. [-es der.x opérationsde saisie sont exécutées par deux personnes différentes. Cette double saisie des mêmesdonnées minimi5s les erreurs de frappe tout en assurant aux informations saisies unebonne intégrité. Néanmoins les éventuelles erreurs sont corrigées autant de fois que nécessaire. [-es données ainsi saisies sur disquettes sont copiées sur le disque dur, afin deprocéder à leur validation. t-a validation concerne esientiellement lei ü[ages à plusd'un passage- L'opération de validation compare les codes des champs du passageprécédent d'avec ceux du passage en cours. Pâr exemple Ie sexe d'un individu ne doitqI uTttt-d'un passage à un autre, tandis que l'âge dàit etre majoré de la différenced'années des deux passages. [-es erreurs dites de-validation soni corrigées. [-e ryclevalidation-correction-validation est répété jusqu'à ce qu'aucune erreur n"e subsiste plus.Quelques exemples «l'erreurs de validation: lnterversion des numéros individuels Attritrution de deux numéros individuels différents à urr nrême in<livi<Ju Changcnrent de sexe Allc rrrtrr confOrme Intj rvrriLr codé au statut d'exanren 5 ou 6 arrx pa-\sirqes 1rrécédcnts cr. sc rcl r()uvilnt au nouveau pa-ssage Nrrrrrér<t indivitirrel m:rnrlrrlrnt 2II exisæ une erreur zubtile. C'est le câs par exemple d'un individu dont le sexe a été codé comme masculin, et plusieurs passages .prèt on découwe que cet individu est féminin' Ces anomalies de codifrcation déæctees sur le terrain, doivent faire I'objet d'une correction particulière zur les donnees de tous les passages précédens avant touæ validation des données du passage en cours. Ces anomalies portent généralement sur le sexe' l'âge et Ie stanrt d'examen. une fois les donnees correctement validees on procÈde à la création (mise à jour des banques de données) des fichiers d'exploitation communément appelés fichiers d'arnlyse' Ces derniers constituent des entrées pour les programmes d'édition des résultats Sur imprimante ou sur d'autres supports pour une utilisation funrre par des progralnmes spécialisés. Analyse des données L'unité de base utilisee dans I'analyse des évaluatiors est le village' Deux types d'analyse sont effectués: l'analys. ,.r*r..râle (Annexe 3) et I'analyse longirudinale (Annexe 4). I-æs annexes 3 et4 donnent une sortie des résuluts en utilisant les programmes d'analyse développes par OCP/BIS. Au niveau de chaque Pays participant du Programme OCP' qui dispose un micro-ordinateur, le programme SEPT qui tltt à transférer 1es anciennes données OCP, perTnettra d'avoir les mêmes résultaS. [æs exemples de calcul sont exposés en annexe 6. L'arnlyse trarsversale perrnet d'avoir une photo de ta sinration épidémiologique à un momenr donne. Elle est basée sur toute [a populaiion examinée. On calcule les statistiques usuelles sur la distribution de la population recensée, présente et examinée par sexe et par âge. Lrs indices usuellement utilisés sont la prévalence et la CMFC' t-a CMFC est calculée uniquement pour les adultes de 20 ans et ptus. l-es formules détaillées se trouvent en Annexe 5 L'anatyse longirudrnale est plus complexe et nécessire la notion d'analyse des cohortes. Elte est essentiellement basée sur le suivi dans Ie temps de la cohorte des adultes de 20 ans er plus sélectionnée lors du premier passage de t'évaluation épidémiologique d'un village donné. Elle permet de deceler les changements épidémiologiques intcrvenus dars le temps sur Ia cohorte. Pour une lutte antivectorielle bien réussie Ia prévalence et la GMFC doivent tendre vers zéro dans la cohorte des adulres. (Voir un exemple en annexe 4A et 48)' Calcul des usuels h méthode de calcul exposée ci-dessous s'appuie dans un premrer temps sur le dépouillementmanuel enutilisantleformulairedel'annexe2' Lesrésulutsdelalecruredes biàpsics sont enregisrrés sur ce formulairc en urilisanr le classement par groupc d'âgc c( par scxe (a) notation /0i Si unc penionne a dcs résultats nés.a(rls Pour lcs dcux brtlpsrcs uttlrscr Ia 3(b) Si une personne a un résultat positif pour au moins une biopsie, inscrivez les deux chiffres, par exemple /0-l/ ou 19-151. Comptez le nombre total de personnes ayant des résultats positifs et le nombre total de personnes examinées dans chaque groupe d'âge et pour chaque sexe et irscrivez les deux chiffres dans I'angle en bas à droite de Ia case correspondante: par exemple 0/8 pour les sujets masculins âgés de 0 à 4 ans. Enfin, à la partie inférieure du forrnulaire, inscrivez à gauche le nombre total des sujets de sexe masculrn ayant des résultats positifs et le nombre total examiné, et à droite le nombre total des sujets de sexe féminin ayant des résultas positifs et Ie nombre total examiné, puis au milieu le rotal général pour les deux sexes. Revérifier unc deuxrème fois le dépouillemenr. Prévalence srandard isée Puisque le uux brut dc prévalence dépend de la composition de la popularron en groupes d'âge et sexe, ce serait alors trompeur de comparer deux populations données en utilisant les deux uux globaux de prévalence à moins que les deux populations n'aient la même strucrure en âge et sexe. [: prévalence standardisée par la méthode directe perrner de corriger le Laux brut de prévalence en I'appliquant à la population sLandard afin de tenir compte de [a variabilité due au sexe et à l'âge. [æs calculs se font de la façon suivante: l) Classer Ia popularion examinée par sexe et par âge 2) Classer la population positive par sexe et par âge Pour le point I et 2 se référer à I'annexe 2 pour le dépouillemenl er le classemenr par sexe et âge. 3) calculer [a prévalence brute par sexe er âge, c'est-à-dire pour la classe sexe- âge Ù, le nombre de positifs de cette classe ij divisé par Ie nombre d'exanrinés de cerre nrêmc classc ij. 4) Appliquer ces prévalences brutes à [a population standard. Cc sonr les positifs attendus dans la population standard. s) lrs prevalences standardisées sont calculées en rapportant la somme des positrfs attendus (I{ommes, Fenrmes, Total) au total de la population srandarrJ (Hornmcs. Fcrnntes.'foul). Lr taux dc prclvalcrtcc ainsr starrdardisé pernret dt contparcr les villagcs er)trc cu\ I)our plus dc détarl. \,t)n .rrnc\c ) 4FM I 2 Calculer pour chaque persoule la moyenne arithmétique des résultats des deux snips Soit x, : (sl +s2)12; i étant I'indice pour un individu quelconque. Faire la transformation [.og du résultat obtenu à l'étape 1 plus 1: Soit y,:hg(xi + 1). [,og étant le logarithme népérien. Calculer la moyenne arithmétique des séries des y, : Soit Y Calculer frnalement la moyenne géométrique qui est la transformation exponentielle du résultat obtenu à I'étape 3 moins l: Soit MG : exp (Y) - I CMFC (CMFL) Pour la CMFC ou la charge microfilarienne de la communauté (CMFL en Anglais), le calcul se fait de la même manière que la moyenne géométrique mais pour rous les adultes de 20 ans et plus examinés lors d'un passage. Elle permet de mesurer la force de I'infectron onchocerquienne. Pour plus de détail voir annexe 5. Interprétation des resultats. Dans le cas d'une analyse transversale, Prost et al (1979), ont donné une classif,rcation des différents niveaux d'endémicité dans I'onchocercose basée sur la prévalence. il ressort donc de ses auteurs que r) lorsque I'onchocercose atteint 60% ou plus des individus d'une cornmunauté, la situation est intolérable ou risque de le devenir à court ou à moyen terrne; l'équilibre de ces populations est précaire: c'est I'hl,perendémie; 2) lorsque I'onchocercose atteint moins de 35% des individus, la maladie n'a que de-s effets Iimités et est socialement inapparente: c'est I'hypoendémie, niveau tolérable de la maladie; 3) entre 35 % et 6O% de sujes atteints, le niveau <Ie gravité est variable à la fois enrre les groupes et entre les individus d'un même group€: c'est la mésoendémie. Ces définitions, fondés sur des constatations taites en zone de savanes d'Afrique <Je l'ouest, n'ont pas valeur universelle. Nous pensons toutefois que I'onchocercose se rencontre tlans cette réqion sous sa formc la plus gravc et il y a pcu de chanccs pour que des études l'aites dans d'auucs écosystèmes conduisent à baisscr les dcux seuils que nous avons déllnrs I)our unc analysc longitudrnalc, tln sc trasera sur(()ut sur unc rcpréscntation traphrqLrc p()rlr llllcux.rpprécicr [a tendancc épr<lérnrolotique du vrllar]c (Vorr examplc cn:rnnerc 4A ct -11)) 5 4 5Bibliographie Armitage P., Berrl, G. Statistical Methods in medical research. Second Edition. Blackwell Scientific Publications, Oxford, l,ondon. Betry R. Kirkwood. Essentials of Medical Statistics, Blackwell Scientific Pubtications, Oxford, l,ondon Jenicek M, Cleroux R. (1982). Epidémiotogie Maloine, I Vol., Paris. Principes. Techniques. Applications Prost A., Hervouet J.P., & Thylefors B. (1979). t-es niveaux d'endémiciré dans I'onchocercose. Bulletin de I'Organisation mondiale de la Santé,57(4),655-662. Smith P.G. and Morrow R.H. (1991). Methods for f,reld trials of interventions againsr tropical diseases. A toolbox. WHO/TDR. Oxford Medical publications. Oxford University Press, New York. Remme J., Ba O., Dadzie K.Y. and Karam M. (1986). A force-of-infectron model for onchocerciasis and its application in the epidemiological evaluarion of the Onchocerciasis Control Programme in the Volta River basin area, Bultetin dc I'Organisation mondiale de la Santé, &, 667-681. Rumeau-Rouquette C., Breart G., Padieu R. (1985). Méthodes en épidémrologie. Ecahantillonnage - Investigations - Analyse (3e édition). Irlammarion Médecine- sciences, Paris. Vaughan J.P. & Morrow R.l{. (1991). Manuel d'épidémiologie pour la gestion de ta santé au niveau district. organisation mondiale de la Santé, Genève. 6I I I xe I I neAn i ! I ) o o. oP6o -o o z o 3 o- o CJ ! o q o a) o I I =tâz -CI<-i 3élgoi I :llili rl Iirt; I I -J- o o! m m C 9 9 -o n o o7 7 ? m rl r C m o o z , m r- z o a o o m :D o C C ri ri z : C- i1l C n r ô I( 3 9. @ (o ro fl f I : : l--l ô.1ol I (o I O ! o)6 o (.o o l C o. o i ! I ._i (o I r§ lt O) 3 _: o) C 3(}. o -- l I I _j (, I CD o 0) o o- -(Do) -oC(D. o { I @ o C OJ :1 6' I f\) m (, I O) 5 c,(C (D I I l- I I I : _1, I I '! I t- I I : IL- ! i- It-- I '(, :o xl rll>i .or 'looot6?o:l= o o,:r(Lj-.1 I o(/) , 0J0illq I I N) tù I À)À m =fq o6oi ,,i (D-Dlor xo.(o (,! I i V) l. =@ -o .: :o üôj o o IiÈ3", ll [ 1,f-1 li;i gr l:, f l:o't X I Iro(, I L(D : ô l nOrn.T'-)rÇ; :D:m' (t l-- ,O, I lo N I :' I I I 1-- I Ir- I I I I I I I I iiii-r l-Ii-- III I I I I I III I L i_ iL i I I L L- -L- I I I f- I I II I i- Ir I I I I I I l I i I I I I I I I l I I IL l- ir- I I I l. L I I I ! I I I iliii i,tllitl o7, 'o <'Z t- ç) m t-_-lli L.- l§t aôCA(, t- C) .P..) §t 'o 'v 01 C) t---l t c-. l-l'-- lL,o ,(__ l ? Annexe 2 o tr, o À Ul @ P o I PÀ a\)o î\.)(o P(, I (ô qJ C I A(.) o o o o o o § o § I\ o o o o o ..4, -+{ I§ o o o \ I{ \ o I\o\ ^ § C\ ô o o o o o o o o o o § § o o o§ a o o o ,§ \ ,§ §) t tP o § ,$ \I LU o { o o \.r,( t^ o {.1 I c -o a(-À o 1JI\ q t aOc .-\ o\ Q\) a\ Ào\ , Or\\ §(.1, a\ o o .\ o§t- Or§-\ !ÀJ a§\\ \ '\'atv l\l -\- Y S o-*'o-i \ =a -§ (^, o a§ è. § I§ ôr §) A. I -ot! \ t,^, It- vl \ vl -+J \q\ a .\ o (^§ ,§ -tJ q§ o § c§(-t a-\ .§ a t4 o a .\ (J { a -'(-/ U o (}t t,,.l If5 \{v a o ci ti a 1-è. a \\ I{. ê, h a d\ \\ -\ t» (rr a{lt,6 .o \r. , -{, oo a + \ t-\ TJ§ a§ o ** a §t o , I -fJ a b\ a À. §ô(- Or o §,§ a o -o tl I o^l o.\ o § { G. -aJ tA.è. \ o$ ,\{It \ o \ .o q o I OA \ ao\ a o5 Og(r. t @ -o o ô. a ô-4 \ o \ UJ loo lqrlrr\ t\ a a Or1ô I{ o J.r § h OO ô§ I o^ \ Oo§ .rj § \ t o (f) (/-, s 0) \ O (r.o + ---{ C- x (:, r?t .D u o-, c) rfl @ -c- o\\.' .l o-\ o. 1-tl àt^ _\_ \êo § t .\:. Or -\\ o. \\ Ot Y, o\(\, .\ Sr .\ I o0§ --\ ooô '\- <i -§i o :E I l\ {}r O) ô, -'\ --\ Ooo\- ,"\ .È J a{ a, (\. G , Lt tT\ù -o I I\ qt c ( c ô </l o\ i (^J </ \\ A) a{L ^6\ /\_ --\ {{. --ç\ §t Èô. il co(,l \(! §, T1 tl -:.-ù 1J o I i I i t I I I I I I I I i I BAnnexe ) §§iïlr:È::B:: ii r: : t4 l x=Êtr -'È' i§=B :F I §iiTî'r:È:: E::-==*--- -ôo--oo r a-è§Éuu- ;- il Ëit :: :l- :: ;ll É 3I =a Ett ÈE. ;it i: r; i:-Èl :: -== i: Ëg -:i @ :.: N ô o :T 7 Z :: D n ::] D -:- a .=:.- @ - i; o È9 I :' :. È a E -::-------:1ts Lôpé o @ o o D D @ D o f o È ; 3 L - - 3:: J,( ) 'lÉir(, I, Anncxe ! Aoàrr 0)':s ic'/ 9 llrr 13 It r,lrxAtysls 0f IRtr0s lx Àt t0a0s âx0 Pltvâr.Ir(cI I0R SIHPLE Sunvty: rtSUtlS I0R Yltl.âGt 8( : T ItRC0URâ ) lnlttll tgc 20 yr.rs to Q§ yrtrs Rtsut.ts f0R rl(0st srlPPt0 AI AU. suRvtys (Rtâr. c0H0Rr I YTARS l(ur{ttR pRtv 5.t 0Art trAG c0l{lRor txArl. (ll( r) PRtv. '-'i'-" l5l0 0 0.81 ll 91.5t (.rl ]912 0 5.00 Jl 91 5t ( (1 8ll? 0 I.00 Jr 90lt 5.it 8{t2 0 10.00 JI il.01 8 2t 8612 0 12.00 Jl {8.(\ e 01 .tol 0 l{.08 Jt t? 9t ô 0t cltt I 5J.18 10.58 ?,1 .16 ,.11 I (0 O JI (951 Coxt.lxl. I ( J?.06 - 88. 16 r { r8.51 50. tJ ) ( 1J.60 r2.Jô) ( J.57- tt.98t (0.58- ?.66t ( -0 02- 0.15t RIL0ilvt cÀf t :::::::: 100 0t { 5 2l ll ol ? tl c fl 0R[0tcltt' RtLAI Crltt :::::::::: 100 01 t.' 8t ( I ?l l l 8l .l 8t -18 tl 0lslRltull0l( 0f nt f0r Ilit c0l{0RI YTARS ,(utl8t.R OAIT fIAG COl(IROL IXAI. 7510 0 o.El Jr r9r2 0 5.00 Jr 8lt2 0 t.00 ir 8il? 0 10.00 Jl 8612 0 t2.00 Jl _iol 0 l{.08 il 0 I 2 J 9 l6 1) 00 J 2 0 i5[nr (?5t ::::: , 5j r l/, (( rù 0? 0 ? a 0 J t(. I ;:: Lt) [' l) t tr) 'ld I )tt 0 Rtsutls f0R Il{0st sxlPpi0 ât It{t f0tL0t-up suevir ll(0lcalt0 Ax0 ât rr{i flÊ5r suevir ytARs xufi8tR Easi o5stf,v s. t EAS[ o8stnv oAIt ttâc coilRoL trAt(. pRty. pRtv p8tv. c,1rr crrl l5l0 0 o.Et 66 9).0t 97 ot ?.lt ll J( il.5{ ?91? 0 5.00 51 96 lt e{.1\ j.l\ 6).28 Jô.lo 8ll2 0 ).00 rs 15 9t ct tr I 9t l? o? 2ô J0 6{l? 0 10.00 {5 95.61 r5 6\ 6 rl 66 7J I 8{ E6l? 0 t?.00 r0 05 Ot 5? 5l ) et rJ 7r I 9l 8901 0 l{.08 J) 9{ 6t rJ 5\ 5 ol 5. Jl 0 lt ( 0hrrt I r corr Ixl )0 9( ?r 60 t8 r: :( ll ?l l il c ÊttAIlY{ chf t :::::: 100 0t 5. 5'. )6 \\ ll)\ .l a\ 0 r\ ,ii0tattt RItrl (htI - :':_::, r0c 0\ 50 P\ r I ?\ 'b, 18 l\ - xur{8iR 0f I'lf p[R sl(lp--- 0.5 I 5 ll 8 ô 0 0 0 0 10 Annexe 4b EPI OATASASE §I{I{ARY SYSI€X Ylttrgcfluô.r U Vlttrge naE ...-- TIERCûJRA Cqntrycod. I Cqrltrynæ .--.. ELlR(lx^ f^SO fÜln code ll l.sln næ (æoLO/LERABVCTi{o€ Ph..e code I Ph.se næ ....... f 7501 coordlnatc3 . lOÉ 5"t{ (ÿ6(ry xtrôcr of aurycys SurvGy Our.tlon Pop. ?q- Pop. Prcv. Prcv. Io. oata f}?. cqrtrot ccrBrJa Prcrcrit Exllln d ol xf s cxfL 8tlrd. z6 Ftrg I 7510 s 2 7912 S I E1r2 s 1 E4t2 .S 5 E612 s 6 E90l s 162 151 170 IrJ lEl 189 0.El 5 .00 7.00 l0 .00 12.00 1( .08 lll llE ll2 l16 r55 152 2-9 2.7 5.5 0-9 115 140 1t7 l5t 165 165 n.6 65 .8 60.6 lE. 1 l9.l 1.8 7l.l( 29.75 22 -O2 5.21 1.26 0.21 6-5 3-7 0 0 0 0 0 0 Tierkoura (Comoe) BURKINA FASO 100 90 BO Tendance Obs ervée - p1é{11g 6' 970 o *60o 1so a 340c @ 930 .<D o- 20 Prévalence en mf dans la cohorte des adultes 10 o c0 8 10 l2 14 Années de lutte afrtivectorielle 16 18 20 drn3 Y PrÉvalonco e*r m( ta poputatbn 4 6 À a-------- 9. 'â.. CMFC '+ + 11 Annexe 5 Cette annexe donne le détail des formules utilisées dans les programmes d'analyse qui ont permis de sortir les résulta6 de I'annexe 3 et 4. 1. Classes d'âge Sept (7) classes d'ô.ge sont le plus souvent utilisées. Ce sont GROUPE CTASSE 1 0-4 z 5-9 J 10- 14 4 l5- 19 5 20 -29 6 30-49 1 50 et plus 2. Population standard Pour la standardisation de certaines variables telle Ia prévalence, on utilise une population invariable constituée des 22,041 premiers individus examinés. Cetre population est dénommée population standard et est résumée dans le tableau ci-dessous nommé STD dans les formules. AGE, 0-4 5-9 HOMMES FEMMES TOTAL 1401 r353 2,154.00 fl69 1507 3,216.00 10-14 1739 1465 3,204.00 15-i9 1 085 92r 2,006.00 20-29 30-49 50 ct plus 1 409 1738 3,147.00 2388 282r 5,zoq oo 1 208 t231 7,445 00 TOTAL l(),999 (X) r r,042 (x) 22.(X r.00 12 3. Population recensée (Census population) I-a population recencée est calculée par rapport au statut d'examen- C'est l'ensemble des individus dont ce statut est 1, 2,3, 4 ou 7 ' 4. Population pésente (Population present) 1-a population présente est cetle également relative au statut d'examen. Ce sont tous les individus dont le code d'examen est 1, 2 ou 3' 5. Poputation examinée (Number examined) t-a population examinée est ce[[e de tous les indiüdus dont Ie code examen est 1. 6. Population positive (MFS positive) I-a population positive est celle de tous les individus dont le code examen est I et Ia moyeïnl arithmètique des deux biopsies cutanées est supérieure à 0 et différentede999' IEXAM = 1]ETt(sNlpl + sNtpz)/z> oET <> 999 I 7. Prévalence des microfilaires (Prevalence of MFS) soit EX-\, le tableau croisé (groupe d'âge par sexe) de la population EXAminée. soit ËOS,, Ie tableau ..oire (groupe d'âge par sexe) de Ia population pOsirir", soit STD,, ie tableau croisé (groupe d'âge par sexe) de la population ItanaarO (STD), i ëtant I'indice des gràupes d'âge et j celui des sexes, Ies calculs suivants sont faits Pour : 1) Ia prévalence des microfilaires DPosu PrcvU = j:l xtgp I pour i=l à 7 (a1c) ct i=l à 2 (scx) | Lexa 1 r.l 1 DPos,, =/-r *10O ,l LEx..,, t=l Prcv..NM { pou, t=l à 1 (agc) cr j=l (scxz) | 13 Prcvr* Prcv- . = PrcvStd..É@ 7 DPoso = 'il xl0o f.fuao I.l 2 D Pos Fxa 7 » l-t 7 » I.l 2 D )'l { W* i=l à 7 (agc) ct j=2 (sc;r^e) I xl00 { pour i=l à 7 (agc) ct j=l à 2 (sr-xz) }u I 2) P r êv alences standardisées 7 i.1 DPos,,xStd,, 1 Dt a, = ,-l xl00 1 DSrd,, I pour t=l à 'l (asc) er 1=l (se:.2) \ xl00 ( pour i=l à 1 (agc) ct 1=2 (scxz) I l=l 7 DPos rxStd,, i= I Dexao PrcvStd -fæ i- l 1 I.sldr. 't2 L D Pos xSr/IJg PrevStd -l@ x100 { port i=l à 7 (age) ct 1=l à 2 (scrc) } E. Moyenne géomé(rique et Intervalle de conf'rance à 9-57o (95% confidence interval of Geometric mean) Soit 72L Dexa i-r j-r ÿ 12 D Dsra x Ia moyenne arithmétique des biopsies cutanées n Ie nombre total d'individus examinés (taille de l'échantillon) k rrnc v:rriable allant de 1 à n [-c loq étant le logarithme népérien lc tcr rrre "c.rp" rcprésentant I'exponclrticllc c( lù tcrnrc "sd" la déviation stlrndar(1. r=l 14 avec: a) Ia moyenne géométrique (MG) est donnée par la formule suivante i=.xy'-t - Dv* [ -.y = "'' = 'x)log(x.+l) n n b) I'intervalle de confiance est calculée comme suit 6' rx'jr ef,p 'J^ - I avec pour base les calculs intermédiaires suivants sd2o) =j,»0,-yr2 -s«y) =,I=to.,} 95% I.C. pour y sd(r) .sd{v) = "' J; ÿxt.96xsd9l-t r1.96,4 ,li 9. CMFC (CMFL) I-a CMFC est basée sur la population examinée de 20 ans et plus. L-a formule est Ia même que celle de la moyenne géornétrique, mais pour uniquement Ia population ci-dessus citée. EIle permet dc mesurer Ia force de I'infection onchocerquienne. i5 l0- Distribution des microlitaires (Mean number of microl-rlariae per skin snip) I-a distribution des microfilaires est une répartition par classe de Ia moyenne des deux snips au sein de la population examinée. [-es classes sont déhnies comme suit: 0 0.5- aL- 4- 8- r6- 32- 64 12,8- 256- pour pour pour pour pour pour pour pour POur pour moyenne moyenne moyenne moyenne moyenne moyenne moyenne moyenne moyenne moyenne nulle comprise comprise comprise comprise comprise comprise comprise comprise comprise entre entre entre entre entre entre entre entre entre une une une une une une une une une une 0.1 et 1.9 inclus 2 et 3-9 inclus 4 et 1.9 inclus 8 et 15.9 inclus 16 et 31.9 inclus 32 et 63.9 inclus 64 et 127.9 inclus 728 et 255.9 inclus 256 et plus inclus Cette distribution est fiirrù p:rr sexe et par classe d'âge. Elle permet cle distinguer exactement quel est le groupe qui est le plus exposé à l'onchocercose I6 Annexe r- A Catcu( de Ia Prévatcrrce starrCardisée [qn d: vi t Iagc:Tier(oura CodG dJ vittage U Eass { n: Cqæé oate: oEc. 198'l Tot.I cxüniré Prévatence brute x Positifs l{ T 0-1 5-9 t0-14 15-19 20-29 l0 -49 50. E 6 6 6 9 18 9 12 6 l0 7 rl 1l 9 20 1? 16 1l z2 l1 IE 0.0 0.2 0.5 1.0 1.0 t -u 0-9 0_0 0.0 0.6 0.7 0.8 0.8 0.9 0.0 0.1 0.6 0.8 0.9 0.9 0.9 0 I l 6 18 E 0 0 6 5 l1 10 t 0 1 I l1 20 28 16 x 0.rJ 0.57 0.6462 70 tlz Pogrtation Stardôrd dG ['OCP r{fT 0- '1401 1553 2751 5- 1769 1507 3276 10- 1159 1165 3?U 15' 1085 921 2006 20- 1409 1158 l1t7 l0- 2l8E 2821 5209 50. 1208 1?37 ?ÇLs 15 (0 o< l{cnôre inf ecté est irné pour Ia poputation stardard x Taux de Prevatence bru 72.6 57.1 &-t 0.0 294 .8 869 .5 1 085 .0 I 409 .0 2f 88 .0 10rJ.8 0.0 0.0 8æ.0 657 -9 1470.6 2170.0 : 099 .6 0.0 291 .8 1 74E.5 17 t-? -9 2879 -6 (558.0 z 1rJ.l 1 0999 r 1042 22041 7120.1 6277-0 1l197.r Prévatence stônCâ.disé 64--l 56-8 60 I Eî I l? Annexe 68 Cctcut de t. O(FL 89*Bd t{ (8r+8d) /2 t{ Ln(((8s+8d)/2)+l ) xt T2 86 155 l8 z2 z6 104 22 95 ?u 171 7 ll 154 285 ?5 55 ?21 2t9 lll 155 l6 l9l 3z 1l 68 ?1t 101 u 78 EO 21 1 t6 17 0 0 10 21\ 91 16 0 75 18 79 110 0 172 ç5 0 & 1r. 59 19 12( 9l 216 zt0 0 56 4l n.5 l9 1l ll 5Z ll L7 -5 112 85 .5 1.5 16.5 T7 11? -5 r2.5 26-5 110.5 r24.5 71.5 77.5 16 96. 5 16 6-5 3L 107 40 10 .5 0.5 2l 8.5 0 0 20 121.5 45.5 91158 761 20 6E887 7 1357 Lt z3l t 05t,6 l 7805 ?5129 0 0 ott52 8081 1 81945 0r490 r 1549 11772 701 l0 1(l1l 8éÆT2 TT9lZ r95 79 0 50.5 L2 l9 1.61091 l 3.78418 l 4.16109 3 2-99573 3 ?-18l90 Z 2.61905 0 1.97029 3 2.L8/90 2 l.Eal56 l t l 27 0.5 l].5 2t 0 t7 -5 9 19 .5 55 0 86 22.5 n ll t,.962U 1.t 601t, 1 .50/.07 2-eé220 4.J5670 4 .96611 2.&268 l - I1418 (.71(02 4 .85210 4. 2A158 1.56109 ?-9Lt,L3 ( .57985 z-61121 2 .01 490 5.5555( 4-6E2ll 0-69514 1.21887 1.62L97 2.25129 4. r8205 1 -26969 1.6T282 0 1.672A2 0.10516 ?.6711t 1 . 21887 0 3.65065 2.10258 J. 701 l0 1.02515 0 4 .16590 3.15700 0 1.52616 ? /.E 202 17 129 I(1 21? 0 212 6.5 22 29.5 19.5 62 16.5 116 120 0 1 2t r01 6.5 64.5 70 .5 106 0 106 ? l 5 l l. J \ I 126.6 96 1 22?.7 l(oycl.ft dcs Lx J.5 2.7 l.l \2.7 l(.6 22.0CXFL F