Estimation de la charge des maladies d’origine alimentaire : un manuel pratique à l’usage des pays : jeu de diapositives 2 sur 3 du manuel. Module 2

Estimation de la charge des maladies d’origine alimentaire : un manuel pratique à l’usage des pays Module 2 Jeu de diapositives 2 sur 3 du manuel Vue d’ensemble de toutes les étapes 1. Introduction 2. Études sur la charge des maladies d’origine alimentaire 3. Planification d’une étude sur la charge des maladies d’origine alimentaire 4. Préparation des données 5. Estimation de l’incidence, de la mortalité et des DALY 6. Estimation des DALY dues aux maladies d’origine alimentaire (attribution des sources) 7. Interprétation des résultats de la charge nationale des maladies d’origine alimentaire 8. Application des connaissances et communication sur les risques 9. Considérations finales Vue d’ensemble du module 2 1. Introduction 2. Études sur la charge des maladies d’origine alimentaire 3. Planification d’une étude sur la charge des maladies d’origine alimentaire 4. Préparation des données 5. Estimation de l’incidence, de la mortalité et des DALY 6. Estimation des DALY dues aux maladies d’origine alimentaire (attribution des sources) 7. Interprétation des résultats de la charge nationale des maladies d’origine alimentaire 8. Application des connaissances et communication sur les risques 9. Considérations finales Estimation de l’incidence, de la mortalité et des DALY • Principales étapes du calcul de la charge des maladies d’origine alimentaire • Canevas pour un modèle de maladie servant à calculer la charge des dangers d’origine alimentaire • Incidence et mortalité • Incidence des autres effets sur la santé et des séquelles • Calcul des DALY • Incertitude • Logiciels 5 Principales étapes du calcul de la charge des maladies d’origine alimentaire Facteurs de multiplication Modèle de la maladie Attribution des sources Incidence apparente Incidence vraie DALY DALY dues aux maladies d'origine alimentaire Canevas pour un modèle de maladie servant à calculer la charge des dangers d’origine alimentaire Exposition à des agents Non touché Touché Incidence, mortalité Maladie aiguë Séquelles Décès Poids de l'incapacité X durée Poids de l'incapacité X durée Espérance de vie individuelle attendue Années de vie vécues avec une incapacité Années de vie vécues avec une incapacité Années de vie perdues Années de vie ajustées sur l'incapacité • Elles peuvent être collectées directement à partir des données disponibles, si l’on peut supposer qu’il n’y a pas de sous-notification ou de sous-diagnostic dans la population. • Pour les maladies dont on sait qu’elles ne sont pas entièrement recensées par les activités de surveillance de la santé publique, l’incidence vraie peut être calculée en utilisant trois approches. • Le choix de l’approche dépendra des données disponibles et du danger en question. Incidence et mortalité (1) Approche 1 : Reconstruction de la pyramide de surveillance • Choix à privilégier lorsque les données d’incidence spécifiques aux étiologies sont disponibles dans les registres de la santé publique ou dans d’autres sources, et que le comportement de recours aux soins médicaux, les tests et les pratiques de diagnostic ont été étudiés dans la population. Résumé Cette approche part du nombre de cas notifiés d’infections par un agent pathogène (par exemple les infections à Salmonella) et le corrige pour tenir compte du sous-diagnostic et de la sous-notification en appliquant des facteurs de multiplication reflétant chaque niveau de la pyramide de surveillance entre l’apparition et la notification d’une maladie. Incidence et mortalité (2) Approche 2 : « Enveloppe » des maladies • Utile lorsque les données disponibles issues de la surveillance de la santé publique ou d’autres bases de données ne sont pas spécifiques aux dangers. • Par exemple dans le cas d’agents pathogènes dont la déclaration n’est pas obligatoire, d’une surveillance de laboratoire moins bien établie ou de l’absence de données spécifiques aux étiologies. • Particulièrement utile pour la mortalité liée à la charge des maladies d’origine alimentaire. Résumé Cette approche part du nombre total de cas d’un syndrome (par exemple la diarrhée) que l’on multiplie par la proportion attribuable au danger étudié (par exemple Salmonella) pour obtenir l’incidence de la diarrhée associée au danger. Incidence et mortalité (3) Approche 3 : Évaluation des risques • Approche de référence pour les produits chimiques d’origine alimentaire. • Non recommandée pour les agents microbiologiques (en raison des exigences élevées en matière de données et de l’incertitude). Résumé Cette approche permet d’estimer l’exposition à un danger par toutes les voies de transmission potentielles et de la combiner à des modèles dose-réponse pour prédire l’incidence de la maladie. Incidence et mortalité (4) • Pour calculer l’incidence des effets sur la santé qui peuvent être associés à la maladie mais qui ne sont pas toujours présents chez un malade, l’estimation de l’incidence totale est combinée à la probabilité d’occurrence de chacun de ces effets. • Les probabilités sont généralement tirées de la littérature scientifique ou d’études pertinentes sur la charge de morbidité. Incidence d’autres effets sur la santé et des séquelles Une fois que toutes les données ont été collectées et organisées, le calcul des DALY est relativement simple : DALY = YLL + YLD Rappel • YLL est le produit du nombre de décès (M) et de l’espérance de vie moyenne restante (RLE) au moment du décès : YLL = M x RLE • YLD est le produit du nombre de cas incidents (N), de la durée moyenne jusqu’à la rémission ou le décès (D) et du poids de l’incapacité (DW) : YLD_inc = N x D x DW Calcul des DALY (1) Exemple Prenons le cas d’une patiente qui vit en parfaite santé jusqu’à ce qu’elle développe une légère polyarthrite rhumatoïde à l’âge de 40 ans. Cette maladie a un DW de 0,58 ; on suppose donc qu’elle entraîne une détérioration de l’état de santé de 58 %. Elle vit avec cette maladie pendant encore 20 ans, après quoi elle en décède. L’espérance de vie restante d’une femme de 60 ans est de 32,65 ans. Calcul des DALY (2) • Figure : représentation graphique du calcul des DALY • Dans les études visant à évaluer la charge d’une maladie en population, ces calculs sont effectués par strates d’âge et de sexe, puis additionnés. • Elle est liée à la qualité et à la représentativité des données, ainsi qu’aux spécifications et aux hypothèses utilisées dans la modélisation de la maladie. • Il est important de l’identifier et d’en tenir compte pour : • démontrer la solidité des données ; • permettre des comparaisons valables entre les études ; • faciliter l’application des connaissances ; • aider à identifier les lacunes en matière de connaissances et souligner la nécessité poursuivre la collecte des données et les activités de recherche. Incertitude • Dans la mesure du possible, les sources d’incertitude dans le calcul des DALY doivent être identifiées, quantifiées et analysées, et présentées par ordre d’importance. • Méthode utile : analyse de sensibilité probabiliste (également appelée analyse des incertitudes ou propagation des incertitudes) Diverses suites logicielles peuvent être utilisées, notamment : • des outils logiciels généraux, tels que Microsoft Excel ou R ; • des outils spécialement conçus pour calculer la charge des maladies, tels que DisMod, DisModII et DALY Calculator. Logiciels Estimation des DALY dues aux maladies d’origine alimentaire Attribution des sources 6 • Une fois que les DALY ont été estimées pour un agent pathogène donné, la proportion de la charge totale de la maladie qui est due à la transmission par les aliments doit être attribuée. • Certains agents pathogènes sont exclusivement d’origine alimentaire (par exemple Listeria monocytogenes, Taenia solium) • De nombreux agents pathogènes d’origine alimentaire utilisent également d’autres voies (par exemple l’environnement, le contact direct) • Il existe diverses approches, notamment les études épidémiologiques et les études utilisant des données issues de la surveillance des cas humains et animaux ou des aliments. • Le processus d’attribution des sources comporte deux étapes principales. Estimation des DALY dues aux maladies d’origine alimentaire Attribution des sources (1) Étape 1 : Estimer les proportions de la charge de la maladie qui peuvent être attribuées à la transmission par les aliments et à d’autres voies • Souvent, les méthodes fondées sur les données ne sont pas applicables (par exemple celles basées sur les données de surveillance et de contrôle). • En l’absence de données, les chercheurs s’appuient souvent sur les avis de groupes d’experts sur les maladies d’origine alimentaire, avec une modélisation de l’incertitude entourant les proportions obtenues. • Par exemple, les estimations de la charge mondiale des maladies (CMM) de l’OMS ont fait appel à une consultation structurée d’experts • Les pays qui ne disposent pas de telles estimations sont encouragés à utiliser les estimations du FERG pour leur sous-région comme indicateurs indirects. Estimation des DALY dues aux maladies d’origine alimentaire Attribution des sources (2) Étape 2 : Estimer les proportions de la charge de la maladie d’origine alimentaire qui peuvent être attribuées à des aliments particuliers en l’absence de données de surveillance • Cette étape peut aussi être réalisée en utilisant les moyens suivants : • consultation d’experts • méthodes fondées sur les données, comme l’analyse des données de sous-typage microbien • évaluations comparatives de l’exposition • analyse des données issues des enquêtes sur les épidémies • études cas-témoins Estimation des DALY dues aux maladies d’origine alimentaire Attribution des sources (3) Merci Actions multisectorielles dans les systèmes alimentaires Département Nutrition et sécurité sanitaire des aliments Courriel : fbd-burden@who.int WHO/HEP/NFS/AFS/2021.3 — © OMS 2021. Certains droits réservés. La présente publication est disponible sous la licence CC BY-NC-SA 3.0 IGO Modules d’apprentissage Étapes 1 à 4 : Module 1 Étapes 5 à 6 : Module 2 (présenté ici) Étapes 7 à 9 : Module 3